MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 5173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012815	T	6	6	294855	294860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_012815	GAC	2	6	294898	294903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_012815	GC	3	6	294930	294935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_012815	CG	3	6	294948	294953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_012815	ATT	2	6	295021	295026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_012815	TTTG	2	8	295038	295045	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012815	AGG	2	6	295150	295155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012815	CGCT	2	8	296250	296257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_012815	AGA	2	6	296391	296396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012815	AGCG	2	8	296477	296484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_012815	CCCG	2	8	297520	297527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1012	NC_012815	GC	3	6	297551	297556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_012815	GC	3	6	297574	297579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_012815	AGC	2	6	297720	297725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_012815	CGTTC	2	10	297797	297806	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1016	NC_012815	GGC	3	9	297815	297823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_012815	GCC	2	6	299034	299039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_012815	CCA	2	6	299131	299136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_012815	CATG	2	8	299150	299157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_012815	GCTGTT	2	12	299252	299263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1021	NC_012815	TTGC	2	8	300432	300439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_012815	CG	3	6	300445	300450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_012815	GGC	2	6	300455	300460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_012815	CGG	2	6	300503	300508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_012815	GTTT	2	8	300544	300551	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012815	GCGG	2	8	300569	300576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_012815	AGG	2	6	300586	300591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012815	CAA	2	6	300596	300601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_012815	AGCGT	2	10	302586	302595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1030	NC_012815	GGT	2	6	302598	302603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012815	CAC	2	6	302604	302609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_012815	GCT	2	6	303198	303203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_012815	CTC	2	6	303249	303254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_012815	TGG	3	9	303277	303285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012815	AAT	2	6	303286	303291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012815	TCA	2	6	303303	303308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_012815	CAT	2	6	303327	303332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_012815	TAG	2	6	304639	304644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012815	CG	3	6	307064	307069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_012815	GCC	2	6	310020	310025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_012815	GGC	2	6	310117	310122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_012815	GC	3	6	310121	310126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_012815	GGTT	2	8	310161	310168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_012815	AGA	3	9	310197	310205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012815	GTG	2	6	310293	310298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_012815	GTG	2	6	313180	313185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012815	CAGG	2	8	313608	313615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_012815	ACA	2	6	313744	313749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_012815	AGG	2	6	313750	313755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_012815	TGA	2	6	316215	316220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_012815	TGG	2	6	316237	316242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012815	TGT	2	6	316256	316261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_012815	TCG	2	6	316299	316304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_012815	G	6	6	316339	316344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012815	GAA	2	6	316382	316387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_012815	TGG	2	6	316400	316405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012815	TA	4	8	316479	316486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012815	TCT	2	6	316580	316585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_012815	GAA	2	6	316599	316604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012815	GCT	2	6	324706	324711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_012815	CTGT	2	8	324785	324792	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_012815	TGG	2	6	324870	324875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_012815	TGG	2	6	324897	324902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_012815	TGG	2	6	325130	325135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012815	ACAG	2	8	325161	325168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_012815	CAT	2	6	325261	325266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_012815	GCG	2	6	325325	325330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_012815	GTGG	2	8	326806	326813	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_012815	GT	4	8	328327	328334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_012815	CA	3	6	328365	328370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_012815	TG	3	6	331996	332001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_012815	CGTT	2	8	332007	332014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_012815	GGT	2	6	332026	332031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012815	GGT	2	6	332046	332051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_012815	GGT	2	6	332066	332071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012815	GGT	2	6	332086	332091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012815	GCAT	2	8	332143	332150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_012815	GCC	2	6	332151	332156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_012815	AGA	2	6	332175	332180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_012815	AAG	2	6	332240	332245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_012815	GC	3	6	333516	333521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_012815	TCTT	2	8	333637	333644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_012815	TAA	2	6	333711	333716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_012815	G	6	6	333817	333822	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012815	AG	3	6	333824	333829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012815	GGA	2	6	333885	333890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012815	TTC	2	6	336621	336626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_012815	CTT	2	6	336689	336694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_012815	GGC	2	6	336744	336749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_012815	TGG	2	6	336804	336809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012815	TCG	2	6	336810	336815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_012815	TCTG	2	8	336847	336854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_012815	TAG	2	6	336855	336860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012815	TCG	2	6	336861	336866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_012815	GC	3	6	336952	336957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_012815	GGT	2	6	336960	336965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_012815	TGC	2	6	337006	337011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_012815	CTGG	2	8	337064	337071	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_012815	GAC	2	6	337171	337176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_012815	GGGC	2	8	337229	337236	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_012815	AGAGA	2	10	337237	337246	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012815	AGAT	2	8	337286	337293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012815	GC	3	6	337298	337303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_012815	T	6	6	337404	337409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012815	CTG	2	6	337474	337479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_012815	AAG	2	6	337492	337497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012815	AAG	2	6	337501	337506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012815	AAG	2	6	337657	337662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012815	AGGG	2	8	337707	337714	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012815	CGCA	2	8	339398	339405	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_012815	GAC	2	6	342560	342565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_012815	TGAA	2	8	342569	342576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012815	GCAT	2	8	342606	342613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_012815	GTG	2	6	345290	345295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_012815	CTT	2	6	345341	345346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_012815	CAA	2	6	345400	345405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_012815	CGA	2	6	345437	345442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_012815	TTC	2	6	345449	345454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_012815	GCG	2	6	345545	345550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_012815	TG	3	6	346386	346391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012815	CG	3	6	346397	346402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_012815	AAT	2	6	346454	346459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012815	TGGG	2	8	346560	346567	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012815	GC	3	6	346608	346613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_012815	A	7	7	346616	346622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012815	TTCG	2	8	346874	346881	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_012815	CG	3	6	346930	346935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_012815	CTTG	2	8	347548	347555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_012815	CGC	2	6	347583	347588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_012815	CT	3	6	348322	348327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_012815	TGG	2	6	348866	348871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_012815	TGGC	2	8	348883	348890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_012815	ATGAG	2	10	348925	348934	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012815	CTGGG	2	10	348951	348960	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1135	NC_012815	AGG	2	6	349016	349021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_012815	CGC	2	6	349325	349330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_012815	CTGT	2	8	349334	349341	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1413	NC_012815	GCC	2	6	459257	459262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1414	NC_012815	CTT	2	6	459280	459285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_012815	GCC	2	6	462088	462093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1416	NC_012815	GCT	2	6	463207	463212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1418	NC_012815	CCA	2	6	463267	463272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1457	NC_012815	AGA	2	6	480880	480885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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