MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	TTTA	2	8	231	238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012166	ATTT	2	8	1139	1146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012166	TAAT	2	8	1359	1366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012166	TTAA	2	8	1437	1444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012166	AATT	2	8	1749	1756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012166	TGAT	2	8	1774	1781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012166	TTAA	2	8	5763	5770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012166	TATT	2	8	5999	6006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012166	AGAA	2	8	6054	6061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012166	AATT	2	8	6227	6234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012166	TATT	2	8	6849	6856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012166	ATTT	2	8	8152	8159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012166	ATTT	2	8	8676	8683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012166	ATTT	2	8	8750	8757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012166	ATAA	2	8	8758	8765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012166	CAAT	2	8	9925	9932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012166	AATT	2	8	10516	10523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012166	ATTT	2	8	10684	10691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012166	ACCA	2	8	10760	10767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012166	ATGA	2	8	10804	10811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012166	ATTT	2	8	11982	11989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012166	TAAT	2	8	12202	12209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012166	TTAA	2	8	12288	12295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012166	AAAT	2	8	12529	12536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012166	AGTA	2	8	12555	12562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012166	AATT	2	8	12600	12607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012166	TGAT	2	8	12625	12632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012166	TATT	2	8	16836	16843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012166	AGAA	2	8	16891	16898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012166	AATT	2	8	17064	17071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012166	TATT	2	8	17685	17692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012166	ATTT	2	8	19509	19516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012166	ATTT	2	8	19583	19590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012166	ATAA	2	8	19591	19598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012166	CAAT	2	8	20765	20772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012166	AATA	2	8	21188	21195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012166	ATTT	2	8	21458	21465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012166	ACCA	2	8	21534	21541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012166	ACTA	2	8	22820	22827	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012166	AAAT	2	8	22867	22874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012166	ATAA	2	8	23518	23525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012166	AATA	2	8	23579	23586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012166	TTTA	2	8	24359	24366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012166	ATTT	2	8	25549	25556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012166	TATT	2	8	25637	25644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012166	ACTT	2	8	26457	26464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012166	ATAA	2	8	27198	27205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012166	CATA	2	8	27259	27266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012166	AAAT	2	8	30206	30213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012166	TCTT	2	8	30290	30297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012166	TGGG	2	8	30378	30385	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012166	CTTT	3	12	30723	30734	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012166	AATA	2	8	30793	30800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012166	TAAA	2	8	31001	31008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012166	TATT	2	8	31850	31857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012166	ATTA	2	8	32221	32228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012166	TTTA	2	8	32380	32387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012166	TAAA	2	8	32575	32582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012166	ATAA	2	8	32636	32643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.