MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 16597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012225	GTT	2	6	101145	101150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012225	TA	3	6	101155	101160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012225	T	6	6	101184	101189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012225	GTT	2	6	101190	101195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012225	TGC	2	6	101204	101209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_012225	ATA	3	9	101278	101286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012225	TA	3	6	101296	101301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012225	AT	4	8	101329	101336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012225	GTA	2	6	101340	101345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012225	TA	3	6	101344	101349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012225	CTAG	2	8	101363	101370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_012225	TA	3	6	102260	102265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012225	ATA	2	6	102289	102294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012225	TTAAA	2	10	102303	102312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012225	TA	3	6	102332	102337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012225	T	7	7	102360	102366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012225	CGC	2	6	102381	102386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_012225	CTTC	2	8	102541	102548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_012225	AAG	2	6	102557	102562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012225	G	6	6	102590	102595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012225	ATTTT	2	10	102626	102635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012225	ATA	2	6	102645	102650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012225	TA	4	8	102654	102661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012225	TAA	2	6	102680	102685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012225	TTA	2	6	102688	102693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012225	AT	3	6	102704	102709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012225	ATTA	2	8	102730	102737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012225	AAT	2	6	103804	103809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012225	ATAAA	2	10	103826	103835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012225	TA	3	6	103844	103849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012225	ATT	2	6	103854	103859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_012225	TTA	2	6	104667	104672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012225	AAT	2	6	104689	104694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012225	TATAA	2	10	105632	105641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012225	TA	3	6	105670	105675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012225	TAA	2	6	106125	106130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012225	ATTT	2	8	106134	106141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012225	TAA	2	6	106151	106156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012225	ATTA	2	8	106742	106749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012225	TA	3	6	106748	106753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012225	ATA	2	6	106756	106761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012225	A	7	7	106770	106776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012225	T	6	6	106810	106815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012225	ATT	2	6	106822	106827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012225	ATA	2	6	106846	106851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012225	AT	3	6	109569	109574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012225	ATA	2	6	114978	114983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012225	A	9	9	115003	115011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012225	AAT	2	6	115014	115019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012225	TAA	2	6	115027	115032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012225	TAA	2	6	115840	115845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012225	A	8	8	115907	115914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012225	T	6	6	115927	115932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012225	ATT	2	6	116710	116715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_012225	TAAAA	2	10	116721	116730	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012225	TTC	2	6	116734	116739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_012225	TAT	2	6	116753	116758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012225	TAA	2	6	116759	116764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_012225	ATT	2	6	116767	116772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012225	TAA	2	6	117525	117530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012225	ATT	2	6	117554	117559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012225	TAT	2	6	117562	117567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012225	TTA	2	6	117583	117588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012225	T	6	6	117593	117598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_012225	ATTA	3	12	117603	117614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_012225	TA	4	8	117633	117640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012225	T	6	6	117648	117653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012225	TAA	2	6	117659	117664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012225	ATAG	2	8	117715	117722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012225	A	6	6	117726	117731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012225	TAT	2	6	117732	117737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012225	T	6	6	117741	117746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012225	TAT	2	6	117752	117757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012225	TTAT	2	8	117772	117779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_012225	A	7	7	117786	117792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_012225	TAAA	2	8	117814	117821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012225	TAT	2	6	118703	118708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012225	ATC	2	6	118744	118749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_012225	ATT	2	6	120296	120301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012225	ATG	2	6	120367	120372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012225	TAT	2	6	120375	120380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012225	AAT	2	6	120381	120386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012225	TAT	2	6	120394	120399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012225	A	6	6	120425	120430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012225	TCGC	2	8	120435	120442	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
587	NC_012225	GTATA	2	10	120457	120466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_012225	TAT	2	6	121421	121426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012225	T	7	7	121481	121487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012225	TAG	2	6	121498	121503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012225	TAAAA	2	10	121504	121513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012225	TTA	2	6	123370	123375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012225	TAA	2	6	123393	123398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012225	TA	3	6	123411	123416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_012225	AT	4	8	123419	123426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_012225	TAT	2	6	123448	123453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_012225	TATT	2	8	123482	123489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012225	ATT	2	6	123493	123498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012225	ATA	2	6	123519	123524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012225	TAT	2	6	123538	123543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012225	A	8	8	123544	123551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012225	AATTGA	2	12	123563	123574	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012225	A	7	7	123576	123582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012225	TACTA	2	10	123585	123594	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
607	NC_012225	TAA	2	6	124851	124856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012225	ATTT	2	8	124876	124883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012225	AAG	2	6	124903	124908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012225	TTA	2	6	124910	124915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012225	TAT	2	6	124930	124935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012225	TA	3	6	124953	124958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012225	TAA	3	9	124977	124985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012225	TAT	2	6	125815	125820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012225	TAATA	2	10	125821	125830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012225	TAA	4	12	125846	125857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_012225	TAA	2	6	126744	126749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_012225	A	7	7	126809	126815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012225	T	6	6	126823	126828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012225	TA	4	8	126831	126838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_012225	ATT	2	6	126843	126848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012225	TAT	3	9	126861	126869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012225	AT	3	6	126868	126873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012225	T	6	6	126901	126906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012225	T	7	7	126909	126915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012225	A	6	6	126927	126932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012225	TAT	2	6	126936	126941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012225	T	6	6	126971	126976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012225	ATTAT	2	10	126977	126986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_012225	ATTAT	2	10	126995	127004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012225	GGA	2	6	127412	127417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012225	CTT	3	9	127735	127743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_012225	ATTT	2	8	127793	127800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_012225	TA	3	6	127808	127813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_012225	AT	3	6	127817	127822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_012225	AACA	2	8	127837	127844	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
638	NC_012225	TAA	2	6	127875	127880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_012225	A	7	7	127879	127885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_012225	TTA	2	6	127901	127906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_012225	AT	3	6	127914	127919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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