MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	TTTA	2	8	61	68	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012185	ATGT	2	8	102	109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012185	GTAA	2	8	1388	1395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012185	TAAT	2	8	1489	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012185	TAAA	2	8	1639	1646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012185	AAAT	2	8	1739	1746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012185	TAGA	2	8	2007	2014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012185	TAAT	2	8	2099	2106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012185	TATC	2	8	2314	2321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012185	TAAT	2	8	2837	2844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012185	AAAT	2	8	3512	3519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012185	AAAC	2	8	3719	3726	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012185	TATT	2	8	3921	3928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012185	CTTT	2	8	5330	5337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012185	ATCA	2	8	5672	5679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012185	ATTA	2	8	5780	5787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012185	ATTA	2	8	5791	5798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012185	TAAA	2	8	6755	6762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012185	TTTA	2	8	6770	6777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012185	TTGT	2	8	6912	6919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012185	ATTA	2	8	7354	7361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012185	ATTA	2	8	11365	11372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012185	AAAT	2	8	11559	11566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012185	ATTT	2	8	11599	11606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012185	TTTA	2	8	11618	11625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012185	ATAA	2	8	11733	11740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012185	TTAT	2	8	11750	11757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012185	AAAC	2	8	12602	12609	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012185	AGAT	2	8	14232	14239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012185	TTAT	2	8	14563	14570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012185	ATTA	2	8	14586	14593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012185	TTAA	2	8	14595	14602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012185	AATT	2	8	14765	14772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012185	ACAA	2	8	14847	14854	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012185	AAAC	2	8	15393	15400	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012185	ATTT	2	8	15972	15979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012185	TTTA	2	8	16001	16008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012185	TAAT	2	8	16270	16277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012185	TTTA	2	8	16278	16285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012185	TTTA	2	8	16397	16404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012185	AAAT	2	8	16478	16485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012185	ATTT	2	8	17125	17132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012185	GTTT	2	8	17362	17369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012185	TAAA	2	8	18753	18760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012185	ATTA	2	8	18761	18768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012185	AAAG	2	8	19430	19437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012185	TTAA	2	8	19497	19504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012185	CTTT	2	8	19844	19851	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012185	TTGC	2	8	20361	20368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012185	ATTG	2	8	20401	20408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012185	TATC	2	8	20440	20447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012185	CTTT	2	8	20463	20470	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012185	ATTT	2	8	20630	20637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012185	TTAA	2	8	21413	21420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012185	CTTT	2	8	21565	21572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012185	AGTA	2	8	22333	22340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012185	CGGA	2	8	22390	22397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012185	TAAT	2	8	22903	22910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012185	ATTA	2	8	23115	23122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012185	TTTC	2	8	26233	26240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012185	AGTA	2	8	26492	26499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012185	ATAA	3	12	26543	26554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012185	ATTT	2	8	26665	26672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012185	AATT	2	8	26704	26711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012185	AGAT	2	8	26968	26975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012185	GATT	2	8	27267	27274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012185	AAAG	2	8	27354	27361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012185	AATT	2	8	27965	27972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012185	ATTT	2	8	28010	28017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012185	TTAT	2	8	28321	28328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012185	ATTA	2	8	29205	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012185	CACT	2	8	29387	29394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012185	GTTA	2	8	29556	29563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012185	TAAA	2	8	31374	31381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012185	TTAA	2	8	31431	31438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012185	TCTT	2	8	31545	31552	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012185	TACT	2	8	31581	31588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012185	TAAA	2	8	31764	31771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012185	AAAC	2	8	31955	31962	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012185	TATT	2	8	33165	33172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012185	TTTA	2	8	33245	33252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012185	TACT	2	8	33678	33685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012185	CCAT	2	8	33794	33801	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012185	TTTA	2	8	34016	34023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012185	AATT	2	8	34465	34472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012185	TAAA	2	8	34624	34631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012185	CTTT	2	8	37163	37170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012185	AATT	2	8	37180	37187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012185	TACC	2	8	38244	38251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012185	ATTA	2	8	38818	38825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012185	AGCA	2	8	38929	38936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012185	TCAA	2	8	38945	38952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012185	AATT	2	8	39096	39103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012185	TTAG	2	8	40837	40844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012185	TATT	2	8	41719	41726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012185	AATT	2	8	41771	41778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012185	ATTT	2	8	42493	42500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012185	AATT	2	8	46509	46516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012185	CATT	2	8	49480	49487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012185	TATT	2	8	49903	49910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012185	TCTT	2	8	50880	50887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012185	ATTT	2	8	51959	51966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012185	TAAA	2	8	51990	51997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012185	GCAT	2	8	52797	52804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012185	ATAA	2	8	53491	53498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012185	AATG	2	8	53534	53541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012185	TAAT	3	12	53561	53572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012185	AATT	2	8	53598	53605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012185	ATGT	2	8	54822	54829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012185	ATTA	2	8	54830	54837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012185	AATG	2	8	55006	55013	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012185	AATG	2	8	55073	55080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012185	ATTT	2	8	55092	55099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012185	TAGT	2	8	61640	61647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012185	TTAA	2	8	61938	61945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012185	AATT	2	8	62843	62850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012185	TTTG	2	8	62963	62970	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012185	AAAT	2	8	63156	63163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012185	AGTT	2	8	63191	63198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012185	TAGA	2	8	63243	63250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012185	TAAA	2	8	63471	63478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012185	TATT	2	8	63626	63633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012185	AAAC	2	8	63747	63754	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012185	AAGA	2	8	63873	63880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012185	AGTA	2	8	64025	64032	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012185	TAAA	2	8	64144	64151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012185	ATTT	2	8	64652	64659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012185	TCAA	2	8	64749	64756	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012185	AACA	2	8	66801	66808	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012185	AATA	2	8	68654	68661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012185	ATTA	2	8	69056	69063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012185	TATT	2	8	69215	69222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012185	TGGT	2	8	69537	69544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012185	TTAA	2	8	69695	69702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012185	TTAA	2	8	69719	69726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012185	TTAA	2	8	70592	70599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012185	ATTA	2	8	71861	71868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012185	TTAA	2	8	72767	72774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012185	TAAA	3	12	72798	72809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012185	AAAT	2	8	72872	72879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012185	ATTA	2	8	72886	72893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012185	ATTA	2	8	72928	72935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012185	TATT	2	8	73240	73247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012185	TTAA	2	8	73726	73733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012185	TTAA	2	8	73865	73872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012185	TCAA	2	8	73896	73903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012185	AATA	2	8	73905	73912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012185	AATA	2	8	73968	73975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012185	TATT	2	8	74108	74115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012185	TTAT	2	8	74177	74184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012185	ATTA	2	8	74186	74193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012185	ATGA	2	8	74243	74250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012185	AATT	2	8	74321	74328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012185	TAAT	2	8	75705	75712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012185	TTAA	2	8	76104	76111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012185	GAAT	2	8	76126	76133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012185	GAAT	2	8	78266	78273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012185	AAGG	2	8	78327	78334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012185	TCTA	2	8	78343	78350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_012185	TGCA	2	8	78797	78804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_012185	TGTT	2	8	78887	78894	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_012185	AACT	2	8	79083	79090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_012185	TTAA	2	8	80388	80395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012185	AATT	2	8	80481	80488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012185	AATT	2	8	80762	80769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_012185	AGAA	2	8	81741	81748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.