MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus Q1 plasmid pBc239

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011973	TATT	2	8	4307	4314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011973	TCTT	2	8	5622	5629	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011973	GAAG	2	8	6804	6811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011973	AGGA	2	8	6842	6849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011973	TACG	2	8	8783	8790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011973	TCTA	2	8	10785	10792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011973	ACAA	2	8	12931	12938	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011973	ACAA	2	8	14093	14100	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011973	ACAA	2	8	15154	15161	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011973	ATAA	2	8	15205	15212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011973	AGAA	2	8	15710	15717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011973	AGAA	2	8	15742	15749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011973	AGGG	2	8	19323	19330	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011973	ACAT	2	8	21080	21087	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011973	AGTT	2	8	21868	21875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011973	ATGA	2	8	21878	21885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011973	GAAT	2	8	21905	21912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011973	AGAA	2	8	21952	21959	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011973	AGAA	2	8	23669	23676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011973	TACC	2	8	24337	24344	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011973	TTTA	2	8	24419	24426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011973	TATT	2	8	26220	26227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011973	GTAT	2	8	26316	26323	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011973	ATGT	2	8	26495	26502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011973	TTTG	2	8	26552	26559	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011973	GTTT	2	8	26612	26619	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011973	TTCT	2	8	26753	26760	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011973	TGAT	2	8	30804	30811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011973	TTAA	2	8	30831	30838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011973	CATA	2	8	33180	33187	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011973	AGAA	2	8	34193	34200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011973	GAAA	2	8	34265	34272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011973	TAAA	2	8	34275	34282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011973	ATAG	2	8	34296	34303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011973	TCAT	2	8	35576	35583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011973	ATTT	2	8	35641	35648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011973	AAAT	2	8	35747	35754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011973	TTCT	2	8	35895	35902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011973	AAAG	2	8	35906	35913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011973	TAAC	2	8	36015	36022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011973	ATTA	2	8	38032	38039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011973	ATTA	2	8	38499	38506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011973	TAAC	2	8	38533	38540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011973	ATTT	2	8	38583	38590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011973	GTTT	2	8	38626	38633	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011973	TTTG	2	8	40550	40557	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011973	ATTA	2	8	40565	40572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011973	AATT	2	8	43465	43472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011973	ATTT	3	12	43737	43748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011973	AAGC	2	8	44244	44251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011973	ATTT	2	8	44952	44959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011973	TATT	2	8	45494	45501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011973	GATG	2	8	47917	47924	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011973	ATAA	2	8	48109	48116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011973	GATT	2	8	49889	49896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011973	GTTT	2	8	50278	50285	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011973	ATCC	2	8	51832	51839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011973	TGAT	2	8	52294	52301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011973	CATA	2	8	52395	52402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011973	CCTT	2	8	52904	52911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011973	AATG	2	8	53119	53126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011973	TGAA	2	8	53839	53846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011973	ATGT	2	8	57203	57210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011973	ATAA	2	8	60110	60117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011973	GGAA	2	8	60334	60341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011973	GTTT	2	8	63710	63717	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011973	AAAT	2	8	63981	63988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011973	TAAC	2	8	65037	65044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011973	ACTA	2	8	65285	65292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011973	AATT	2	8	65453	65460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011973	TAAG	2	8	70173	70180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011973	TATC	2	8	73843	73850	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011973	TGAA	2	8	75180	75187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011973	TTCC	2	8	90416	90423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011973	GGAA	2	8	90433	90440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011973	ATTG	2	8	90559	90566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011973	TTTA	2	8	91602	91609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011973	TATC	2	8	91831	91838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011973	AGTG	2	8	93088	93095	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011973	AGCT	2	8	93275	93282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011973	AACT	2	8	93288	93295	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011973	TAAA	2	8	93392	93399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011973	CTTT	2	8	93620	93627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011973	TATG	2	8	93723	93730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011973	ATTT	2	8	96556	96563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011973	ATTC	2	8	96826	96833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011973	TAAA	2	8	100373	100380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011973	TTCT	2	8	100863	100870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011973	ATAA	2	8	101070	101077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011973	TCCC	2	8	102436	102443	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_011973	TATC	2	8	103042	103049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011973	TTGT	2	8	105383	105390	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011973	CTTT	2	8	106203	106210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011973	CATT	2	8	106441	106448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011973	TAAT	2	8	107842	107849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011973	CTTC	2	8	107961	107968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011973	TATT	2	8	109838	109845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011973	TTAT	2	8	111669	111676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011973	TTAT	2	8	111898	111905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011973	CTTT	2	8	112238	112245	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011973	TTTA	2	8	112250	112257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011973	ATTA	2	8	116831	116838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011973	TAAT	2	8	116885	116892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011973	ATGA	2	8	116914	116921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011973	TATT	2	8	119694	119701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011973	ATAG	2	8	120769	120776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011973	AAAC	2	8	120858	120865	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011973	AAAT	2	8	120876	120883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011973	TGAG	2	8	123763	123770	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011973	AAAT	2	8	123816	123823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011973	CTTT	2	8	127225	127232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011973	GATA	2	8	127440	127447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011973	CATA	2	8	131147	131154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011973	TGCT	2	8	136777	136784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011973	TTAG	2	8	136975	136982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011973	TTAC	2	8	137231	137238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011973	ATAA	2	8	140693	140700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011973	ATAG	2	8	141979	141986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011973	TAAA	2	8	142577	142584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011973	CCTT	2	8	142634	142641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011973	TAAT	2	8	143196	143203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011973	TAAA	2	8	143243	143250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011973	GCTA	2	8	143295	143302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011973	AATT	2	8	143308	143315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011973	AAAT	2	8	145181	145188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011973	ATTT	2	8	145231	145238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011973	TAAA	2	8	145297	145304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011973	ACAT	2	8	145397	145404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011973	TTTA	2	8	145524	145531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011973	TCAT	2	8	145609	145616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011973	TATG	2	8	145690	145697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011973	CTTT	2	8	146664	146671	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011973	TTAT	2	8	146708	146715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011973	AAAC	2	8	149496	149503	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011973	TGAT	2	8	149630	149637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011973	TCTA	2	8	149644	149651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011973	GCTA	2	8	149709	149716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011973	ACTA	2	8	154384	154391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011973	CCTT	2	8	154437	154444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011973	ATAA	2	8	154452	154459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011973	ATTT	2	8	154657	154664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011973	ATAA	2	8	156708	156715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011973	TTCT	2	8	156727	156734	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011973	TAAA	2	8	156769	156776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011973	TCCA	2	8	156874	156881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011973	AGGG	2	8	156884	156891	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011973	ATTC	2	8	157181	157188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011973	AAAG	2	8	157510	157517	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011973	ATTA	2	8	159956	159963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011973	AAAC	2	8	160957	160964	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011973	TAAC	2	8	161692	161699	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011973	ATTT	2	8	166067	166074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011973	TTGT	2	8	166087	166094	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011973	CTAA	2	8	166133	166140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.