MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 5787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011835	GCGA	2	8	441264	441271	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_011835	CAT	2	6	441288	441293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_011835	ATG	2	6	441300	441305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011835	TGG	2	6	441309	441314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011835	TTAA	2	8	441348	441355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_011835	GC	4	8	441694	441701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_011835	ACA	2	6	441720	441725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_011835	TAG	2	6	442531	442536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011835	ACT	2	6	442543	442548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_011835	AT	3	6	442572	442577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_011835	AAG	2	6	442605	442610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011835	TTC	2	6	443320	443325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_011835	GCCG	2	8	444586	444593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_011835	TC	3	6	444636	444641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_011835	AACG	2	8	444673	444680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_011835	CTA	2	6	444683	444688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_011835	TG	3	6	444689	444694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011835	GCC	3	9	444729	444737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_011835	AG	3	6	444772	444777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_011835	GC	3	6	444778	444783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_011835	CGCATC	2	12	445272	445283	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_011835	CTA	2	6	445701	445706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_011835	T	6	6	445965	445970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011835	CAC	2	6	446006	446011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_011835	TGG	2	6	446021	446026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_011835	TCG	2	6	446041	446046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_011835	GAG	2	6	446073	446078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011835	GGA	2	6	446081	446086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011835	AT	3	6	447311	447316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011835	AT	3	6	447329	447334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011835	AG	3	6	447433	447438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_011835	CG	3	6	449168	449173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_011835	AGG	2	6	449251	449256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_011835	CGC	2	6	450837	450842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_011835	AGGG	2	8	452256	452263	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011835	CAA	2	6	452270	452275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_011835	ATG	2	6	452328	452333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_011835	TTG	2	6	452339	452344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_011835	GCA	2	6	452352	452357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_011835	TCTG	2	8	452496	452503	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_011835	ATTG	2	8	452565	452572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_011835	GTC	2	6	452589	452594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_011835	ATG	2	6	452606	452611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011835	AGTT	2	8	452640	452647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011835	AGC	2	6	452650	452655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1547	NC_011835	CTG	2	6	452752	452757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_011835	ATTCG	2	10	452762	452771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1549	NC_011835	GAG	2	6	453866	453871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011835	CGC	2	6	454512	454517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_011835	CGC	2	6	454519	454524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_011835	GCACG	2	10	454576	454585	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1553	NC_011835	GGC	2	6	457586	457591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_011835	CG	3	6	457676	457681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_011835	ATA	2	6	457706	457711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011835	TTG	2	6	457717	457722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_011835	CGC	2	6	457802	457807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1559	NC_011835	GCC	2	6	458844	458849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_011835	CTT	2	6	458867	458872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_011835	GCC	2	6	461675	461680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_011835	GCT	2	6	462794	462799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_011835	CT	4	8	462812	462819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_011835	CCA	2	6	462854	462859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_011835	CAA	2	6	462888	462893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_011835	AGTG	2	8	462924	462931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011835	TG	3	6	462950	462955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011835	TCA	2	6	463036	463041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_011835	AC	3	6	463061	463066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_011835	AGG	2	6	463175	463180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_011835	GGA	2	6	466049	466054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_011835	CG	4	8	466060	466067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_011835	TTC	2	6	466074	466079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_011835	CGAG	2	8	466083	466090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_011835	GAA	2	6	466102	466107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011835	TCT	2	6	466126	466131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_011835	GGAA	2	8	466151	466158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1580	NC_011835	TTC	2	6	466228	466233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_011835	CG	3	6	467256	467261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_011835	TGCA	2	8	467262	467269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_011835	TTG	2	6	467296	467301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_011835	GCA	2	6	467351	467356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_011835	CGC	2	6	468208	468213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_011835	GAA	2	6	468219	468224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_011835	ACC	2	6	468228	468233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_011835	A	6	6	468286	468291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_011835	CGG	2	6	468354	468359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_011835	GAG	2	6	468758	468763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_011835	GCG	2	6	475322	475327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_011835	GCAT	2	8	478060	478067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_011835	GCA	2	6	478092	478097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_011835	GC	3	6	478131	478136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_011835	ATT	2	6	478178	478183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_011835	A	6	6	478186	478191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011835	GT	3	6	478244	478249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_011835	AAT	2	6	479657	479662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011835	CGC	2	6	479732	479737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_011835	AGCAA	2	10	479786	479795	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1601	NC_011835	GT	3	6	480416	480421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_011835	AAT	2	6	480439	480444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_011835	AGA	2	6	480467	480472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_011835	GT	3	6	480583	480588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011835	CGT	2	6	480946	480951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_011835	AGC	2	6	480992	480997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_011835	AGC	2	6	481014	481019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_011835	CCAT	2	8	482013	482020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_011835	AGTG	2	8	482039	482046	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011835	CAC	2	6	482047	482052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_011835	GCTGAA	2	12	482055	482066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1612	NC_011835	CAA	2	6	483143	483148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_011835	AAT	2	6	484632	484637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011835	CG	3	6	484649	484654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_011835	CTG	2	6	484699	484704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_011835	AGGC	2	8	484749	484756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_011835	GAAA	2	8	484760	484767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_011835	CAA	2	6	484928	484933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_011835	AAT	2	6	485903	485908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011835	ACA	2	6	487192	487197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_011835	AC	4	8	487263	487270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_011835	GC	3	6	490143	490148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_011835	GCAG	2	8	490156	490163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_011835	ACA	2	6	494810	494815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_011835	GCG	2	6	494822	494827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_011835	AGG	2	6	495639	495644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_011835	TCA	2	6	495661	495666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_011835	AAG	3	9	495690	495698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_011835	CCA	2	6	495725	495730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_011835	AGT	2	6	495736	495741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_011835	CGCA	2	8	495768	495775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_011835	TG	3	6	495780	495785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011835	AT	3	6	495796	495801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_011835	CG	3	6	495849	495854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_011835	AC	3	6	495881	495886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1636	NC_011835	CGTTG	2	10	496630	496639	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1895	NC_011835	GTA	2	6	566475	566480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1897	NC_011835	GGA	2	6	569804	569809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1898	NC_011835	ACCA	2	8	569823	569830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1899	NC_011835	GCGCAC	2	12	569833	569844	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1900	NC_011835	GCGT	2	8	570891	570898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1901	NC_011835	CCG	2	6	570958	570963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1904	NC_011835	CGTG	2	8	571101	571108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1905	NC_011835	GA	3	6	571148	571153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1906	NC_011835	CGA	2	6	571188	571193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1908	NC_011835	CGGC	2	8	571217	571224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1909	NC_011835	GGA	2	6	571233	571238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1910	NC_011835	CTG	2	6	571256	571261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1923	NC_011835	TGCA	2	8	575878	575885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1930	NC_011835	CTTG	2	8	580237	580244	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1931	NC_011835	ACT	2	6	580260	580265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1956	NC_011835	CA	3	6	595860	595865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1957	NC_011835	CATGC	2	10	596799	596808	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1998	NC_011835	CTTTC	2	10	606228	606237	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1999	NC_011835	CG	3	6	606296	606301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2000	NC_011835	AC	3	6	606317	606322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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