MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bl-04 chromosome

Total Repeats: 767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012814	AGGA	2	8	3645	3652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012814	CTGC	2	8	11473	11480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012814	CGCA	2	8	11481	11488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012814	TGCA	2	8	13668	13675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012814	GTTG	2	8	13879	13886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012814	CCTC	2	8	15392	15399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_012814	TGCA	2	8	18222	18229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012814	ATGT	2	8	19468	19475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012814	AGAA	2	8	19856	19863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012814	GGTG	2	8	19923	19930	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012814	ATTC	2	8	19931	19938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012814	TGAC	2	8	21710	21717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012814	GCAT	2	8	23016	23023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012814	TTTC	2	8	23043	23050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012814	CCAA	2	8	23236	23243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012814	CCGA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012814	ATGC	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012814	AAGG	2	8	28125	28132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012814	ACTG	2	8	28379	28386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012814	GCTT	2	8	29053	29060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012814	GTTT	2	8	29994	30001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012814	GTTT	2	8	34200	34207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012814	AATT	2	8	34339	34346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012814	TGTC	2	8	36971	36978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012814	CGCA	2	8	42911	42918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012814	GGTC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012814	GATT	2	8	44113	44120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012814	AGAA	2	8	44644	44651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012814	TGCT	2	8	45948	45955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012814	TGAA	2	8	50378	50385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012814	CAAT	2	8	50520	50527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012814	GGTA	2	8	51056	51063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012814	ATCG	2	8	55313	55320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012814	TACG	2	8	60419	60426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012814	CAAA	2	8	61992	61999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012814	TCGC	2	8	64033	64040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012814	AAGG	2	8	65509	65516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012814	GGTC	2	8	66895	66902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012814	GGGC	2	8	71414	71421	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012814	TTCC	2	8	73037	73044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012814	TGCG	2	8	81707	81714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012814	TATC	2	8	85922	85929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012814	GTCT	2	8	89939	89946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012814	GCCA	2	8	89987	89994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012814	AGCG	2	8	92722	92729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012814	CTTC	2	8	92765	92772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012814	TGCC	2	8	92921	92928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012814	TGCC	2	8	111542	111549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012814	CCCG	2	8	112118	112125	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_012814	AGCT	2	8	116080	116087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012814	TTGC	2	8	116156	116163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012814	CATG	2	8	127416	127423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012814	GCTG	2	8	127516	127523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012814	TGCA	2	8	131348	131355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012814	TGTT	2	8	138033	138040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012814	CGTG	2	8	143580	143587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012814	GGCC	2	8	143787	143794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012814	CATG	2	8	143987	143994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012814	CAGA	2	8	157823	157830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012814	GGGA	2	8	164220	164227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012814	GCGT	2	8	164398	164405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012814	TGAG	2	8	164640	164647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012814	AGAA	2	8	164801	164808	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012814	ATCT	2	8	166319	166326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012814	GCGT	2	8	166434	166441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012814	GCAT	2	8	167728	167735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012814	GTTT	2	8	167877	167884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012814	GCAT	2	8	168159	168166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012814	GGGT	2	8	170294	170301	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012814	CTTT	2	8	171746	171753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012814	GCGG	2	8	171896	171903	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012814	AGTA	2	8	171949	171956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012814	AATG	2	8	171957	171964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012814	TGCT	2	8	176872	176879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012814	AGTG	2	8	177647	177654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012814	CTTG	2	8	179695	179702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012814	TAAG	2	8	179824	179831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012814	CGGT	2	8	183514	183521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012814	TGAA	2	8	192659	192666	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012814	GTAA	2	8	192681	192688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012814	GATA	2	8	195355	195362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012814	GCAA	2	8	201552	201559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012814	AAAC	2	8	201977	201984	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012814	ACGG	2	8	203401	203408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012814	TGGT	2	8	203564	203571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012814	CGGT	2	8	203844	203851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012814	GGCG	2	8	211196	211203	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012814	ATGA	2	8	215487	215494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012814	ATTC	2	8	217230	217237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012814	CACG	2	8	223494	223501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012814	TGCA	2	8	223711	223718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012814	TCAT	2	8	225748	225755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012814	AGGC	2	8	227744	227751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012814	AGGG	2	8	232893	232900	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012814	TTGT	2	8	234697	234704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012814	CCGG	2	8	235097	235104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012814	GGGC	2	8	239755	239762	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012814	CGTC	2	8	243800	243807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012814	GGCA	2	8	245153	245160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012814	GACA	2	8	249340	249347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012814	CGGT	2	8	251091	251098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012814	GTTC	2	8	251130	251137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012814	GCCG	2	8	254387	254394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012814	GCCG	2	8	256972	256979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012814	CTGG	2	8	257004	257011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012814	TGAC	2	8	266770	266777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012814	TCCC	2	8	271023	271030	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_012814	CCAT	2	8	274197	274204	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012814	TGAT	2	8	274930	274937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012814	AGGG	2	8	275033	275040	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012814	GCTT	2	8	276828	276835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012814	GCGG	2	8	277015	277022	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012814	TTCG	2	8	278014	278021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012814	GCGG	2	8	278068	278075	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012814	GAAA	2	8	278314	278321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012814	CGGA	2	8	279469	279476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012814	AAAG	2	8	281169	281176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012814	GGCT	2	8	284623	284630	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012814	TGAG	2	8	285027	285034	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012814	TGGC	2	8	286757	286764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012814	ATGT	2	8	286946	286953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012814	GACA	2	8	288090	288097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012814	AGCG	2	8	288113	288120	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012814	TACC	2	8	290407	290414	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012814	ACTC	2	8	291165	291172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012814	ATGA	2	8	291270	291277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012814	TGAA	2	8	291281	291288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012814	AGGA	2	8	291612	291619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012814	GCGG	2	8	293152	293159	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012814	TGCT	2	8	294690	294697	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012814	TTTG	2	8	295037	295044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012814	CGCT	2	8	296249	296256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012814	AGCG	2	8	296476	296483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012814	CCCG	2	8	297519	297526	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_012814	CATG	2	8	299149	299156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012814	TTGC	2	8	300431	300438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012814	GTTT	2	8	300543	300550	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012814	GCGG	2	8	300568	300575	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_012814	GGTT	2	8	310160	310167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012814	CAGG	2	8	313607	313614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012814	CTGT	2	8	324784	324791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012814	ACAG	2	8	325160	325167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_012814	GTGG	2	8	326805	326812	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012814	CGTT	2	8	332006	332013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012814	GCAT	2	8	332142	332149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012814	TCTT	2	8	333636	333643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012814	TCTG	2	8	336846	336853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_012814	CTGG	2	8	337063	337070	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012814	GGGC	2	8	337228	337235	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012814	AGAT	2	8	337285	337292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012814	AGGG	2	8	337706	337713	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012814	CGCA	2	8	339397	339404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_012814	TGAA	2	8	342568	342575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012814	GCAT	2	8	342605	342612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_012814	TGGG	2	8	346559	346566	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012814	TTCG	2	8	346873	346880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_012814	CTTG	2	8	347547	347554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_012814	TGGC	2	8	348882	348889	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_012814	CTGT	2	8	349333	349340	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_012814	TTCG	2	8	352930	352937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_012814	GCTG	2	8	360505	360512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_012814	GGTC	2	8	360575	360582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
163	NC_012814	GCGG	2	8	361245	361252	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
164	NC_012814	GTTT	2	8	365562	365569	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012814	GCAC	2	8	366630	366637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
166	NC_012814	TGCA	2	8	366665	366672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_012814	CTGG	2	8	366685	366692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
168	NC_012814	ATGC	2	8	366714	366721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_012814	GTCT	2	8	368041	368048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_012814	GGGA	2	8	368194	368201	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012814	CGGG	2	8	371684	371691	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
172	NC_012814	TGCG	2	8	371931	371938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
173	NC_012814	TCGG	2	8	372381	372388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
174	NC_012814	TTGA	2	8	372581	372588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012814	CGTG	2	8	372608	372615	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_012814	AGTG	2	8	375198	375205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012814	TGCA	2	8	377696	377703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_012814	AGAA	2	8	379515	379522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_012814	TGCT	2	8	380747	380754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_012814	ATGT	2	8	399973	399980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_012814	GACA	2	8	402762	402769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
184	NC_012814	TGCG	2	8	402891	402898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
185	NC_012814	TTCC	2	8	409629	409636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_012814	TGGG	2	8	409645	409652	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012814	TGCG	2	8	409746	409753	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
188	NC_012814	CGGT	2	8	410937	410944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
189	NC_012814	TGGG	2	8	412740	412747	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
190	NC_012814	GGAA	2	8	419555	419562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
191	NC_012814	GCCG	2	8	420827	420834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
192	NC_012814	TTGG	2	8	427025	427032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_012814	AGGA	2	8	434199	434206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
196	NC_012814	GCTC	2	8	435327	435334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
197	NC_012814	GGTG	2	8	435478	435485	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
198	NC_012814	AGGC	2	8	440751	440758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
199	NC_012814	GCGA	2	8	441663	441670	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
200	NC_012814	TTAA	2	8	441747	441754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_012814	GCCG	2	8	444985	444992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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203	NC_012814	AGGG	2	8	452668	452675	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
204	NC_012814	TCTG	2	8	452908	452915	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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219	NC_012814	AGGC	2	8	498609	498616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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221	NC_012814	CGGG	2	8	516447	516454	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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230	NC_012814	CAAA	2	8	552249	552256	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
231	NC_012814	GCGG	2	8	564489	564496	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
232	NC_012814	TGTC	2	8	566816	566823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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236	NC_012814	CGTG	2	8	571515	571522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
237	NC_012814	CGGC	2	8	571631	571638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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242	NC_012814	GACA	2	8	595691	595698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
243	NC_012814	TGCA	2	8	596664	596671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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252	NC_012814	GCAA	2	8	609133	609140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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282	NC_012814	ATTT	2	8	680912	680919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_012814	CAGT	2	8	731654	731661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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445	NC_012814	GCAT	2	8	1233697	1233704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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488	NC_012814	TGAT	2	8	1356859	1356866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_012814	ACCA	2	8	1366992	1366999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_012814	ATGT	2	8	1384270	1384277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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