MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_1p

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012723	TCGA	2	8	65	72	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012723	TTGG	2	8	2120	2127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012723	TCGC	2	8	2245	2252	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012723	TATC	2	8	7164	7171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012723	TCGA	2	8	8208	8215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012723	GGGT	2	8	10891	10898	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012723	GCTT	2	8	12239	12246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012723	CCCG	2	8	12299	12306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_012723	CCGC	2	8	14690	14697	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_012723	ATCG	2	8	15161	15168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012723	AGGC	2	8	15401	15408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012723	CCAG	2	8	15593	15600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012723	GGCT	2	8	15654	15661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012723	CATC	2	8	16101	16108	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012723	CGAG	2	8	16352	16359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012723	CCTT	2	8	17419	17426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012723	TCGC	2	8	17634	17641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012723	CTTT	2	8	19534	19541	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012723	CGGA	2	8	23344	23351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012723	ATCA	2	8	23352	23359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012723	GAAT	2	8	23536	23543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012723	ATCG	2	8	29038	29045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012723	AGCG	2	8	29187	29194	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012723	CAGC	2	8	29313	29320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012723	ACGG	2	8	29845	29852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012723	GGTG	2	8	33095	33102	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012723	TCGC	2	8	33973	33980	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012723	CGAC	2	8	35980	35987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012723	CCAA	2	8	36352	36359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012723	CCAC	2	8	36427	36434	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_012723	CGGG	2	8	36601	36608	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012723	TATC	2	8	38279	38286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012723	ATTA	2	8	38438	38445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012723	GGTA	2	8	40660	40667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012723	CAGG	2	8	40692	40699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012723	AAGC	2	8	45052	45059	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012723	ATTT	2	8	45765	45772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012723	GCCT	2	8	46312	46319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012723	TCGT	2	8	46526	46533	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012723	TGCC	2	8	48277	48284	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012723	GAAA	2	8	50619	50626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012723	AGCG	2	8	50762	50769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012723	GAAC	2	8	50854	50861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012723	CGCT	2	8	52628	52635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012723	TCGG	2	8	52695	52702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012723	CATC	2	8	52743	52750	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012723	CCTT	2	8	55769	55776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012723	CACC	2	8	56944	56951	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_012723	GGCC	2	8	56956	56963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012723	CAGC	2	8	58150	58157	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012723	CTGG	2	8	58192	58199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012723	GTGG	2	8	58228	58235	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012723	GATC	2	8	60912	60919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012723	GGCG	2	8	61138	61145	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012723	GCCG	2	8	65259	65266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012723	ACCA	2	8	65297	65304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012723	GCCC	2	8	65970	65977	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_012723	CCGA	2	8	66299	66306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012723	CAGC	2	8	66431	66438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012723	TTCA	2	8	66600	66607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012723	GCTC	2	8	67847	67854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012723	TTTC	2	8	68092	68099	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012723	GGCT	2	8	73272	73279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012723	GTCG	2	8	73297	73304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012723	CCCG	2	8	73480	73487	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_012723	AACC	2	8	73552	73559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012723	CAAA	2	8	77229	77236	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012723	CGAC	2	8	78570	78577	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012723	GCTG	2	8	78631	78638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012723	TGGC	2	8	78708	78715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012723	CTGG	2	8	80003	80010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012723	AATA	2	8	81143	81150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012723	GAAA	2	8	81296	81303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012723	GTTT	2	8	81445	81452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012723	CGAG	2	8	84064	84071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012723	GGTT	2	8	84105	84112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012723	TGTA	2	8	85166	85173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012723	GATA	2	8	85819	85826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012723	CGGC	2	8	85840	85847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012723	AGCG	2	8	85988	85995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012723	AGAC	2	8	86454	86461	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012723	GGCG	2	8	86801	86808	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012723	GGTC	2	8	87008	87015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012723	CAGG	2	8	87056	87063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012723	GGGC	2	8	87152	87159	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012723	AGCG	2	8	87835	87842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012723	TCGC	2	8	90112	90119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012723	TGCT	2	8	90186	90193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012723	GAGC	2	8	90648	90655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012723	TGAT	2	8	93396	93403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012723	GGAT	2	8	93630	93637	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012723	ACCC	2	8	95096	95103	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_012723	CACG	2	8	97581	97588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012723	GCTG	2	8	97713	97720	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012723	CGTG	2	8	97953	97960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012723	CGGC	2	8	98005	98012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012723	GGAG	2	8	98131	98138	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012723	CCGG	2	8	98220	98227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012723	CGGT	2	8	98360	98367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012723	ACGA	2	8	99323	99330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012723	CGGG	2	8	100846	100853	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012723	CGTC	2	8	101593	101600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012723	GGCA	2	8	101610	101617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012723	GGCG	2	8	101736	101743	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012723	CTCG	2	8	101862	101869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012723	CCTA	2	8	106088	106095	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012723	GGGC	2	8	112059	112066	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012723	GCGA	2	8	112443	112450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012723	CAGA	2	8	112936	112943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012723	CCGA	2	8	113033	113040	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012723	CGGT	2	8	115144	115151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012723	CCGC	2	8	115268	115275	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_012723	GCTT	2	8	115999	116006	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012723	GCAA	2	8	116308	116315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012723	CCCA	2	8	116325	116332	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_012723	CCAG	2	8	116420	116427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012723	GTCG	2	8	116499	116506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012723	CGAC	2	8	117086	117093	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012723	GAGC	2	8	123300	123307	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012723	CGGC	2	8	123365	123372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012723	GACG	2	8	123498	123505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012723	TCAC	2	8	124067	124074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012723	GCCC	2	8	129450	129457	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_012723	CCCG	2	8	129486	129493	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_012723	GGCC	2	8	130028	130035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012723	GACG	2	8	131315	131322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012723	TTGC	2	8	132728	132735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012723	GCAG	2	8	132816	132823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.