MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus cereus Q1 plasmid pBc53

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011971	ACC	2	6	1730	1735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_011971	AAT	2	6	1736	1741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011971	ATA	2	6	1761	1766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011971	AGC	2	6	1811	1816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011971	GGTT	2	8	1836	1843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011971	ATTAA	2	10	1853	1862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011971	TAA	2	6	1865	1870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011971	T	7	7	1894	1900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011971	AAAC	2	8	1982	1989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011971	AGGC	2	8	1997	2004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011971	TCC	2	6	3742	3747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011971	TCC	2	6	4384	4389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011971	TAA	2	6	4422	4427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011971	TTA	2	6	4440	4445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011971	CGA	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011971	CCT	2	6	4483	4488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011971	CCA	2	6	5063	5068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011971	AGAA	2	8	5103	5110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011971	AG	3	6	5903	5908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011971	TAA	2	6	5910	5915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011971	A	6	6	5914	5919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011971	TCA	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011971	TCT	2	6	5938	5943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011971	T	7	7	5943	5949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011971	TA	3	6	5970	5975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011971	TAA	2	6	5981	5986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011971	TA	3	6	6031	6036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011971	AT	3	6	6052	6057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011971	GAT	2	6	7410	7415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011971	TCT	2	6	7699	7704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011971	T	6	6	7720	7725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011971	TAA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011971	T	7	7	7976	7982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011971	ATTTT	2	10	7990	7999	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011971	AT	3	6	8011	8016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011971	GTTT	2	8	8052	8059	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011971	GTTT	2	8	8070	8077	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011971	AGG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011971	GAT	2	6	8106	8111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011971	ATTA	2	8	8581	8588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011971	TAAG	2	8	9278	9285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011971	A	7	7	9291	9297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011971	CAAA	2	8	10411	10418	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011971	AT	3	6	10459	10464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011971	CCT	2	6	10972	10977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011971	A	6	6	10997	11002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011971	CTG	3	9	11005	11013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011971	TCA	2	6	14625	14630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011971	A	6	6	21158	21163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011971	TTA	2	6	26752	26757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011971	CT	3	6	27670	27675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011971	TAA	2	6	27702	27707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011971	A	7	7	27706	27712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011971	CCT	2	6	32507	32512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011971	AGC	2	6	32550	32555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011971	TTC	2	6	33138	33143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011971	TCA	2	6	33169	33174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011971	CTTCTG	2	12	33176	33187	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011971	CTTT	2	8	33215	33222	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011971	TCC	2	6	34736	34741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011971	TCT	2	6	34744	34749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011971	TAA	2	6	34752	34757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011971	CTTC	2	8	36929	36936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011971	AT	3	6	36953	36958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011971	AT	4	8	36985	36992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011971	TCT	2	6	37081	37086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011971	ACC	2	6	37096	37101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011971	TTA	2	6	37155	37160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011971	AAC	2	6	37214	37219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011971	ATACAC	2	12	37248	37259	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011971	GAA	2	6	37368	37373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011971	T	6	6	37397	37402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011971	AGC	2	6	37411	37416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011971	CAT	2	6	38002	38007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011971	ATT	2	6	38057	38062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011971	AT	3	6	38119	38124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011971	TAA	2	6	38620	38625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011971	ACC	2	6	38636	38641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011971	CAG	2	6	38649	38654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011971	TCC	2	6	38967	38972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_011971	TA	3	6	39020	39025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011971	T	6	6	39108	39113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011971	GA	3	6	39147	39152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011971	T	6	6	39173	39178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011971	CTC	2	6	39265	39270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_011971	AAC	2	6	39331	39336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011971	AT	3	6	39455	39460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011971	GAC	2	6	39473	39478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011971	T	6	6	39490	39495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011971	AGA	2	6	39500	39505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011971	TCC	2	6	40019	40024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011971	TA	3	6	40028	40033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011971	TA	4	8	40051	40058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011971	GAA	2	6	40060	40065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011971	ATT	2	6	40116	40121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011971	T	6	6	40120	40125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011971	CT	3	6	41033	41038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011971	TCCC	2	8	42170	42177	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_011971	GTAA	2	8	42221	42228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011971	AAC	2	6	42239	42244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011971	CAAATT	2	12	42358	42369	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011971	AAC	2	6	42386	42391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011971	TCA	2	6	42561	42566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011971	T	6	6	42644	42649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011971	A	7	7	42708	42714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011971	AAT	2	6	42753	42758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011971	CAT	2	6	42768	42773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011971	AT	3	6	42772	42777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011971	GTA	2	6	42816	42821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011971	TTC	2	6	42829	42834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011971	ACG	2	6	42886	42891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011971	TAG	2	6	42897	42902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011971	TA	3	6	45791	45796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011971	TAAT	2	8	45802	45809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011971	TA	3	6	46307	46312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011971	TAT	2	6	47487	47492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011971	A	7	7	48234	48240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011971	A	7	7	48266	48272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011971	ATTCGA	2	12	48280	48291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_011971	A	6	6	48645	48650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011971	TAA	2	6	48682	48687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011971	TTAT	2	8	48703	48710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011971	TA	3	6	48728	48733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011971	TAAA	2	8	49298	49305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011971	T	7	7	49310	49316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011971	ATA	2	6	49396	49401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011971	TTAC	2	8	49417	49424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011971	ATT	2	6	50770	50775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011971	CTT	2	6	50782	50787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011971	ACT	2	6	50938	50943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011971	T	7	7	50961	50967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011971	TAA	2	6	50977	50982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011971	TTTTA	2	10	50983	50992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011971	T	6	6	50998	51003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011971	ATT	2	6	51023	51028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011971	AT	3	6	51059	51064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011971	ATTA	2	8	51080	51087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011971	ATT	2	6	51111	51116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011971	TTA	2	6	51180	51185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011971	AT	3	6	51244	51249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011971	GAA	2	6	51283	51288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011971	GGT	2	6	51295	51300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011971	TTC	3	9	51709	51717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011971	T	7	7	51773	51779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011971	AT	3	6	51805	51810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011971	ATT	2	6	51827	51832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011971	AGG	2	6	51861	51866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011971	TCT	2	6	52483	52488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011971	T	6	6	52488	52493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011971	TAAAT	2	10	52555	52564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011971	A	7	7	52569	52575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011971	CGA	2	6	52579	52584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011971	GCC	2	6	52611	52616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_011971	GTTT	2	8	52646	52653	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011971	ATCT	2	8	52667	52674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_011971	A	6	6	52694	52699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011971	AAC	2	6	52704	52709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_011971	CGGG	2	8	52737	52744	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
159	NC_011971	GGA	2	6	52752	52757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011971	T	6	6	52758	52763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.