MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 16597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012225	AAATAT	2	12	306949	306960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_012225	TTTTA	2	10	307463	307472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_012225	A	6	6	307507	307512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_012225	TAT	2	6	307513	307518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_012225	TG	3	6	307530	307535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_012225	ATT	2	6	307536	307541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_012225	A	7	7	307597	307603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_012225	GAAT	2	8	307604	307611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_012225	ATA	2	6	307629	307634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012225	TAA	2	6	307635	307640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_012225	TAT	2	6	307646	307651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_012225	A	6	6	307668	307673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_012225	T	7	7	307679	307685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_012225	T	7	7	307687	307693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_012225	GGA	2	6	307703	307708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_012225	TA	3	6	309178	309183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_012225	TATGA	2	10	309187	309196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_012225	AAATA	2	10	309238	309247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_012225	TA	3	6	309269	309274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_012225	TAA	3	9	310290	310298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_012225	TAA	2	6	310307	310312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_012225	CT	3	6	310316	310321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_012225	TAT	2	6	310322	310327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_012225	TTA	2	6	310328	310333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_012225	A	6	6	310338	310343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_012225	T	6	6	310347	310352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_012225	ATATA	2	10	311364	311373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_012225	AATT	2	8	311377	311384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_012225	A	6	6	311385	311390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_012225	AT	3	6	311414	311419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012225	ATA	2	6	311444	311449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_012225	ACTA	2	8	311461	311468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_012225	AT	3	6	311469	311474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_012225	TAA	2	6	313275	313280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_012225	AAAT	2	8	313300	313307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_012225	TA	3	6	313320	313325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_012225	T	6	6	313347	313352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_012225	TTTA	2	8	314354	314361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_012225	TA	3	6	314415	314420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_012225	AAT	2	6	314428	314433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_012225	AAAT	2	8	314444	314451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_012225	TA	3	6	314457	314462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_012225	TAA	2	6	314475	314480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_012225	ATT	2	6	316031	316036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_012225	TTAT	2	8	316046	316053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_012225	T	6	6	316069	316074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_012225	TAT	2	6	316551	316556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_012225	TAT	2	6	317080	317085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_012225	TTAT	2	8	317094	317101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_012225	A	6	6	317992	317997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_012225	TAT	2	6	318050	318055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_012225	ATA	2	6	318086	318091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_012225	A	7	7	318094	318100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_012225	GTT	2	6	318119	318124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_012225	TC	3	6	318130	318135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_012225	TGC	2	6	318165	318170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_012225	CGC	2	6	318306	318311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_012225	CAA	2	6	318331	318336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_012225	AAT	2	6	318388	318393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_012225	T	6	6	318411	318416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_012225	TTG	2	6	319278	319283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_012225	TAA	2	6	319288	319293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_012225	TAA	2	6	319311	319316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_012225	TTA	2	6	319323	319328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_012225	GCT	2	6	319329	319334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_012225	TTTATT	2	12	319337	319348	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_012225	TAA	2	6	319357	319362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_012225	TTA	2	6	319369	319374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_012225	TTA	2	6	319379	319384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_012225	TAA	2	6	319392	319397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012225	ATT	2	6	319398	319403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_012225	CCT	2	6	320324	320329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_012225	ATT	2	6	320371	320376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_012225	TAT	2	6	320387	320392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_012225	TA	3	6	320411	320416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_012225	TA	4	8	320424	320431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_012225	TTA	2	6	320457	320462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_012225	TTA	2	6	320477	320482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_012225	TAT	2	6	320491	320496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_012225	AAT	2	6	320531	320536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_012225	TAA	2	6	321302	321307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_012225	T	6	6	323273	323278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_012225	T	7	7	324682	324688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_012225	TAT	2	6	324708	324713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_012225	TAT	2	6	324735	324740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_012225	TTA	2	6	324741	324746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_012225	TGC	2	6	324835	324840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_012225	GTT	2	6	324876	324881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_012225	TA	3	6	324886	324891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_012225	CTATA	2	10	324892	324901	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1592	NC_012225	ATA	2	6	324905	324910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_012225	TA	3	6	327820	327825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_012225	AT	4	8	329533	329540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_012225	A	6	6	330304	330309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_012225	ATTAT	2	10	330331	330340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_012225	AT	3	6	330339	330344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_012225	TA	5	10	330351	330360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_012225	GTT	2	6	330364	330369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_012225	AT	3	6	331062	331067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_012225	ATTT	2	8	331079	331086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_012225	ATA	2	6	331755	331760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_012225	GTA	2	6	331779	331784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_012225	CTATT	2	10	331799	331808	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1605	NC_012225	TAT	2	6	331811	331816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_012225	AGTA	2	8	331817	331824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_012225	AGG	2	6	332347	332352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_012225	TAA	2	6	332358	332363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_012225	TTACAT	2	12	332370	332381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1610	NC_012225	TTTA	2	8	332386	332393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_012225	TAT	2	6	332440	332445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_012225	TAT	2	6	332500	332505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_012225	TATTG	2	10	332539	332548	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012225	ATTTA	2	10	332824	332833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_012225	GTA	2	6	332857	332862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_012225	TA	3	6	332870	332875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_012225	GTA	2	6	332899	332904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_012225	TA	3	6	332910	332915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_012225	TAT	2	6	332920	332925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_012225	T	6	6	332925	332930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_012225	ATT	2	6	332935	332940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_012225	A	7	7	332943	332949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_012225	TA	3	6	332950	332955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_012225	ATTAT	2	10	332958	332967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_012225	TAA	2	6	332972	332977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_012225	A	6	6	334038	334043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_012225	TA	3	6	334051	334056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_012225	AGG	2	6	334073	334078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_012225	T	8	8	334862	334869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_012225	TAA	2	6	334876	334881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_012225	TA	3	6	334882	334887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_012225	GA	4	8	334896	334903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_012225	TAT	2	6	335596	335601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_012225	T	8	8	336979	336986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_012225	AAT	2	6	336988	336993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_012225	TTATA	2	10	337015	337024	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_012225	AAATA	2	10	337026	337035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_012225	AT	3	6	337069	337074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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