MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_3p

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012720	AATAC	2	10	7	16	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012720	TGTGG	2	10	2008	2017	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012720	AGGGA	2	10	4556	4565	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012720	TCTCG	2	10	24497	24506	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012720	TGCGG	2	10	36350	36359	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012720	TACGG	2	10	43066	43075	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012720	TGCGC	2	10	43150	43159	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012720	TCGGT	2	10	62855	62864	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012720	CAGCG	2	10	62898	62907	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012720	AAGCG	2	10	66377	66386	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012720	GGGAT	2	10	69195	69204	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012720	GGCGG	2	10	69278	69287	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012720	CGGGG	2	10	71560	71569	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012720	GGAAG	2	10	73113	73122	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012720	GGGGC	2	10	73876	73885	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012720	GGTTG	2	10	75258	75267	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012720	GCCGA	2	10	75516	75525	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_012720	GCCCG	2	10	75797	75806	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_012720	CTGAA	2	10	83606	83615	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012720	TCAGA	2	10	84108	84117	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012720	GCCAT	2	10	94184	94193	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_012720	GCGCC	2	10	101198	101207	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_012720	GCCGG	2	10	101288	101297	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012720	CGGCG	2	10	101523	101532	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012720	CCCCG	2	10	101681	101690	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
26	NC_012720	GCCCC	2	10	102396	102405	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
27	NC_012720	ATCGT	2	10	106023	106032	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012720	AAATT	2	10	120445	120454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012720	TTCAG	2	10	122297	122306	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012720	TAAGA	2	10	124572	124581	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012720	GAATA	2	10	124872	124881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012720	GATTA	2	10	125221	125230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012720	CTTTG	2	10	125547	125556	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012720	GAACT	2	10	126215	126224	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012720	TCGAG	2	10	127683	127692	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012720	CCCCG	2	10	127861	127870	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
37	NC_012720	CGGGG	2	10	128081	128090	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012720	CGCGT	2	10	136767	136776	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_012720	GCCGG	2	10	137835	137844	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012720	AGCCG	2	10	138082	138091	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.