MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	TAA	2	6	5	10	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013129	TCT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013129	ATA	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013129	TAC	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013129	TAA	2	6	157	162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013129	TAA	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013129	AAG	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013129	TAT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013129	TCT	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013129	TCT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013129	TAT	2	6	514	519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013129	TTA	2	6	576	581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013129	ATA	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013129	TAA	2	6	1125	1130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013129	ATA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013129	CCT	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013129	TAA	2	6	1296	1301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013129	ATT	2	6	1306	1311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013129	TAA	2	6	1339	1344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013129	TAA	3	9	1346	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013129	ATT	2	6	1357	1362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013129	ATT	2	6	1384	1389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013129	AAT	3	9	1411	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013129	ATT	2	6	2937	2942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013129	AGA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013129	ATT	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013129	TAA	2	6	4361	4366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013129	TAA	2	6	4432	4437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013129	TAA	2	6	4461	4466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013129	ATT	2	6	4472	4477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013129	TAA	2	6	4478	4483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013129	TAT	2	6	5146	5151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013129	ATA	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013129	TTA	2	6	9338	9343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013129	TTA	2	6	11211	11216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013129	AGG	2	6	11275	11280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013129	AAT	2	6	11310	11315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013129	TAA	2	6	11408	11413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013129	AAT	2	6	11474	11479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013129	TAA	2	6	11489	11494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013129	TAA	2	6	11510	11515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013129	AAT	2	6	11549	11554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013129	TAT	2	6	11573	11578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013129	TTA	2	6	11579	11584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013129	TTA	2	6	11589	11594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013129	ACT	2	6	11720	11725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013129	AGG	2	6	14318	14323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013129	ATT	2	6	15324	15329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013129	ATA	2	6	15797	15802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013129	TTA	2	6	15827	15832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013129	GAA	2	6	15908	15913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013129	CAA	2	6	15972	15977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013129	GGT	2	6	15979	15984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013129	TAT	2	6	15994	15999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013129	ATT	2	6	16636	16641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013129	CCT	2	6	17280	17285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013129	TAT	2	6	17446	17451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013129	AAT	2	6	17610	17615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013129	AAG	2	6	17769	17774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013129	TTA	2	6	17868	17873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013129	AAC	2	6	17902	17907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013129	AAT	2	6	17966	17971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013129	TTA	2	6	18035	18040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013129	TAT	2	6	18045	18050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013129	ATT	2	6	20358	20363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013129	TAT	2	6	20387	20392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013129	TAT	2	6	20410	20415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013129	TTA	2	6	20577	20582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013129	TTA	2	6	20905	20910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013129	TTA	2	6	20914	20919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013129	ATA	2	6	20947	20952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013129	AAT	2	6	20964	20969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013129	AAT	2	6	21008	21013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013129	TTA	2	6	23306	23311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013129	CTG	3	9	23351	23359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013129	TTG	2	6	23375	23380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013129	AAG	2	6	23479	23484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013129	TTG	2	6	23496	23501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013129	AAT	2	6	23649	23654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013129	GAC	2	6	23722	23727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013129	TTA	2	6	23766	23771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013129	TAA	2	6	25361	25366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013129	ATA	3	9	25377	25385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013129	ATA	2	6	25411	25416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013129	ATT	2	6	27344	27349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013129	AAG	2	6	30040	30045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013129	AAT	2	6	35880	35885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013129	AGT	2	6	39577	39582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013129	TTC	2	6	39630	39635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013129	TAA	2	6	39793	39798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013129	TAA	2	6	41048	41053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013129	GTT	2	6	41054	41059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013129	TTA	2	6	41081	41086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013129	ATA	2	6	41090	41095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013129	CTT	2	6	41138	41143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013129	AGT	2	6	41158	41163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013129	TGA	2	6	41199	41204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013129	AAG	2	6	41277	41282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013129	TAA	2	6	41337	41342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013129	ATT	2	6	42002	42007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013129	ATT	2	6	42046	42051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013129	AAG	2	6	42201	42206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013129	TAA	2	6	42460	42465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013129	TAA	2	6	43547	43552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013129	AAG	2	6	43578	43583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013129	ATT	2	6	43640	43645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013129	TAA	2	6	44509	44514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013129	ATT	2	6	44533	44538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013129	CTT	2	6	44614	44619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013129	TAA	2	6	45944	45949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013129	TAA	2	6	46010	46015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013129	CTA	2	6	46067	46072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013129	TAT	2	6	46080	46085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013129	AAT	2	6	46240	46245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013129	TTA	2	6	46248	46253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013129	ATT	2	6	46275	46280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013129	TAT	2	6	46299	46304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013129	TTG	2	6	46320	46325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013129	GAA	2	6	46377	46382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013129	ATT	2	6	46417	46422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013129	ATA	3	9	47241	47249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013129	AAT	2	6	47262	47267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013129	ATT	3	9	47282	47290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013129	ATA	2	6	48283	48288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013129	ATA	4	12	48316	48327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013129	TTA	2	6	48328	48333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013129	TCT	2	6	48450	48455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013129	GAT	2	6	48540	48545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013129	GTT	2	6	48571	48576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013129	TAT	2	6	48590	48595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013129	GAA	2	6	48647	48652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013129	ATA	2	6	49409	49414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013129	ATT	3	9	49447	49455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013129	CCT	2	6	49518	49523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013129	ACC	2	6	49550	49555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013129	TAA	2	6	50575	50580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013129	TTA	2	6	50715	50720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013129	TAA	3	9	50769	50777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013129	TAT	2	6	50785	50790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013129	TTA	2	6	50841	50846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013129	ATA	2	6	50941	50946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013129	AAT	2	6	51771	51776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013129	TAA	2	6	51834	51839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013129	TAA	2	6	51928	51933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013129	TAA	2	6	52898	52903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013129	TTA	2	6	52908	52913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.