MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus Q1 plasmid pBc239

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011973	GTGAA	2	10	6265	6274	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011973	TCATC	2	10	6497	6506	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011973	TAAAT	2	10	19258	19267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011973	ATTAC	2	10	26406	26415	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011973	AAAGA	2	10	33139	33148	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011973	ACCAA	2	10	33342	33351	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011973	AATCG	2	10	33356	33365	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011973	TAACA	2	10	33459	33468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011973	ATACT	2	10	36034	36043	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011973	GATTA	2	10	37389	37398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011973	TTGAT	2	10	51778	51787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011973	AAATA	2	10	52082	52091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011973	TATTG	2	10	59553	59562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011973	TAATG	2	10	63685	63694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011973	TATTT	2	10	63731	63740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011973	CAACT	2	10	64869	64878	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011973	ATGAG	2	10	69440	69449	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011973	GAATA	2	10	96699	96708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011973	TAAAC	2	10	100268	100277	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011973	ATTAT	2	10	100308	100317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011973	CTTCA	2	10	102404	102413	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011973	TTTTA	2	10	105317	105326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011973	TCCAT	2	10	105797	105806	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_011973	TCATC	2	10	109964	109973	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011973	TAATT	2	10	111486	111495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011973	TTCTC	2	10	114407	114416	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011973	AAAGA	2	10	116219	116228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011973	ATATG	2	10	116719	116728	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011973	GAAAT	2	10	116957	116966	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011973	CTATT	2	10	119588	119597	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011973	TAAAA	2	10	120526	120535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011973	ATGAT	2	10	120927	120936	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011973	TAAAA	2	10	132985	132994	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011973	TTTTC	2	10	134474	134483	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011973	CGTTC	2	10	136725	136734	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011973	CACAA	2	10	138136	138145	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011973	TAACT	2	10	146687	146696	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011973	TAAAA	2	10	149389	149398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011973	CATAT	2	10	149923	149932	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011973	ATTTT	2	10	151808	151817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011973	TAAAA	2	10	157615	157624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011973	AACAA	2	10	166959	166968	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011973	TTTTA	2	10	167069	167078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011973	AATTA	2	10	190241	190250	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011973	CATTT	2	10	191838	191847	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011973	CTTTT	2	10	194137	194146	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011973	TATTT	2	10	200733	200742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011973	ATTTT	2	10	202126	202135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011973	TATTT	2	10	205355	205364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011973	AGTAA	2	10	214157	214166	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011973	ATTTT	2	10	219966	219975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011973	AATCA	2	10	226788	226797	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011973	ACAAT	2	10	229544	229553	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011973	TTAAA	2	10	233565	233574	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011973	AAAAT	2	10	233622	233631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.