MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus anthracis str. A0248 plasmid pXO1

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012656	TAAT	2	8	872	879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012656	ATGA	2	8	901	908	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012656	AATA	2	8	1157	1164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012656	ATTA	2	8	1223	1230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012656	ATAG	3	12	2340	2351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012656	CTTT	2	8	8785	8792	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012656	TACA	2	8	13395	13402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012656	ATAA	2	8	14063	14070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012656	CTGC	2	8	14073	14080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012656	ATCA	2	8	14348	14355	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012656	AAGA	2	8	22260	22267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012656	TTCC	2	8	22383	22390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012656	AATA	2	8	24794	24801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012656	AAAG	2	8	27044	27051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012656	GTAG	2	8	28579	28586	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012656	AAAG	2	8	28986	28993	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012656	TTTC	2	8	29269	29276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012656	GGAA	2	8	29407	29414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012656	TTTC	2	8	30308	30315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012656	TATT	2	8	31204	31211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012656	TGCT	2	8	33619	33626	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012656	ATTT	2	8	34505	34512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012656	TTCT	2	8	34613	34620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012656	AATG	2	8	34946	34953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012656	TCCT	2	8	34973	34980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012656	GTAT	2	8	35031	35038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012656	AAAG	2	8	35267	35274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012656	TAAA	2	8	35961	35968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012656	TTAT	2	8	36831	36838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012656	ATAA	2	8	37006	37013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012656	ATTT	2	8	40551	40558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012656	ATCA	2	8	40700	40707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012656	ATAA	2	8	40740	40747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012656	TAAA	3	12	42224	42235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012656	TTTA	3	12	42238	42249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012656	TTCT	2	8	42377	42384	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012656	AATT	2	8	43601	43608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012656	GTTT	2	8	43953	43960	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012656	AAAC	2	8	44540	44547	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012656	TGTT	2	8	44559	44566	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012656	TTCT	2	8	45536	45543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012656	AGAA	2	8	45988	45995	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012656	TAGA	2	8	46028	46035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012656	AATA	2	8	46190	46197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012656	TAAT	2	8	46282	46289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012656	CTTC	2	8	46298	46305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012656	GATG	2	8	48845	48852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012656	AAAC	2	8	48889	48896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012656	AACA	2	8	51009	51016	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012656	AACC	2	8	51889	51896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012656	CAAA	2	8	51923	51930	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012656	ACCT	2	8	55665	55672	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012656	ATTT	2	8	57560	57567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012656	AATA	2	8	57570	57577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012656	CGGA	2	8	57757	57764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012656	CCTC	2	8	59290	59297	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_012656	GTAT	2	8	59786	59793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012656	TAAT	2	8	59814	59821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012656	ATTA	2	8	59884	59891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012656	ATTT	2	8	59996	60003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012656	ACGC	2	8	60042	60049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012656	TTTG	2	8	61721	61728	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012656	ACCA	2	8	61871	61878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012656	ATTG	2	8	61990	61997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012656	TCGT	2	8	62033	62040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012656	ATTA	2	8	62145	62152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012656	TGTA	2	8	63931	63938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012656	TAAT	2	8	64025	64032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012656	AATA	2	8	64147	64154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012656	TAAT	2	8	64171	64178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012656	ATTA	2	8	72374	72381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012656	GAAC	2	8	72852	72859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012656	GGTA	2	8	72914	72921	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012656	AAAG	2	8	72983	72990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012656	GAAC	2	8	73379	73386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012656	TAAG	2	8	73525	73532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012656	AAAG	2	8	76937	76944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012656	GTAT	2	8	77279	77286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012656	TTGA	2	8	78139	78146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012656	GGGA	2	8	80343	80350	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012656	GAAA	2	8	81132	81139	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012656	TATC	2	8	81177	81184	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012656	AGGT	2	8	81314	81321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012656	GGAT	2	8	81579	81586	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012656	AGTG	2	8	81676	81683	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012656	AGTG	2	8	81913	81920	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012656	TCAT	2	8	82522	82529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012656	TATT	2	8	82544	82551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012656	ATTA	2	8	82814	82821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012656	TATT	2	8	83577	83584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012656	AGGA	2	8	83961	83968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012656	ACAA	2	8	86993	87000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012656	TGAT	2	8	87019	87026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012656	TGAT	2	8	89939	89946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012656	CTTT	2	8	90016	90023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012656	ACAA	2	8	90082	90089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012656	AAAG	2	8	90165	90172	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012656	AGCT	2	8	90524	90531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012656	CATC	2	8	90931	90938	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012656	TGGA	2	8	90968	90975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012656	AATT	2	8	90977	90984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012656	ATCC	2	8	91631	91638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012656	AAGG	2	8	91744	91751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012656	TGCG	2	8	92345	92352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012656	TTGC	2	8	92548	92555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012656	GGCA	2	8	93996	94003	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012656	AGCA	2	8	94061	94068	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012656	AAGT	2	8	94073	94080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012656	AATC	2	8	94321	94328	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012656	GTTC	2	8	94444	94451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012656	GTAA	2	8	94933	94940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012656	TCGT	2	8	95639	95646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012656	ATTT	2	8	98637	98644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012656	TACT	2	8	99488	99495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012656	AAAG	2	8	100887	100894	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012656	AAAT	2	8	100899	100906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012656	TCTA	2	8	102871	102878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012656	ATTT	2	8	102955	102962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012656	TAAA	2	8	103501	103508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012656	TTTA	2	8	103585	103592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012656	AATC	2	8	104383	104390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012656	TAGG	2	8	105439	105446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012656	TTAA	2	8	105911	105918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012656	ATTA	2	8	105959	105966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012656	TACA	2	8	106059	106066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012656	TATT	2	8	106118	106125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012656	CAAT	2	8	106201	106208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012656	TAAT	2	8	106285	106292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012656	ACAA	2	8	106316	106323	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012656	TTTA	2	8	106354	106361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012656	TATT	2	8	106419	106426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012656	AAAG	2	8	106437	106444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012656	TTAA	2	8	106769	106776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012656	TAAT	2	8	106796	106803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012656	TTTA	2	8	106896	106903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012656	GTCA	2	8	106973	106980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012656	ACAA	2	8	109133	109140	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012656	AATA	2	8	109253	109260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012656	TTGT	2	8	111052	111059	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012656	ATTA	2	8	111220	111227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012656	ATTG	2	8	111536	111543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012656	GTTT	2	8	111586	111593	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012656	TACT	2	8	111624	111631	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_012656	GAGG	2	8	111847	111854	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012656	TTGT	2	8	112218	112225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012656	CTAA	2	8	112334	112341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012656	ACTA	2	8	112753	112760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_012656	ATTT	2	8	115166	115173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012656	ACAA	2	8	116419	116426	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012656	TTTA	2	8	118221	118228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012656	TAAT	2	8	119063	119070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012656	GTTT	2	8	119101	119108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012656	AGAA	2	8	120286	120293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012656	TTGA	2	8	120838	120845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012656	ATTT	2	8	121876	121883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.