MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	AT	3	6	336	341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012177	AG	3	6	629	634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012177	CT	3	6	1218	1223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012177	TA	3	6	2953	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012177	TA	3	6	4338	4343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012177	AT	3	6	4438	4443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012177	AT	3	6	5082	5087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012177	TA	3	6	9117	9122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012177	AT	3	6	9248	9253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012177	TA	3	6	10977	10982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012177	TA	3	6	11049	11054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012177	AT	4	8	11431	11438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012177	AT	3	6	15166	15171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012177	CA	4	8	15191	15198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012177	TA	4	8	15700	15707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012177	TA	3	6	17758	17763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012177	AT	3	6	20594	20599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012177	GA	4	8	20606	20613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012177	AT	3	6	20870	20875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012177	TG	3	6	20906	20911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012177	TA	3	6	23585	23590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012177	TC	3	6	23591	23596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012177	AG	3	6	25262	25267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012177	CT	3	6	25272	25277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012177	GC	3	6	37363	37368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012177	AT	3	6	38728	38733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012177	AT	3	6	39000	39005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012177	AT	3	6	39008	39013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012177	TA	3	6	39346	39351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012177	AT	3	6	39399	39404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012177	TA	3	6	40463	40468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012177	CT	3	6	40486	40491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012177	GT	3	6	40512	40517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012177	TA	4	8	41288	41295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012177	TC	3	6	41684	41689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012177	CT	3	6	42802	42807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012177	CT	3	6	43821	43826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012177	TA	3	6	45986	45991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012177	AT	3	6	46552	46557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012177	TA	3	6	50476	50481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012177	AT	4	8	51914	51921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012177	TA	3	6	51968	51973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012177	TA	3	6	52811	52816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.