MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	ATT	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012177	AGA	2	6	108	113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012177	ATA	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012177	CAA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012177	AAT	2	6	219	224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012177	CAA	2	6	257	262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012177	ATT	2	6	266	271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012177	TAC	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012177	TTA	2	6	584	589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012177	TTA	2	6	1133	1138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012177	AAT	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012177	TAA	3	9	1365	1373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012177	TTA	3	9	1424	1432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012177	ACT	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012177	ACT	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012177	TAA	2	6	4404	4409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012177	CAA	2	6	4428	4433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012177	ACA	2	6	4446	4451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012177	CTT	2	6	4484	4489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012177	AGA	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012177	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012177	ATT	2	6	6991	6996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012177	CTA	2	6	7006	7011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012177	TAA	2	6	9107	9112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012177	TAT	2	6	9147	9152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012177	TAT	2	6	11026	11031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012177	ATA	2	6	11259	11264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012177	TAA	2	6	11287	11292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012177	TAA	2	6	11308	11313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012177	AAT	2	6	11347	11352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012177	TAA	2	6	12767	12772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012177	AGG	2	6	14117	14122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012177	TAA	2	6	14952	14957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012177	TAC	2	6	14974	14979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012177	TTA	2	6	15074	15079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012177	ATT	2	6	15127	15132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012177	GTA	3	9	15790	15798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012177	TAA	2	6	16338	16343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012177	CCT	2	6	17000	17005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_012177	AGT	2	6	17070	17075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012177	TAA	2	6	17076	17081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012177	TAT	2	6	17134	17139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012177	TTA	2	6	17732	17737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012177	AAC	2	6	19831	19836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012177	ATT	2	6	19997	20002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012177	AAG	2	6	20505	20510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012177	TAT	2	6	20526	20531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012177	TAA	2	6	20533	20538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012177	ATA	2	6	20844	20849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012177	TAT	2	6	21529	21534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012177	TTA	2	6	21535	21540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012177	TTA	2	6	21598	21603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012177	CCT	2	6	23261	23266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012177	AAT	2	6	23279	23284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012177	ACT	2	6	23469	23474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012177	AAG	2	6	23543	23548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012177	TTG	2	6	23560	23565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012177	TAT	2	6	24518	24523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012177	ATG	2	6	25221	25226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012177	TAA	3	9	25505	25513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012177	ATA	2	6	25555	25560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012177	GGA	2	6	30797	30802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012177	TAA	2	6	32321	32326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012177	AAT	2	6	37376	37381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012177	ATT	2	6	38665	38670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012177	ATT	2	6	38742	38747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012177	AGT	2	6	38837	38842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012177	ATT	2	6	38856	38861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012177	TTC	2	6	38883	38888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012177	TAA	2	6	38960	38965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012177	TAA	2	6	39048	39053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012177	TAT	2	6	40226	40231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012177	ATT	2	6	40243	40248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012177	ATT	2	6	40254	40259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012177	ATT	2	6	40266	40271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012177	AAG	2	6	40315	40320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012177	CTT	2	6	40342	40347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012177	AGT	2	6	40362	40367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012177	ATA	2	6	40403	40408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012177	TAA	2	6	40528	40533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012177	ATT	2	6	41247	41252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012177	ATT	2	6	41328	41333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012177	ATT	2	6	41362	41367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012177	ATT	2	6	41637	41642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012177	AAG	2	6	41662	41667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012177	CAA	2	6	41678	41683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012177	ATT	3	9	42759	42767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012177	TAA	2	6	43720	43725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012177	ATT	2	6	43744	43749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012177	ATT	2	6	43765	43770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012177	AAT	2	6	43838	43843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012177	ATT	2	6	45146	45151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012177	TAA	2	6	45176	45181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012177	TAA	2	6	45998	46003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012177	AAT	2	6	46014	46019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012177	ATT	2	6	46049	46054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012177	TTA	2	6	46507	46512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012177	TAT	2	6	47381	47386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012177	AAT	2	6	47401	47406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012177	AAT	2	6	48337	48342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012177	ATT	2	6	48372	48377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012177	TAA	2	6	48398	48403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012177	AAT	2	6	49321	49326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012177	TTA	2	6	49351	49356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012177	ATA	3	9	49370	49378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012177	ATA	2	6	49403	49408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012177	ATT	2	6	49424	49429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012177	ATT	2	6	49434	49439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012177	TTG	2	6	49448	49453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012177	GAA	2	6	49495	49500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012177	TTA	2	6	49555	49560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012177	ATA	2	6	50463	50468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012177	ATT	3	9	50488	50496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012177	ATA	3	9	50499	50507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012177	ATT	2	6	50556	50561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012177	ACT	2	6	50576	50581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012177	TGT	2	6	51682	51687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012177	TTA	2	6	51721	51726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012177	TAA	3	9	51775	51783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012177	TAT	2	6	51791	51796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012177	TAA	2	6	51838	51843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012177	TTA	2	6	51847	51852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012177	ATT	2	6	52826	52831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012177	TAA	2	6	52980	52985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012177	GAT	2	6	53075	53080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012177	GAG	2	6	53115	53120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012177	TAA	2	6	53160	53165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012177	AAT	2	6	53544	53549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012177	TTA	2	6	53560	53565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.