MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-2-7

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012131	AAAAG	2	10	372	381	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012131	AGAAA	2	10	626	635	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012131	AACTA	2	10	3939	3948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012131	TTTAA	2	10	5214	5223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012131	TTTTA	2	10	7716	7725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012131	CTACA	2	10	12937	12946	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_012131	AAATT	2	10	13187	13196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012131	ATAAA	2	10	14909	14918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012131	AATTT	2	10	17407	17416	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012131	TGTAG	2	10	17656	17665	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012131	ATTTT	2	10	21304	21313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012131	ATTTT	2	10	23964	23973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012131	AATTT	2	10	24295	24304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012131	AAAAG	2	10	25249	25258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012131	AAAAT	2	10	26115	26124	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012131	TAATT	2	10	27335	27344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.