MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	TAT	3	9	92	100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012180	GTT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012180	TTC	2	6	262	267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012180	TAA	2	6	389	394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012180	TTA	2	6	395	400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012180	TAT	2	6	434	439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012180	GAA	2	6	499	504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012180	TAA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012180	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012180	TAA	2	6	1830	1835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012180	GAA	2	6	1995	2000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012180	ATT	2	6	2035	2040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012180	TAT	2	6	2922	2927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012180	ATA	2	6	2931	2936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012180	ATA	3	9	2944	2952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012180	ATT	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012180	ATT	2	6	2987	2992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012180	TTC	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012180	TAA	2	6	3081	3086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012180	CAA	2	6	3098	3103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012180	TAA	2	6	3285	3290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012180	TCT	2	6	3301	3306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012180	TGA	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012180	TTA	2	6	3423	3428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012180	ATT	2	6	3492	3497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012180	ACT	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012180	AAC	2	6	3575	3580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012180	ATT	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012180	TCT	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012180	ATA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012180	TAA	2	6	4057	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012180	ATG	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012180	ATT	2	6	4332	4337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012180	GAG	2	6	4412	4417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012180	ATT	2	6	4578	4583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012180	TCA	2	6	4598	4603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012180	ATT	2	6	4606	4611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012180	TAA	2	6	5463	5468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012180	CTA	2	6	5753	5758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012180	AAT	2	6	5782	5787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012180	AAT	2	6	5878	5883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012180	ATA	2	6	5959	5964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012180	CTA	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012180	TTA	2	6	6053	6058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012180	TAC	2	6	6073	6078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012180	TAA	2	6	6198	6203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012180	TTA	2	6	6223	6228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012180	AAC	2	6	6377	6382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012180	TAG	2	6	6389	6394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012180	AGA	2	6	6404	6409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012180	GAT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012180	ACA	2	6	6499	6504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012180	ATT	2	6	6551	6556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012180	ACA	2	6	6572	6577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012180	ATT	2	6	6578	6583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012180	ATA	2	6	6908	6913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012180	TGA	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012180	TAA	2	6	7186	7191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012180	ATT	2	6	7342	7347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012180	TTC	2	6	7385	7390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012180	ATT	2	6	7470	7475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012180	AAT	2	6	7530	7535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012180	AGT	2	6	7953	7958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012180	AGT	2	6	7987	7992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012180	TAC	2	6	8427	8432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012180	GTA	2	6	8436	8441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012180	AGC	2	6	8791	8796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012180	ACC	2	6	9027	9032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_012180	TCT	2	6	9035	9040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012180	ATT	2	6	9238	9243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012180	TAA	3	9	9249	9257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012180	ATT	2	6	9285	9290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012180	TAT	2	6	9363	9368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012180	TAT	2	6	9399	9404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012180	TAA	2	6	9419	9424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012180	TAA	2	6	9628	9633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012180	TAT	2	6	9647	9652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012180	TTC	3	9	9662	9670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012180	TAA	2	6	9723	9728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012180	TTA	2	6	9804	9809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012180	AAG	2	6	10049	10054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012180	AAT	2	6	10134	10139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012180	TTG	2	6	10199	10204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012180	TAA	2	6	10257	10262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012180	ATT	2	6	10266	10271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012180	ATT	2	6	10308	10313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012180	TAA	2	6	10444	10449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012180	TTA	2	6	10500	10505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012180	ATT	2	6	10517	10522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012180	GAT	2	6	10542	10547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012180	ATA	2	6	10587	10592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012180	GTT	2	6	10618	10623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012180	TGT	2	6	11877	11882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012180	ATT	2	6	11902	11907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012180	AAT	2	6	11945	11950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012180	TAT	2	6	12352	12357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012180	AGG	2	6	12377	12382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012180	GTT	2	6	12425	12430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012180	ATT	2	6	12448	12453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012180	ACA	2	6	12454	12459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012180	AGT	2	6	14251	14256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012180	ATT	2	6	14277	14282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012180	ATA	2	6	14344	14349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012180	TAT	2	6	14371	14376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012180	TTA	2	6	15076	15081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012180	AAT	2	6	15098	15103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012180	AAT	2	6	15441	15446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012180	ATT	2	6	15510	15515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012180	ATT	2	6	15818	15823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012180	TAA	2	6	15830	15835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012180	ATT	2	6	16542	16547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012180	TTG	2	6	16654	16659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012180	TTA	2	6	16759	16764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012180	AAT	2	6	16783	16788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012180	AGA	2	6	17764	17769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012180	ATT	2	6	17771	17776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012180	GTG	2	6	17811	17816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012180	ATG	2	6	17820	17825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012180	AAT	2	6	17834	17839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012180	GAT	3	9	17869	17877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012180	ATA	2	6	18007	18012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012180	CTT	2	6	18013	18018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012180	TGT	2	6	18040	18045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012180	AAG	2	6	18068	18073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012180	ATT	2	6	18084	18089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012180	ATA	2	6	18091	18096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012180	TAT	2	6	18108	18113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012180	ATT	2	6	18202	18207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012180	ACA	2	6	18263	18268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012180	ATA	2	6	18303	18308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012180	TTA	2	6	18343	18348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012180	ATT	2	6	18682	18687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012180	GCA	2	6	18701	18706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012180	ACT	2	6	18734	18739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012180	ATT	2	6	18812	18817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012180	TGG	2	6	18821	18826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012180	AAT	2	6	18842	18847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012180	AAG	2	6	18873	18878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012180	ATT	2	6	18917	18922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012180	TAT	2	6	19265	19270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012180	TTA	2	6	19281	19286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.