MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_2p

Total Repeats: 418

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012718	CAC	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_012718	CGG	2	6	2488	2493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012718	CGA	2	6	2495	2500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012718	CTG	2	6	2645	2650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012718	CTC	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012718	ATC	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012718	GCA	2	6	4135	4140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012718	AAG	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012718	TCA	2	6	4276	4281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012718	GAC	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012718	CCG	2	6	4400	4405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012718	CGA	2	6	4411	4416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012718	GAC	2	6	4425	4430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012718	CGC	2	6	4656	4661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_012718	TTG	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012718	CAG	2	6	4741	4746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012718	CGC	2	6	4927	4932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_012718	GAA	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012718	CGG	3	9	5023	5031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012718	ACC	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_012718	TCT	2	6	5089	5094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012718	CCG	2	6	5106	5111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_012718	TGC	2	6	5166	5171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012718	TGC	2	6	5208	5213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012718	CGC	2	6	5215	5220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_012718	GCG	2	6	5282	5287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012718	GCC	2	6	5291	5296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_012718	GTG	2	6	5344	5349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012718	CGG	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012718	GTT	2	6	6451	6456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012718	CAG	2	6	6566	6571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012718	ATC	2	6	6680	6685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012718	GAC	2	6	6720	6725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012718	GTT	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012718	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012718	CGC	2	6	6948	6953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_012718	TCA	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012718	AGG	2	6	7259	7264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012718	TCG	2	6	7293	7298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012718	GAT	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012718	CCG	2	6	7719	7724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_012718	GGC	2	6	7730	7735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012718	CAC	2	6	7794	7799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012718	GGC	2	6	7846	7851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012718	CGC	2	6	7929	7934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012718	GCC	2	6	7945	7950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_012718	ACG	2	6	7964	7969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012718	CCG	2	6	8036	8041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_012718	CGT	2	6	8063	8068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012718	GTG	2	6	8100	8105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012718	CTG	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012718	TGC	2	6	8113	8118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012718	GCC	2	6	8208	8213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012718	TCG	2	6	11287	11292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012718	GTT	2	6	11325	11330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012718	GAA	2	6	11999	12004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012718	CGG	2	6	12177	12182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012718	TGC	2	6	12226	12231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012718	TGC	2	6	12352	12357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012718	TAA	2	6	13026	13031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012718	TTG	2	6	13084	13089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012718	ACA	2	6	13127	13132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012718	AGG	2	6	13211	13216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012718	GAG	2	6	13982	13987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012718	CTC	2	6	14021	14026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_012718	GCC	2	6	14039	14044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_012718	ATC	2	6	15419	15424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012718	CAG	2	6	15465	15470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012718	ACC	2	6	15566	15571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012718	GCC	2	6	15681	15686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012718	GCA	2	6	17089	17094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012718	ACT	2	6	17254	17259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012718	CGA	2	6	17312	17317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012718	AGC	2	6	17359	17364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012718	CGC	2	6	17393	17398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012718	TCC	2	6	17839	17844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_012718	GGC	2	6	17989	17994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012718	GGC	2	6	18025	18030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012718	CAT	2	6	18102	18107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012718	CGA	3	9	18202	18210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012718	ACC	2	6	18215	18220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012718	TGC	2	6	18222	18227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012718	CCA	2	6	18287	18292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012718	GTA	2	6	18418	18423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012718	GAC	2	6	18424	18429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012718	GTA	2	6	18495	18500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012718	TGC	2	6	20930	20935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012718	AGG	2	6	20970	20975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012718	ACG	2	6	22691	22696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012718	GAA	2	6	22712	22717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012718	TTA	2	6	22734	22739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012718	CGG	2	6	22780	22785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012718	GTT	2	6	24654	24659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012718	TCA	2	6	24726	24731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012718	CGA	2	6	24816	24821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012718	ATC	2	6	24823	24828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012718	CCA	2	6	24864	24869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012718	AGC	2	6	24917	24922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012718	TGG	2	6	25040	25045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012718	GCG	2	6	25048	25053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012718	GAG	2	6	25086	25091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012718	CAA	2	6	25260	25265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012718	GGC	2	6	27025	27030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012718	GCG	2	6	27053	27058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012718	TCG	2	6	28857	28862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012718	CAA	2	6	28866	28871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012718	ACG	2	6	30317	30322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012718	CAA	2	6	30367	30372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012718	GCC	2	6	32089	32094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_012718	GAA	2	6	32201	32206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012718	GCG	2	6	32276	32281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012718	GCG	2	6	32290	32295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012718	CAG	2	6	32365	32370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012718	GTT	2	6	32439	32444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012718	ACG	2	6	32821	32826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012718	TCG	2	6	32863	32868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012718	GCT	2	6	32939	32944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012718	CGA	2	6	32987	32992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012718	TGC	2	6	33008	33013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012718	GCA	2	6	33117	33122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012718	TTG	2	6	33156	33161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012718	ACG	2	6	33182	33187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012718	GGC	2	6	33226	33231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012718	GAA	2	6	33389	33394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012718	GGC	2	6	33410	33415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012718	TCG	2	6	33478	33483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012718	TCA	2	6	33541	33546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012718	AAC	2	6	33667	33672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012718	GAC	2	6	33703	33708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012718	GGA	2	6	34615	34620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012718	CAA	2	6	35845	35850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012718	CGC	2	6	36013	36018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_012718	ATT	2	6	36126	36131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012718	CCA	2	6	36157	36162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_012718	TGG	2	6	36250	36255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012718	GAT	2	6	36258	36263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012718	GCG	2	6	36426	36431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012718	CGG	2	6	36482	36487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012718	TCC	2	6	36497	36502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_012718	AGC	2	6	36508	36513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_012718	TCG	2	6	100644	100649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_012718	CGT	2	6	101092	101097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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406	NC_012718	GCT	2	6	140830	140835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
407	NC_012718	AGC	2	6	140838	140843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_012718	ACC	2	6	140907	140912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
409	NC_012718	AAG	2	6	140958	140963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
410	NC_012718	TCC	2	6	141344	141349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
411	NC_012718	CGG	2	6	141368	141373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_012718	CGC	2	6	141381	141386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
413	NC_012718	ATC	2	6	141405	141410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_012718	ACC	2	6	141484	141489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
415	NC_012718	CGA	2	6	141599	141604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
416	NC_012718	CAG	2	6	141628	141633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_012718	GCC	2	6	141661	141666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
418	NC_012718	GGC	2	6	141751	141756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.