MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 1126

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012185	ATA	3	9	27420	27428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012185	A	7	7	27464	27470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012185	TG	3	6	27498	27503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012185	ACA	2	6	27525	27530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_012185	TCA	2	6	27557	27562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_012185	GAA	2	6	27592	27597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012185	A	7	7	27634	27640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012185	GAA	2	6	27645	27650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012185	TAG	2	6	27660	27665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012185	TA	3	6	27678	27683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012185	ATG	2	6	27908	27913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012185	G	6	6	27927	27932	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012185	AATT	2	8	27965	27972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012185	TTA	2	6	27976	27981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012185	ATTT	2	8	28010	28017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012185	T	6	6	28122	28127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012185	AT	6	12	28132	28143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012185	TAT	2	6	28153	28158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012185	ATA	2	6	28171	28176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012185	AAT	2	6	28187	28192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012185	TAT	2	6	28195	28200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012185	TA	3	6	28315	28320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012185	TTAT	2	8	28321	28328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012185	ATA	2	6	28386	28391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012185	TTA	2	6	28410	28415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012185	T	7	7	28448	28454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012185	TTGATT	2	12	28462	28473	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012185	TTA	2	6	28686	28691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012185	ATTCTA	2	12	28854	28865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
530	NC_012185	ATT	2	6	29138	29143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012185	AGCAA	2	10	29153	29162	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
532	NC_012185	CTT	2	6	29192	29197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_012185	ATTA	2	8	29205	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012185	A	7	7	29256	29262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012185	TTA	2	6	29272	29277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012185	T	7	7	29332	29338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012185	CACT	2	8	29387	29394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_012185	TC	3	6	29435	29440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_012185	AAT	2	6	29486	29491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012185	TA	3	6	29515	29520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012185	GTTA	2	8	29556	29563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012185	TTAAT	2	10	29564	29573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012185	TAA	2	6	29891	29896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012185	TC	3	6	30724	30729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_012185	TAA	2	6	31348	31353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012185	T	6	6	31360	31365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012185	TAAA	2	8	31374	31381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012185	TAA	2	6	31410	31415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012185	TTAA	2	8	31431	31438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012185	TA	3	6	31522	31527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012185	TCTT	2	8	31545	31552	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_012185	C	6	6	31558	31563	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
553	NC_012185	TACT	2	8	31581	31588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
554	NC_012185	T	6	6	31646	31651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_012185	TTACTT	2	12	31693	31704	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
556	NC_012185	GTT	2	6	31730	31735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012185	AAT	3	9	31745	31753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012185	TAAA	2	8	31764	31771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_012185	TTC	2	6	31787	31792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_012185	CTA	2	6	31817	31822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_012185	AAAAT	2	10	31827	31836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012185	ACT	2	6	31844	31849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_012185	A	6	6	31852	31857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012185	TAAAAA	2	12	31864	31875	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_012185	AAC	2	6	31947	31952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_012185	AAAC	2	8	31955	31962	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_012185	TAA	2	6	32000	32005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012185	GTG	2	6	32006	32011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012185	TTA	2	6	32083	32088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012185	A	8	8	32110	32117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012185	TTTAAA	2	12	32367	32378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012185	ATT	2	6	32420	32425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012185	ATA	2	6	32444	32449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012185	TCT	2	6	32461	32466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_012185	T	7	7	32970	32976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_012185	ATT	2	6	33127	33132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012185	AAT	2	6	33152	33157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012185	TATT	2	8	33165	33172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012185	TCA	2	6	33180	33185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_012185	T	7	7	33223	33229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012185	TTTA	2	8	33245	33252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012185	TAA	2	6	33277	33282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012185	TAG	2	6	33301	33306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012185	AACTC	2	10	33372	33381	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
585	NC_012185	A	6	6	33391	33396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012185	TACT	2	8	33678	33685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_012185	A	6	6	33690	33695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012185	CCAT	2	8	33794	33801	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_012185	TTG	2	6	33805	33810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012185	TTTA	2	8	34016	34023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012185	TAA	2	6	34345	34350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012185	ATT	2	6	34353	34358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012185	A	7	7	34401	34407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012185	AATT	2	8	34465	34472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012185	A	7	7	34478	34484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_012185	T	6	6	34485	34490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_012185	ATT	2	6	34514	34519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012185	A	7	7	34534	34540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_012185	TAAA	2	8	34624	34631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012185	A	6	6	34650	34655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012185	CAT	2	6	34686	34691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_012185	ATT	2	6	34720	34725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012185	CTA	2	6	35603	35608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_012185	A	6	6	36538	36543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012185	T	6	6	36599	36604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012185	TA	3	6	36929	36934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012185	AAG	2	6	36963	36968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012185	TAT	2	6	36982	36987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012185	TAA	2	6	36991	36996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012185	ATA	3	9	37000	37008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012185	TAT	2	6	37023	37028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012185	T	6	6	37097	37102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012185	T	7	7	37151	37157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012185	CTTT	2	8	37163	37170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_012185	T	6	6	37168	37173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012185	AATT	2	8	37180	37187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_012185	TTA	2	6	37470	37475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012185	ATA	2	6	37486	37491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012185	T	7	7	37504	37510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012185	T	6	6	37566	37571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012185	T	7	7	37573	37579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_012185	ATT	2	6	38132	38137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012185	TTAAT	2	10	38145	38154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012185	TACC	2	8	38244	38251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_012185	ATT	3	9	38390	38398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012185	T	8	8	38624	38631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012185	TTG	2	6	38804	38809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012185	ATTA	2	8	38818	38825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012185	TGT	2	6	38880	38885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012185	AGCA	2	8	38929	38936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_012185	TCAA	2	8	38945	38952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_012185	A	9	9	38957	38965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012185	A	7	7	38982	38988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012185	AAT	2	6	38992	38997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_012185	A	7	7	39005	39011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_012185	AAAGA	2	10	39029	39038	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
637	NC_012185	T	7	7	39042	39048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_012185	A	6	6	39083	39088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_012185	AATT	2	8	39096	39103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_012185	ATA	2	6	39116	39121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_012185	AAT	2	6	39151	39156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_012185	ACA	2	6	39248	39253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_012185	GAT	2	6	39259	39264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_012185	AAT	2	6	39268	39273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_012185	AT	3	6	39600	39605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_012185	T	8	8	39979	39986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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