MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	ACA	2	6	135	140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012166	ATT	2	6	169	174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012166	TAT	2	6	183	188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012166	TAA	3	9	189	197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012166	CTA	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012166	ATA	2	6	290	295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012166	TTA	2	6	358	363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012166	TAT	2	6	443	448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012166	TAT	2	6	539	544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012166	ATT	2	6	628	633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012166	TAG	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012166	ATG	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012166	TAA	2	6	1129	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012166	AGA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012166	GAT	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012166	TAA	2	6	1349	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012166	TAT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012166	AAT	2	6	1481	1486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012166	ACA	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012166	ATT	2	6	1684	1689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012166	ATT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012166	AGG	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012166	AAT	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012166	AAC	2	6	2498	2503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012166	TAT	2	6	2574	2579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012166	GAG	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012166	TAT	2	6	5778	5783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012166	TAA	2	6	5954	5959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012166	CAA	2	6	6019	6024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012166	TAA	2	6	6092	6097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012166	GAT	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012166	TAA	2	6	6219	6224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012166	ACT	2	6	6294	6299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012166	TAA	2	6	6381	6386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012166	ATA	2	6	6579	6584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012166	CAA	2	6	6598	6603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012166	TAT	2	6	6700	6705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012166	ATT	2	6	6780	6785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012166	TAA	3	9	6795	6803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012166	TAA	2	6	8464	8469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012166	TAA	2	6	8777	8782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012166	GAT	2	6	8802	8807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012166	TAA	2	6	8829	8834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012166	AAT	2	6	9841	9846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012166	AAC	2	6	9879	9884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012166	GTT	2	6	9913	9918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012166	AAT	2	6	9952	9957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012166	GAT	2	6	10397	10402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012166	AAT	2	6	10497	10502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012166	TTA	2	6	10565	10570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012166	TAA	2	6	10596	10601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012166	TTA	2	6	10698	10703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012166	AAT	2	6	10719	10724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012166	TAA	2	6	10783	10788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012166	TAG	2	6	10845	10850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012166	TAA	2	6	10857	10862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012166	ATA	2	6	11084	11089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012166	ATG	2	6	11500	11505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012166	TAA	2	6	11972	11977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012166	AGA	2	6	12002	12007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012166	GAT	2	6	12072	12077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012166	TAT	2	6	12183	12188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012166	TAA	2	6	12192	12197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012166	TAA	2	6	12213	12218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012166	TAT	2	6	12235	12240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012166	TGC	2	6	12490	12495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012166	ACA	2	6	12512	12517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012166	ATT	2	6	12670	12675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012166	AGG	2	6	12698	12703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012166	AAT	2	6	12804	12809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012166	AAC	2	6	13348	13353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012166	TAT	2	6	13412	13417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012166	GAG	2	6	13447	13452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012166	TTA	2	6	16748	16753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012166	TAA	2	6	16792	16797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012166	CAA	2	6	16856	16861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012166	TAA	2	6	16929	16934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012166	GAT	2	6	16959	16964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012166	TAA	2	6	17056	17061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012166	ACT	2	6	17131	17136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012166	TAA	2	6	17218	17223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012166	CAC	2	6	17358	17363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_012166	ATA	2	6	17416	17421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012166	CAA	2	6	17435	17440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012166	TAT	2	6	17536	17541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012166	ATT	2	6	17616	17621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012166	TAA	3	9	17631	17639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012166	TAA	2	6	19300	19305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012166	TCT	2	6	19518	19523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012166	TAA	2	6	19610	19615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012166	TAA	2	6	19629	19634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012166	TAA	2	6	19662	19667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012166	GAT	2	6	19668	19673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012166	GGA	2	6	19676	19681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012166	AAC	2	6	20719	20724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012166	GTT	2	6	20753	20758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012166	AAT	2	6	20792	20797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012166	ATA	2	6	21180	21185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012166	ATT	2	6	21295	21300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012166	TTA	2	6	21339	21344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012166	TAA	2	6	21370	21375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012166	TTA	2	6	21472	21477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012166	AAT	2	6	21493	21498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012166	AAT	2	6	21523	21528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012166	TAA	2	6	21557	21562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012166	ATA	2	6	21754	21759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012166	ATT	2	6	21972	21977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012166	ATT	2	6	22382	22387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012166	ACT	2	6	22834	22839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012166	TTA	2	6	22882	22887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012166	ATT	2	6	22911	22916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012166	ATT	2	6	23081	23086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012166	TTC	2	6	23094	23099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012166	TCA	2	6	23129	23134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012166	CAG	2	6	23167	23172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012166	CCT	2	6	23512	23517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_012166	CTT	2	6	23534	23539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012166	ATT	2	6	23592	23597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012166	CTA	2	6	23613	23618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012166	TTC	2	6	23621	23626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012166	CCT	2	6	23784	23789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_012166	CAA	2	6	24269	24274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012166	TAA	2	6	24371	24376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012166	TAA	2	6	25478	25483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012166	TAA	2	6	25487	25492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012166	ATT	2	6	25512	25517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012166	TCA	2	6	26130	26135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012166	TCA	2	6	26154	26159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012166	TAT	2	6	26200	26205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012166	ATT	2	6	26215	26220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012166	AAT	2	6	26241	26246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012166	TTC	2	6	26702	26707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012166	TCT	2	6	26715	26720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012166	TAA	2	6	26721	26726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012166	ATT	2	6	26758	26763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012166	AGA	2	6	27189	27194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012166	TAT	2	6	27271	27276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012166	TTA	2	6	27338	27343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012166	CTT	2	6	28382	28387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012166	ATA	2	6	28583	28588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012166	AAG	2	6	28621	28626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012166	CGC	2	6	28898	28903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_012166	AGA	2	6	28907	28912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012166	AAT	2	6	29399	29404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.