MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 chromosome 1

Total Repeats: 20064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20001	NC_012724	CACG	2	8	3897686	3897693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20002	NC_012724	GCG	2	6	3897696	3897701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20003	NC_012724	CGTG	2	8	3897715	3897722	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20004	NC_012724	CGG	2	6	3897725	3897730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20005	NC_012724	CG	3	6	3897766	3897771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20006	NC_012724	GGC	2	6	3897813	3897818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20007	NC_012724	TCG	2	6	3897841	3897846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20008	NC_012724	GCG	2	6	3897856	3897861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20009	NC_012724	GCG	2	6	3897880	3897885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20010	NC_012724	ACC	2	6	3897901	3897906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20011	NC_012724	CGT	2	6	3897920	3897925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20012	NC_012724	GC	3	6	3897951	3897956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20013	NC_012724	CGGC	2	8	3897968	3897975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20014	NC_012724	CG	3	6	3897982	3897987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20015	NC_012724	TCGA	2	8	3898023	3898030	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20016	NC_012724	GCCG	2	8	3898071	3898078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20017	NC_012724	GGC	2	6	3898110	3898115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20018	NC_012724	TTC	2	6	3898165	3898170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20019	NC_012724	CGT	2	6	3898191	3898196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20020	NC_012724	ACG	2	6	3898271	3898276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20021	NC_012724	GCC	2	6	3898340	3898345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20022	NC_012724	ACA	2	6	3898360	3898365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20023	NC_012724	CGC	2	6	3898461	3898466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20024	NC_012724	CGC	2	6	3898531	3898536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20025	NC_012724	CAT	2	6	3898712	3898717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20026	NC_012724	ATG	2	6	3898722	3898727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20027	NC_012724	AAC	2	6	3898761	3898766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20028	NC_012724	GCTC	2	8	3898815	3898822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20029	NC_012724	CAGG	2	8	3898835	3898842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20030	NC_012724	CTT	2	6	3898951	3898956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20031	NC_012724	AAC	2	6	3899028	3899033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20032	NC_012724	TCA	2	6	3900234	3900239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20033	NC_012724	ATG	2	6	3900285	3900290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20034	NC_012724	TTGG	2	8	3900359	3900366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20035	NC_012724	GGA	2	6	3901805	3901810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20036	NC_012724	CGC	2	6	3901849	3901854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20037	NC_012724	CGC	2	6	3901903	3901908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20038	NC_012724	AGG	2	6	3902033	3902038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20039	NC_012724	CAAC	2	8	3902043	3902050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20040	NC_012724	GATA	2	8	3902069	3902076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20041	NC_012724	CGC	2	6	3902574	3902579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20042	NC_012724	GCT	2	6	3902586	3902591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20043	NC_012724	CG	3	6	3902601	3902606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20044	NC_012724	CGAT	2	8	3902608	3902615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20045	NC_012724	GGC	2	6	3902620	3902625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20046	NC_012724	CCG	2	6	3902681	3902686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20047	NC_012724	GCCC	2	8	3902791	3902798	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20048	NC_012724	TGGTT	2	10	3902874	3902883	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20049	NC_012724	GGC	2	6	3902930	3902935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20050	NC_012724	CG	3	6	3903404	3903409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20051	NC_012724	GCCG	3	12	3903416	3903427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20052	NC_012724	CG	4	8	3903426	3903433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20053	NC_012724	GCC	2	6	3903456	3903461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20054	NC_012724	A	6	6	3903469	3903474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20055	NC_012724	CGG	2	6	3903519	3903524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20056	NC_012724	GGC	2	6	3903527	3903532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20057	NC_012724	GCC	2	6	3903538	3903543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20058	NC_012724	CG	3	6	3903548	3903553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20059	NC_012724	CG	3	6	3905509	3905514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20060	NC_012724	GGCC	2	8	3905524	3905531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20061	NC_012724	CG	3	6	3906347	3906352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20062	NC_012724	CCG	2	6	3906366	3906371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20063	NC_012724	ACG	2	6	3906387	3906392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20064	NC_012724	CGC	2	6	3906465	3906470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.