MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	CCTAA	2	10	18	27	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012177	ATAAA	2	10	138	147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012177	ATTAT	2	10	2974	2983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012177	ATTTT	2	10	9154	9163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012177	TAATA	2	10	9228	9237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012177	TATTT	2	10	11383	11392	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012177	TACTT	2	10	11473	11482	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012177	AAATA	2	10	17054	17063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012177	TTTTA	2	10	17119	17128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012177	ATTTT	2	10	17145	17154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012177	TAAAT	2	10	17291	17300	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012177	AATTT	2	10	17793	17802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012177	TGAAT	2	10	20058	20067	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012177	ATTTA	2	10	20485	20494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012177	TTAAT	2	10	25312	25321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012177	ATTTT	2	10	41373	41382	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012177	TAAAA	2	10	51568	51577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.