MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus 03BB102 plasmid p03BB102_179

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012473	ATGAT	2	10	1297	1306	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012473	TAAAA	2	10	8221	8230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012473	CACAA	2	10	10489	10498	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_012473	GGATA	2	10	14158	14167	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012473	TAAAA	2	10	14586	14595	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012473	ATTTT	2	10	25633	25642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012473	CACAA	2	10	28283	28292	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012473	TGATT	2	10	39339	39348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012473	ATATC	2	10	44475	44484	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012473	TAATA	2	10	46016	46025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012473	CTTTA	2	10	47954	47963	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012473	ACATG	2	10	56286	56295	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012473	TTGTG	2	10	69088	69097	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012473	TTTTA	2	10	69935	69944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012473	TATAA	2	10	74817	74826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012473	TTTAA	2	10	86066	86075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012473	TTACT	2	10	94369	94378	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012473	AGTAA	2	10	95844	95853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012473	GAATA	2	10	98774	98783	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012473	AATAA	2	10	103670	103679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012473	TATAA	2	10	108049	108058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012473	TCATT	2	10	108063	108072	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012473	ATTTA	2	10	108950	108959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012473	ATTGG	2	10	114576	114585	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012473	TAAAA	2	10	115441	115450	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012473	TAAAA	2	10	118581	118590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012473	CTTTC	2	10	119488	119497	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_012473	AATTC	2	10	123043	123052	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012473	TATTT	2	10	123053	123062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012473	TTAAA	2	10	123812	123821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012473	ATTAA	2	10	124339	124348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012473	TGATA	2	10	125488	125497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012473	TATTT	2	10	125510	125519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012473	GTTGT	2	10	125763	125772	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012473	TAAAA	2	10	132046	132055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012473	ATTTT	2	10	133087	133096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012473	TAAAT	2	10	135759	135768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012473	TATTT	2	10	136267	136276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012473	TAAGG	2	10	139418	139427	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012473	TAATT	2	10	139781	139790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012473	TACTT	2	10	140455	140464	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012473	TCTTT	2	10	140660	140669	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012473	TTCAA	2	10	141647	141656	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_012473	AGTAA	2	10	144920	144929	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012473	AGTAG	2	10	147270	147279	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012473	ATTCT	2	10	152166	152175	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012473	TAAAT	2	10	156393	156402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012473	TTTAG	2	10	159658	159667	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012473	TCATT	2	10	165860	165869	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012473	ATTTC	2	10	167990	167999	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012473	ATAAA	2	10	177792	177801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.