MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 5787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011835	TCCC	2	8	271214	271221	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1002	NC_011835	AG	3	6	271323	271328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011835	A	6	6	271398	271403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011835	AGT	2	6	271459	271464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011835	CAT	2	6	271465	271470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_011835	GCC	2	6	272732	272737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_011835	GCA	2	6	272796	272801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_011835	CCAT	2	8	274388	274395	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_011835	CTT	2	6	274813	274818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011835	TGC	2	6	274931	274936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_011835	AGG	2	6	274939	274944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011835	TGC	2	6	274990	274995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_011835	AG	3	6	275010	275015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011835	GTC	2	6	275061	275066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_011835	TGAT	2	8	275121	275128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011835	T	6	6	275137	275142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011835	GAC	2	6	275181	275186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_011835	GAA	2	6	275199	275204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011835	GAA	2	6	275210	275215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011835	AGGG	2	8	275224	275231	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011835	AGTGT	2	10	275261	275270	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011835	CGT	2	6	275272	275277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_011835	AGG	2	6	275291	275296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011835	GCC	2	6	276418	276423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_011835	GCTT	2	8	277019	277026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_011835	CGGGG	2	10	277157	277166	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1027	NC_011835	AGG	2	6	277192	277197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011835	GCGG	2	8	277206	277213	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_011835	GCG	2	6	278199	278204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_011835	TTCG	2	8	278205	278212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_011835	CG	3	6	278211	278216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_011835	GCT	2	6	278220	278225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_011835	GCGG	2	8	278259	278266	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_011835	TTC	2	6	278283	278288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_011835	GTT	2	6	278405	278410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011835	GA	3	6	278470	278475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011835	GCC	2	6	278481	278486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_011835	TAT	2	6	278488	278493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011835	GAAA	2	8	278505	278512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011835	AAG	2	6	278542	278547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011835	GGT	2	6	278551	278556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011835	GAT	2	6	278565	278570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011835	GAT	2	6	278581	278586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011835	TGG	2	6	278603	278608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011835	GAT	3	9	278657	278665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011835	CTC	2	6	279359	279364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_011835	CG	3	6	279402	279407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_011835	GCT	2	6	279432	279437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011835	TGTAG	2	10	279471	279480	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_011835	GCG	2	6	279524	279529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011835	CGGA	2	8	279660	279667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_011835	GCG	2	6	279717	279722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_011835	ATT	2	6	281229	281234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011835	TGA	2	6	281304	281309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011835	AGA	2	6	281313	281318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011835	TTG	2	6	281326	281331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011835	AAAG	2	8	281360	281367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011835	GCA	2	6	281530	281535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011835	CA	3	6	282925	282930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_011835	ATG	2	6	282935	282940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011835	AC	3	6	282954	282959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_011835	AAC	2	6	284651	284656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_011835	GC	3	6	284777	284782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_011835	GC	3	6	284797	284802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_011835	GGCT	2	8	284814	284821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_011835	CGA	2	6	284909	284914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011835	GAT	2	6	284915	284920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011835	TTC	2	6	284998	285003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_011835	T	6	6	285128	285133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011835	CG	3	6	285188	285193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_011835	ACG	2	6	286676	286681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_011835	CGT	2	6	286697	286702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_011835	TG	3	6	286708	286713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011835	CAA	3	9	286836	286844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_011835	TGGC	2	8	286948	286955	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_011835	GAGACG	2	12	287069	287080	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1077	NC_011835	GGC	2	6	287093	287098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_011835	GCC	2	6	287113	287118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_011835	ATGT	2	8	287137	287144	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011835	GAT	2	6	287206	287211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_011835	GCC	2	6	287246	287251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_011835	ATT	2	6	288085	288090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011835	A	6	6	288216	288221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011835	GACA	2	8	288281	288288	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_011835	AGCG	2	8	288304	288311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_011835	GC	3	6	288333	288338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_011835	ACA	2	6	288351	288356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_011835	AGG	2	6	288359	288364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011835	CG	3	6	290508	290513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_011835	GGC	2	6	290514	290519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011835	CG	3	6	290534	290539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_011835	TACC	2	8	290598	290605	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_011835	CAA	2	6	290609	290614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011835	GTT	2	6	290731	290736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011835	CTC	2	6	291062	291067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_011835	TAA	2	6	291139	291144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011835	GGT	2	6	291179	291184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011835	ACTC	2	8	291356	291363	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_011835	AGA	2	6	291377	291382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011835	ATGA	2	8	291461	291468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011835	TGAA	2	8	291472	291479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011835	GTC	2	6	291588	291593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_011835	GTC	2	6	291672	291677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_011835	GAC	2	6	291769	291774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_011835	AGGAG	2	10	291789	291798	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011835	AGGA	2	8	291803	291810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011835	AGAGGA	2	12	291811	291822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011835	AGA	2	6	291823	291828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011835	GGA	2	6	291866	291871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011835	G	11	11	291881	291891	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011835	C	7	7	291892	291898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1112	NC_011835	G	6	6	291903	291908	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011835	GCGG	2	8	293322	293329	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_011835	GAA	2	6	293377	293382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011835	GT	3	6	293390	293395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011835	TGG	2	6	293403	293408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011835	CG	4	8	293453	293460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_011835	TGCT	2	8	294860	294867	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_011835	CTG	2	6	294896	294901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011835	GGC	2	6	294904	294909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_011835	CTT	2	6	294929	294934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_011835	GTC	2	6	294949	294954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_011835	CGC	2	6	294981	294986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_011835	T	6	6	295024	295029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011835	GAC	2	6	295067	295072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011835	GC	3	6	295099	295104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_011835	CG	3	6	295117	295122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_011835	ATT	2	6	295190	295195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011835	TTTG	2	8	295207	295214	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011835	AGG	2	6	295319	295324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011835	CGCT	2	8	296419	296426	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_011835	AGA	2	6	296560	296565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011835	AGCG	2	8	296646	296653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_011835	CCCG	2	8	297689	297696	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1135	NC_011835	GC	3	6	297720	297725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_011835	GC	3	6	297743	297748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_011835	AGC	2	6	297889	297894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_011835	GGC	3	9	297984	297992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1262	NC_011835	GCC	2	6	348061	348066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1272	NC_011835	TG	3	6	349180	349185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_011835	GCC	2	6	399588	399593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_011835	GA	3	6	399614	399619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_011835	GC	3	6	399632	399637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1414	NC_011835	GC	3	6	399751	399756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1415	NC_011835	ATGT	2	8	399761	399768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1417	NC_011835	AGG	2	6	399790	399795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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