MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	TTA	2	6	3	8	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012204	GTT	2	6	90	95	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012204	CTA	2	6	163	168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012204	TTC	2	6	190	195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012204	CTT	2	6	205	210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012204	TAG	2	6	305	310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012204	TAC	2	6	510	515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012204	TAA	2	6	545	550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012204	CAA	3	9	862	870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012204	AAT	2	6	871	876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012204	ACA	2	6	974	979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012204	ACT	2	6	1009	1014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012204	TAA	2	6	1015	1020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012204	CTT	2	6	1062	1067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012204	AGA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012204	TAA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012204	AAT	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012204	CTT	2	6	1621	1626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012204	TTA	2	6	1802	1807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012204	AAG	2	6	2326	2331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012204	GCA	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012204	ACT	2	6	2950	2955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012204	ATT	2	6	2989	2994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012204	TAA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012204	ATT	2	6	3085	3090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012204	AAG	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012204	AAT	2	6	3185	3190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012204	ATA	2	6	3258	3263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012204	CTT	2	6	3988	3993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012204	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012204	CTT	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012204	ATC	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012204	AAG	2	6	5418	5423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012204	TAA	2	6	5427	5432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012204	ATA	2	6	5834	5839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012204	ATA	2	6	6257	6262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012204	TAA	2	6	6372	6377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012204	AGA	2	6	7326	7331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012204	AAC	2	6	7404	7409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012204	ATT	2	6	7413	7418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012204	GCT	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012204	TTA	2	6	7788	7793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012204	TAG	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012204	ATT	2	6	7932	7937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012204	AAC	2	6	7983	7988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012204	TAT	2	6	8003	8008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012204	AAT	2	6	8026	8031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012204	ATA	2	6	8057	8062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012204	TGC	2	6	8066	8071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012204	AAT	2	6	8347	8352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012204	TAC	2	6	8444	8449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012204	ATT	2	6	8480	8485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012204	AAT	2	6	8488	8493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012204	TAT	2	6	9685	9690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012204	TAG	2	6	9714	9719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012204	TAA	2	6	9743	9748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012204	TAA	2	6	9824	9829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012204	TTA	2	6	9928	9933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012204	ATT	2	6	9966	9971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012204	ATT	2	6	10000	10005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012204	TAA	2	6	10091	10096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012204	ATT	2	6	10586	10591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012204	TTG	2	6	10781	10786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012204	GTA	2	6	10879	10884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012204	ACA	2	6	10890	10895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012204	TAC	2	6	10910	10915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012204	TAA	2	6	12836	12841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012204	AAT	2	6	12844	12849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012204	AGA	2	6	12894	12899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012204	TAA	2	6	12962	12967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012204	TAA	2	6	12979	12984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012204	TAT	2	6	13012	13017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012204	GAT	2	6	13069	13074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012204	TGA	2	6	13175	13180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012204	ATA	2	6	13186	13191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012204	AAT	2	6	13199	13204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012204	TAT	2	6	13485	13490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012204	GAA	2	6	13545	13550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012204	ATA	2	6	13600	13605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012204	AAT	2	6	13616	13621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012204	ATG	2	6	13657	13662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012204	ATA	2	6	13692	13697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012204	ATA	3	9	13713	13721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012204	AGA	2	6	13784	13789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012204	GTA	2	6	13863	13868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012204	ATT	2	6	14049	14054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012204	TAA	2	6	14077	14082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012204	ATA	2	6	14105	14110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012204	AAG	2	6	14116	14121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012204	AGA	2	6	14181	14186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012204	ATT	2	6	14378	14383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012204	AAT	2	6	14404	14409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012204	ACT	2	6	14426	14431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012204	AGT	2	6	14435	14440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012204	CAT	2	6	14474	14479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012204	TAT	2	6	14480	14485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012204	ATA	2	6	14561	14566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012204	TAT	2	6	14584	14589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012204	ATT	2	6	14876	14881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012204	ATA	2	6	16188	16193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012204	CTT	2	6	16229	16234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012204	ACA	2	6	16381	16386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012204	CAA	2	6	16399	16404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012204	ATT	2	6	16507	16512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012204	ACA	2	6	16535	16540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012204	ATA	2	6	16544	16549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012204	TAA	2	6	16840	16845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012204	CTA	2	6	16997	17002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012204	ATA	2	6	17006	17011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012204	CAA	2	6	17038	17043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012204	AAT	2	6	17741	17746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012204	ATA	2	6	17860	17865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012204	AAG	2	6	17893	17898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012204	AGC	2	6	17927	17932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012204	TTC	2	6	18022	18027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012204	ATT	2	6	18089	18094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012204	TAT	2	6	18150	18155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012204	CTA	2	6	19032	19037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012204	AAT	2	6	19091	19096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012204	GAT	2	6	20412	20417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012204	TAA	2	6	20506	20511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012204	AGT	2	6	20781	20786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012204	GAA	2	6	20832	20837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012204	TGA	2	6	20882	20887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012204	TAA	2	6	21116	21121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012204	GTT	2	6	21202	21207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012204	ATG	2	6	21582	21587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012204	AAT	2	6	21932	21937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012204	GAA	2	6	22033	22038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012204	ATA	2	6	22093	22098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012204	TTA	2	6	22372	22377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012204	TAA	2	6	22453	22458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012204	TAT	2	6	22624	22629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012204	TTA	2	6	22796	22801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012204	TAA	2	6	22807	22812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012204	ATA	2	6	22834	22839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012204	ATA	2	6	22907	22912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012204	TGA	2	6	23101	23106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012204	TAT	2	6	23135	23140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012204	TAT	2	6	23191	23196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012204	TAA	2	6	23533	23538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012204	GAT	2	6	23561	23566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012204	TAT	2	6	23733	23738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012204	TAC	3	9	23809	23817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_012204	TAC	2	6	23820	23825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012204	AGA	2	6	23856	23861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012204	ATT	2	6	23882	23887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.