MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis ATCC 23457 chromosome II

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012442	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012442	ACCGA	2	10	8529	8538	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012442	AGCGG	2	10	22130	22139	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012442	ACGGC	2	10	27238	27247	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012442	GCGCA	2	10	28345	28354	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_012442	TCGGT	2	10	28562	28571	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012442	GGCCT	2	10	37522	37531	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012442	ATGAA	2	10	40093	40102	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012442	TTTGT	2	10	41254	41263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012442	CGCTC	2	10	43463	43472	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_012442	TGCGG	2	10	60814	60823	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012442	TATCT	2	10	73059	73068	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012442	TCGGT	2	10	81760	81769	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012442	TTCTC	2	10	81789	81798	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_012442	ACTTG	2	10	87318	87327	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012442	CGGTA	2	10	97184	97193	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012442	CCAAG	2	10	97359	97368	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_012442	ATGAA	2	10	103446	103455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012442	TCCTT	2	10	106790	106799	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_012442	CTTGC	2	10	108018	108027	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_012442	CCTGC	2	10	112692	112701	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_012442	GCCCG	2	10	115940	115949	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_012442	GTTCG	2	10	117252	117261	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012442	GAAAA	2	10	119184	119193	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012442	CGATA	2	10	121338	121347	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012442	GCCCG	2	10	121752	121761	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_012442	AGATA	2	10	134529	134538	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012442	CCGGG	2	10	152201	152210	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_012442	CGGAT	2	10	159304	159313	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012442	TGGGC	2	10	159435	159444	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012442	TGTTT	2	10	159888	159897	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012442	CCCGT	2	10	160613	160622	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_012442	GGATA	2	10	187640	187649	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012442	TGACG	2	10	191386	191395	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012442	GATCA	2	10	192833	192842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012442	AGCAG	2	10	203186	203195	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012442	TTTTG	2	10	208768	208777	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012442	ATCAA	2	10	208936	208945	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_012442	TGAAA	2	10	208946	208955	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012442	CGCCT	2	10	209919	209928	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_012442	CGGGC	2	10	210361	210370	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_012442	TAAGT	2	10	214063	214072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012442	CGCTG	2	10	252888	252897	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012442	CGATC	2	10	259040	259049	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_012442	GGCGG	2	10	287849	287858	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
46	NC_012442	GCTTT	2	10	304386	304395	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012442	GGTCA	2	10	318394	318403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012442	ATTCC	2	10	320565	320574	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_012442	AAGGC	2	10	338821	338830	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012442	GGTGG	2	10	339747	339756	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012442	TTTGT	2	10	346416	346425	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012442	GCTTC	2	10	356110	356119	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_012442	GGTGC	2	10	356854	356863	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012442	CGCGC	2	10	358160	358169	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_012442	TGAAA	2	10	365911	365920	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012442	TGGAG	2	10	389925	389934	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012442	TCATA	2	10	391016	391025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012442	AGCAA	2	10	397372	397381	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012442	CGGGC	2	10	397821	397830	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_012442	GCCGG	2	10	404995	405004	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_012442	AGCGC	2	10	414014	414023	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_012442	GGCAT	2	10	419652	419661	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_012442	CCGGC	2	10	419857	419866	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_012442	AGCCC	2	10	420026	420035	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_012442	ATGGC	2	10	421241	421250	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_012442	CGGAA	2	10	424064	424073	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012442	GCGCC	2	10	429116	429125	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_012442	ATCCC	2	10	436546	436555	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_012442	AAGAA	2	10	437745	437754	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012442	GCTGT	2	10	438846	438855	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012442	GCCTC	2	10	448657	448666	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_012442	TGGAA	2	10	448949	448958	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012442	AAAGC	2	10	456376	456385	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_012442	CGCGC	2	10	458843	458852	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_012442	GCCGC	2	10	476624	476633	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_012442	ACTGG	2	10	483261	483270	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012442	CGGCC	2	10	492274	492283	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_012442	GTTGC	2	10	505226	505235	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012442	TCGCA	2	10	511972	511981	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_012442	TCATT	2	10	519464	519473	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012442	AAACC	2	10	527314	527323	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_012442	TGCCG	2	10	530086	530095	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_012442	AGCGG	2	10	552867	552876	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012442	ACAAA	2	10	555173	555182	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012442	TTTGC	2	10	579112	579121	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012442	CGCCT	2	10	579853	579862	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_012442	GCAGA	2	10	585833	585842	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012442	GCCTT	2	10	587281	587290	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_012442	GTTTT	2	10	596753	596762	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012442	ACAAA	2	10	608988	608997	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012442	ACCCG	2	10	610436	610445	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_012442	TCGCT	2	10	615505	615514	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_012442	CGCAC	2	10	661091	661100	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_012442	TAATC	2	10	682516	682525	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012442	TTACG	2	10	687825	687834	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_012442	TGAAA	2	10	693407	693416	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012442	TCCGC	2	10	694218	694227	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_012442	TCAGG	2	10	699083	699092	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012442	CCGTG	2	10	717581	717590	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_012442	ACAGC	2	10	725980	725989	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_012442	ATTAT	2	10	732907	732916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012442	TCAAA	2	10	757427	757436	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012442	CATCG	2	10	760786	760795	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_012442	ACAAA	2	10	760902	760911	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_012442	CACCG	2	10	768130	768139	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_012442	GATCG	2	10	769566	769575	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_012442	TCCCC	2	10	769692	769701	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
108	NC_012442	TCCCC	2	10	771312	771321	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
109	NC_012442	GCAAT	2	10	772440	772449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012442	GCGCC	2	10	776150	776159	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_012442	CATTC	2	10	783739	783748	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_012442	GCAGT	2	10	799805	799814	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012442	AGAGG	2	10	822681	822690	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012442	CAATT	2	10	847816	847825	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_012442	CGTAT	2	10	847827	847836	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_012442	GAAAA	2	10	853001	853010	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012442	GGTTT	2	10	860951	860960	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012442	CGCCT	2	10	863339	863348	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_012442	TGATA	2	10	867927	867936	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012442	CCCTC	2	10	889969	889978	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
121	NC_012442	ACAAA	2	10	900699	900708	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_012442	CGGGC	2	10	904297	904306	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_012442	GAACG	2	10	918209	918218	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_012442	CTTCC	2	10	919132	919141	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_012442	GGTGG	2	10	929099	929108	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012442	CATGG	2	10	932867	932876	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_012442	CCGGG	4	20	932877	932896	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_012442	GCCTC	2	10	932936	932945	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_012442	GCCTG	2	10	933428	933437	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_012442	CGAAA	2	10	934202	934211	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_012442	TTCAG	2	10	941024	941033	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012442	ATGCC	2	10	941036	941045	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_012442	GTGAT	2	10	941964	941973	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012442	GGAAC	2	10	942450	942459	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_012442	AGGCC	2	10	947621	947630	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_012442	CCCTA	2	10	948511	948520	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
137	NC_012442	CCCTT	2	10	952274	952283	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_012442	GGCCG	2	10	961744	961753	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_012442	CCCCG	2	10	968032	968041	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
140	NC_012442	TAAAA	2	10	972077	972086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012442	AGCGA	2	10	1002837	1002846	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_012442	CGCTT	2	10	1012678	1012687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_012442	TGCGC	2	10	1016389	1016398	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_012442	CACGC	2	10	1021407	1021416	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_012442	CGCCT	2	10	1032016	1032025	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_012442	ATTAA	2	10	1033424	1033433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012442	CTTTC	2	10	1036117	1036126	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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168	NC_012442	CAGCG	2	10	1123040	1123049	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
169	NC_012442	AGCCC	2	10	1123167	1123176	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
170	NC_012442	TGATC	2	10	1123616	1123625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
171	NC_012442	TTCTG	2	10	1128839	1128848	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_012442	GCATT	2	10	1155224	1155233	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_012442	ACCGA	2	10	1158085	1158094	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_012442	GGAAG	2	10	1160990	1160999	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012442	AAAGC	2	10	1172502	1172511	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
178	NC_012442	GCTTT	2	10	1172517	1172526	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
179	NC_012442	ACGGC	2	10	1172788	1172797	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.