MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	TAAA	2	8	65	72	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012177	TTAA	2	8	277	284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012177	TAAT	2	8	364	371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012177	AATT	2	8	533	540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012177	AATT	2	8	549	556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012177	ATTA	2	8	1994	2001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012177	TAAA	2	8	4317	4324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012177	ATGT	2	8	4350	4357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012177	AAAG	2	8	4419	4426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012177	TAAA	2	8	7017	7024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012177	AAAT	2	8	8094	8101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012177	TTAT	2	8	9182	9189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012177	TGAA	2	8	11249	11256	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012177	TAAA	2	8	11325	11332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012177	ATTA	2	8	11500	11507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012177	ATTT	2	8	14679	14686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012177	TTAA	2	8	14986	14993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012177	TAAA	2	8	16350	16357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012177	ATTT	2	8	16427	16434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012177	TAAT	2	8	17014	17021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012177	GTTT	2	8	17170	17177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012177	TAAT	2	8	17276	17283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012177	TTTC	2	8	17707	17714	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012177	ATTT	2	8	17724	17731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012177	ATTA	2	8	17771	17778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012177	TTAA	2	8	17824	17831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012177	ATTT	2	8	19925	19932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012177	AGAA	2	8	20813	20820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012177	ATTG	2	8	20880	20887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012177	AAAT	2	8	20947	20954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012177	ATAA	2	8	23449	23456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012177	TTTA	2	8	23626	23633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012177	TATT	2	8	27476	27483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012177	TAAA	2	8	34939	34946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012177	TTCT	2	8	38760	38767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012177	TAAA	2	8	39374	39381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012177	TTAT	2	8	40297	40304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012177	TTTA	2	8	40541	40548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012177	ATTT	2	8	41264	41271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012177	TAAT	2	8	42706	42713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012177	ATTA	2	8	42714	42721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012177	TAAT	2	8	42737	42744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012177	ATTA	2	8	45187	45194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012177	ATTA	2	8	45204	45211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012177	TAAT	2	8	45213	45220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012177	TAAA	2	8	45258	45265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012177	TGTT	2	8	51551	51558	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012177	TTAT	2	8	51559	51566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012177	AAAT	2	8	51955	51962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.