MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 5173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012815	CGG	2	6	1769182	1769187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_012815	CCA	2	6	1769246	1769251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_012815	GCC	2	6	1769279	1769284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_012815	ACT	2	6	1769296	1769301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_012815	CAC	2	6	1769337	1769342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_012815	AC	3	6	1769341	1769346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_012815	ACGA	2	8	1769366	1769373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4508	NC_012815	A	6	6	1769381	1769386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_012815	ACCCC	2	10	1769422	1769431	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4510	NC_012815	CGGG	2	8	1769434	1769441	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_012815	ACC	3	9	1769473	1769481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_012815	CCA	2	6	1769482	1769487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_012815	ACCC	2	8	1769492	1769499	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4514	NC_012815	AC	3	6	1769534	1769539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_012815	GGC	2	6	1769570	1769575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_012815	GCAC	2	8	1769590	1769597	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_012815	CACAC	2	10	1769598	1769607	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4518	NC_012815	GCG	2	6	1769643	1769648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_012815	AGG	2	6	1769727	1769732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_012815	C	6	6	1769808	1769813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4521	NC_012815	GT	3	6	1769869	1769874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_012815	ATG	2	6	1770064	1770069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_012815	TCC	2	6	1770090	1770095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4524	NC_012815	CGG	2	6	1770106	1770111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_012815	GCG	2	6	1770149	1770154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_012815	CACGA	2	10	1770191	1770200	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4527	NC_012815	GAC	3	9	1770204	1770212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_012815	CAC	2	6	1770217	1770222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_012815	TTC	2	6	1770291	1770296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_012815	CCG	2	6	1770324	1770329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_012815	CTC	2	6	1770508	1770513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_012815	TTC	2	6	1770555	1770560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_012815	GCCC	2	8	1770620	1770627	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4534	NC_012815	CGA	2	6	1770676	1770681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_012815	GCT	2	6	1770746	1770751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_012815	CTG	2	6	1770906	1770911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_012815	TGG	2	6	1770990	1770995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_012815	CAA	2	6	1771009	1771014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_012815	CCCAT	2	10	1771031	1771040	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4540	NC_012815	CCCAC	2	10	1771056	1771065	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4541	NC_012815	GGAGC	2	10	1771074	1771083	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4542	NC_012815	ACC	2	6	1771094	1771099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_012815	CGC	2	6	1771219	1771224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_012815	A	6	6	1771260	1771265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_012815	TAA	2	6	1771326	1771331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_012815	CA	3	6	1771343	1771348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_012815	A	6	6	1771348	1771353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_012815	CCAT	2	8	1771360	1771367	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_012815	CAT	2	6	1771422	1771427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_012815	GAC	2	6	1771432	1771437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_012815	AGT	2	6	1771486	1771491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_012815	ACC	3	9	1771517	1771525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_012815	AC	3	6	1771526	1771531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_012815	GCA	2	6	1771571	1771576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_012815	CCCA	2	8	1771600	1771607	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4556	NC_012815	ACCCC	2	10	1771612	1771621	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4557	NC_012815	CA	3	6	1771626	1771631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_012815	CAA	2	6	1771643	1771648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_012815	ACA	2	6	1771651	1771656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_012815	CCA	2	6	1771657	1771662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_012815	ACCA	2	8	1771689	1771696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_012815	CA	4	8	1771702	1771709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_012815	ACCA	2	8	1771715	1771722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_012815	CAC	2	6	1771723	1771728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_012815	CAC	2	6	1771741	1771746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_012815	CAA	2	6	1771752	1771757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_012815	ACAA	2	8	1771832	1771839	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4568	NC_012815	TCG	2	6	1773079	1773084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_012815	CAC	2	6	1773090	1773095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4570	NC_012815	GCG	2	6	1773150	1773155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_012815	CGAA	2	8	1773188	1773195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_012815	GCA	2	6	1773201	1773206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_012815	AAG	2	6	1773208	1773213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_012815	ATT	2	6	1774344	1774349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_012815	CATAT	2	10	1774350	1774359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4576	NC_012815	GAATA	2	10	1775678	1775687	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_012815	CAC	2	6	1777909	1777914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_012815	GT	3	6	1782539	1782544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_012815	CTC	2	6	1783442	1783447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_012815	TTGTA	2	10	1783463	1783472	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_012815	CAT	2	6	1783488	1783493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_012815	CATC	2	8	1785149	1785156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_012815	AAT	2	6	1785174	1785179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_012815	TCA	2	6	1785230	1785235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_012815	GTT	2	6	1785292	1785297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_012815	TGC	2	6	1785303	1785308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_012815	TCATA	2	10	1785309	1785318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4588	NC_012815	CGTGT	2	10	1785329	1785338	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4589	NC_012815	GTG	2	6	1785379	1785384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_012815	GAA	2	6	1785407	1785412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_012815	TCAG	2	8	1785414	1785421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_012815	GC	3	6	1785423	1785428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_012815	GAT	2	6	1785452	1785457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_012815	CA	3	6	1785458	1785463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_012815	ACG	2	6	1785488	1785493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_012815	GC	3	6	1785508	1785513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_012815	GCT	2	6	1785578	1785583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_012815	CGG	2	6	1785603	1785608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_012815	GC	4	8	1785616	1785623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_012815	ACA	2	6	1786571	1786576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_012815	GCA	2	6	1786628	1786633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_012815	AG	3	6	1786666	1786671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_012815	CAG	2	6	1786674	1786679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_012815	TC	3	6	1787302	1787307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_012815	GCTC	2	8	1787957	1787964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_012815	CTT	2	6	1792319	1792324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_012815	CG	3	6	1792409	1792414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_012815	TTCG	2	8	1792436	1792443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4609	NC_012815	TTG	2	6	1794508	1794513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_012815	GGA	2	6	1794542	1794547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_012815	TCC	2	6	1794620	1794625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_012815	CTC	2	6	1799231	1799236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_012815	GGCC	2	8	1799334	1799341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_012815	GCG	2	6	1801170	1801175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_012815	GAC	2	6	1801341	1801346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_012815	CCA	2	6	1801360	1801365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_012815	TGT	2	6	1801379	1801384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_012815	TACT	2	8	1801442	1801449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4619	NC_012815	GC	3	6	1804927	1804932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4620	NC_012815	CGT	2	6	1804978	1804983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_012815	GC	3	6	1805069	1805074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_012815	GCC	2	6	1805083	1805088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_012815	CACC	2	8	1805103	1805110	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4624	NC_012815	TCG	2	6	1806073	1806078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_012815	CCGCA	2	10	1806129	1806138	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4626	NC_012815	TCCC	2	8	1806160	1806167	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4627	NC_012815	CG	3	6	1806229	1806234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_012815	CA	3	6	1806282	1806287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_012815	GC	3	6	1808512	1808517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_012815	GAA	2	6	1808538	1808543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_012815	ACA	2	6	1808577	1808582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_012815	CCG	2	6	1808595	1808600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4633	NC_012815	CCGC	2	8	1809667	1809674	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4634	NC_012815	CCTTTG	2	12	1809677	1809688	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4751	NC_012815	AGGA	2	8	1851044	1851051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4754	NC_012815	TCT	2	6	1853014	1853019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4755	NC_012815	TCGTG	2	10	1853035	1853044	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4757	NC_012815	CGCC	2	8	1853189	1853196	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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