MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_3p

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012720	GGGC	2	8	1960	1967	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012720	GGCG	2	8	2036	2043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012720	AGTG	2	8	2058	2065	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012720	GACC	2	8	2095	2102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012720	GACC	2	8	2128	2135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012720	GAAG	2	8	2485	2492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012720	TACC	2	8	3575	3582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012720	CAAG	2	8	3763	3770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012720	GCCC	2	8	4293	4300	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_012720	TAGA	2	8	4332	4339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012720	GCCT	2	8	4424	4431	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012720	GCCG	2	8	5568	5575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012720	GTCA	2	8	5636	5643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012720	CCTG	2	8	11921	11928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012720	AGAT	2	8	13532	13539	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012720	CTGT	2	8	13581	13588	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012720	ATCG	2	8	13679	13686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012720	GCAC	2	8	13733	13740	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012720	GAAA	2	8	13995	14002	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012720	GGGC	2	8	17294	17301	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012720	GCAG	2	8	30061	30068	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012720	TGAT	2	8	30479	30486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012720	CTTA	2	8	42108	42115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012720	GGAC	2	8	43407	43414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012720	TCCA	2	8	48510	48517	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012720	GCTG	2	8	55807	55814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012720	CCGT	2	8	61919	61926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012720	GATT	2	8	62007	62014	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012720	CAGC	2	8	62402	62409	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012720	GGTT	2	8	62804	62811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012720	CTGG	2	8	63097	63104	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012720	GCCG	2	8	63143	63150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012720	CTGG	2	8	63277	63284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012720	CTGG	2	8	63457	63464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012720	GCCG	2	8	63503	63510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012720	CTGG	2	8	63637	63644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012720	GCCG	2	8	63683	63690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012720	TCGT	2	8	63769	63776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012720	CTGG	2	8	63817	63824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012720	GCCG	2	8	63863	63870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012720	CTGG	2	8	63997	64004	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012720	GCCG	2	8	64043	64050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012720	GGGA	2	8	64175	64182	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012720	AGCG	2	8	65208	65215	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012720	TGGA	2	8	65330	65337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012720	CGGC	2	8	66153	66160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012720	GACC	2	8	66259	66266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012720	GCCG	2	8	66676	66683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012720	CGGC	2	8	69780	69787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012720	CGGC	2	8	69796	69803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012720	CGGC	2	8	70058	70065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012720	CGGG	2	8	71491	71498	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012720	GCCG	2	8	71645	71652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012720	CGGC	2	8	73019	73026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012720	ACGG	2	8	73083	73090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012720	TGCC	2	8	75201	75208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012720	TTCG	2	8	75300	75307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012720	CGGC	2	8	75414	75421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012720	GCCG	2	8	75966	75973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012720	GCCG	2	8	75989	75996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012720	ACGG	2	8	76030	76037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012720	GCGG	2	8	76125	76132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012720	CGGC	2	8	76288	76295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012720	CGAA	2	8	76412	76419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012720	TAGA	2	8	77057	77064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012720	GCCG	2	8	77160	77167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012720	TCTT	2	8	78776	78783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012720	CGGC	2	8	83967	83974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012720	CCTG	2	8	83998	84005	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012720	TCGC	2	8	84210	84217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012720	GCCA	2	8	84229	84236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012720	GATA	2	8	84678	84685	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012720	CTTT	2	8	87027	87034	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012720	CGAA	2	8	87144	87151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012720	GGGC	2	8	87215	87222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012720	CAGC	2	8	89376	89383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012720	TCCG	2	8	89462	89469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012720	CCTT	2	8	93489	93496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012720	GCTC	2	8	93966	93973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012720	AGCG	2	8	94047	94054	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012720	TGGG	2	8	96146	96153	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012720	CCAG	2	8	96162	96169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012720	CAGC	2	8	96544	96551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012720	TGCC	2	8	97248	97255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012720	CCTC	2	8	97311	97318	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_012720	TGAG	2	8	97473	97480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012720	GCTC	2	8	97818	97825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012720	GTGG	2	8	100983	100990	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012720	GTGC	2	8	101085	101092	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012720	CGGC	2	8	101237	101244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012720	GCGT	2	8	101485	101492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012720	CGGC	2	8	101705	101712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012720	TCGA	2	8	101869	101876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012720	CGGC	2	8	101963	101970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012720	CGGC	2	8	102416	102423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012720	ACCG	2	8	102687	102694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012720	GCCG	2	8	102904	102911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012720	CAAG	2	8	102979	102986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012720	GCCG	2	8	103157	103164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012720	CGGC	2	8	103344	103351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012720	GGCT	2	8	105977	105984	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012720	ATCC	2	8	106987	106994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012720	CCAA	2	8	107203	107210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012720	GGCA	2	8	110674	110681	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012720	TCGC	2	8	113564	113571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012720	GCCC	2	8	121816	121823	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_012720	GCCG	2	8	121938	121945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012720	TGGT	2	8	124247	124254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012720	CCAA	2	8	124356	124363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012720	TGCG	2	8	124461	124468	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012720	CTGT	2	8	124665	124672	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012720	TCGG	2	8	125423	125430	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012720	GCAA	2	8	126122	126129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012720	GTAG	2	8	126152	126159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012720	TCCG	2	8	126480	126487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012720	AGCG	2	8	126655	126662	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012720	AACG	2	8	126927	126934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012720	GCTA	2	8	127126	127133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012720	GCTC	2	8	127292	127299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012720	GAAA	2	8	127307	127314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012720	CTTC	2	8	127806	127813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012720	CGGC	2	8	128186	128193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012720	CGAG	2	8	128561	128568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012720	ATTG	2	8	130900	130907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012720	CAAC	2	8	130928	130935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012720	CGCT	2	8	132695	132702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012720	GCCC	2	8	136834	136841	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_012720	CCCG	2	8	136870	136877	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_012720	TGGA	2	8	137880	137887	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012720	CGCC	2	8	137977	137984	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_012720	TTCG	2	8	138407	138414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_012720	TCGC	2	8	139894	139901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012720	CCGC	2	8	140151	140158	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_012720	ATCC	2	8	140809	140816	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.