MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 6795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012225	ATT	2	6	1396	1401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012225	TTA	2	6	1424	1429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012225	TAT	3	9	1435	1443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012225	ATT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012225	ATA	2	6	3162	3167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012225	ATT	3	9	3827	3835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012225	ATT	2	6	3839	3844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012225	AAT	2	6	3886	3891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012225	TAT	2	6	4847	4852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012225	TAT	2	6	4889	4894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012225	ATT	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012225	TAT	2	6	4957	4962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012225	ATT	2	6	7981	7986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012225	ATT	2	6	8028	8033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012225	ATT	2	6	8036	8041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012225	AAT	2	6	9594	9599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012225	ATT	2	6	9619	9624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012225	TAC	2	6	9678	9683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012225	ATT	2	6	11215	11220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012225	TAT	2	6	11284	11289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012225	TTA	2	6	11308	11313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012225	TAA	2	6	11760	11765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012225	ATT	2	6	11795	11800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012225	TTA	2	6	11803	11808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012225	ATA	2	6	11928	11933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012225	TAT	2	6	11941	11946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012225	ATA	2	6	12052	12057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012225	ATT	2	6	12138	12143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012225	TTA	2	6	12146	12151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012225	TAA	2	6	12258	12263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012225	ATT	2	6	12274	12279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012225	TAA	2	6	12324	12329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012225	ATA	2	6	15943	15948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012225	TAT	2	6	16178	16183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012225	TAA	2	6	16196	16201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012225	TAA	2	6	16204	16209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012225	TAA	2	6	16248	16253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012225	AAT	2	6	16277	16282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012225	CCT	2	6	16450	16455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_012225	TCA	2	6	16459	16464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012225	TGA	2	6	16487	16492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012225	TAA	2	6	16532	16537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012225	TAA	2	6	16540	16545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012225	AAT	2	6	16658	16663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012225	AAG	2	6	16668	16673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012225	TTA	3	9	17858	17866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012225	ATT	2	6	17889	17894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012225	TAA	2	6	17895	17900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012225	TAT	2	6	17954	17959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012225	TTC	2	6	18018	18023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012225	ATT	2	6	18972	18977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012225	ATT	2	6	19036	19041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012225	ATT	2	6	19776	19781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012225	TAA	2	6	19796	19801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012225	ATT	2	6	21125	21130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012225	TAA	2	6	21149	21154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012225	TAT	2	6	21410	21415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012225	ACA	2	6	21420	21425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012225	ATA	2	6	21426	21431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012225	TTA	2	6	21443	21448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012225	AAT	2	6	22038	22043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012225	TGC	2	6	22061	22066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012225	ACA	2	6	23185	23190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012225	AGT	2	6	23213	23218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012225	AAT	2	6	23230	23235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012225	TTA	3	9	23518	23526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012225	TTA	2	6	24341	24346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012225	ATC	2	6	24389	24394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012225	ATA	2	6	24416	24421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012225	ATT	2	6	25290	25295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012225	ATT	4	12	25382	25393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012225	ATT	3	9	25415	25423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012225	TAT	2	6	26350	26355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012225	ATA	2	6	27862	27867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012225	TAA	2	6	27920	27925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012225	CTG	2	6	28146	28151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012225	TAT	2	6	28274	28279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012225	ATT	2	6	28301	28306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012225	TAT	3	9	28309	28317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012225	ATT	3	9	28381	28389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012225	TAG	2	6	28405	28410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012225	ATA	3	9	28422	28430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012225	ATT	2	6	28523	28528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012225	TTA	2	6	28539	28544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012225	CGC	2	6	28591	28596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_012225	TGC	2	6	28623	28628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012225	CTT	2	6	28757	28762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012225	AAG	2	6	28798	28803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012225	TAT	2	6	28904	28909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012225	CTT	2	6	28961	28966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012225	ACT	2	6	29765	29770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012225	TTA	2	6	29846	29851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012225	TGA	2	6	29871	29876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012225	TAT	2	6	29894	29899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012225	ATA	2	6	29971	29976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012225	ATA	2	6	31232	31237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012225	TTA	2	6	32216	32221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012225	ATA	2	6	32247	32252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012225	TAA	2	6	32376	32381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012225	ATT	2	6	32396	32401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012225	ATC	2	6	34431	34436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012225	GTT	2	6	34724	34729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012225	CCT	2	6	34743	34748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_012225	AAT	2	6	34884	34889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012225	TTG	2	6	34928	34933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012225	ATA	2	6	34950	34955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012225	ATA	2	6	35042	35047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012225	ATT	3	9	35051	35059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012225	ATA	2	6	35782	35787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012225	ATT	2	6	36483	36488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012225	TAT	2	6	36496	36501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012225	TCA	2	6	36582	36587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012225	CAT	3	9	36592	36600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012225	CAT	2	6	36604	36609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012225	ATA	2	6	36670	36675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012225	TAA	2	6	36701	36706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012225	TAA	2	6	36740	36745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012225	AAT	3	9	36766	36774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012225	ATA	2	6	40019	40024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012225	ATT	4	12	41165	41176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012225	TAA	2	6	41197	41202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012225	TAA	2	6	42481	42486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012225	AAC	2	6	43643	43648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012225	TAT	2	6	43857	43862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012225	TAT	2	6	47770	47775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012225	TTG	2	6	50491	50496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012225	TAA	2	6	50531	50536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012225	TAT	2	6	50546	50551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012225	ATT	2	6	50583	50588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012225	AAT	2	6	52445	52450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012225	TGC	2	6	52453	52458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012225	TAA	2	6	52465	52470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012225	AAT	2	6	52532	52537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012225	TAT	2	6	52605	52610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012225	TCA	2	6	52611	52616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012225	TAA	2	6	52625	52630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012225	AAT	2	6	52634	52639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012225	TAA	3	9	52724	52732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012225	TAC	2	6	52786	52791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012225	AAT	2	6	52835	52840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012225	TTA	2	6	54714	54719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012225	ATT	2	6	54743	54748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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