MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Tuc7 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011834	AAAATT	2	12	2135	2146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011834	ATATTT	2	12	18164	18175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011834	TAAAAA	2	12	24803	24814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011834	AATATA	2	12	27814	27825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011834	ATTAAA	2	12	76933	76944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011834	AATTAA	2	12	76981	76992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011834	ATTTTT	2	12	87629	87640	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011834	TAAAAT	2	12	87734	87745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011834	TTTATA	2	12	87881	87892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011834	AAAAAT	2	12	98914	98925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011834	TAAAAA	2	12	111436	111447	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011834	TAAAAA	2	12	127649	127660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011834	TTTATT	2	12	143711	143722	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011834	AAATAA	2	12	143787	143798	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011834	ATATTT	2	12	180416	180427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011834	ATTTTT	2	12	181979	181990	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011834	AAAAAT	2	12	182135	182146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011834	TTTTTA	2	12	182218	182229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011834	AACAAA	2	12	186533	186544	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011834	ATTACT	2	12	186627	186638	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011834	ATTTTT	2	12	193218	193229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011834	TTATAT	2	12	211743	211754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011834	AAAATT	2	12	216225	216236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011834	AGAAAA	2	12	229230	229241	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011834	TTATAT	2	12	231052	231063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011834	ATTTTA	2	12	232483	232494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011834	TTTAAA	2	12	235207	235218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011834	TATTTT	2	12	242840	242851	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011834	ATTTAA	2	12	248354	248365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011834	TATAAA	2	12	251866	251877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011834	AAATAT	2	12	251997	252008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011834	AATTAA	2	12	255513	255524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011834	AAAAAT	2	12	269359	269370	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011834	TTTTTG	2	12	304872	304883	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011834	TATTTA	2	12	307529	307540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011834	TATTTT	2	12	307702	307713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011834	ATCCAA	2	12	318531	318542	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011834	ATTTTT	2	12	319251	319262	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011834	TATTTT	2	12	319276	319287	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011834	TCATAT	2	12	320035	320046	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011834	TAATTT	2	12	331154	331165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011834	TATTTT	2	12	331359	331370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011834	TTTTAT	2	12	331410	331421	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011834	ATTTTT	2	12	332146	332157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011834	AATATA	2	12	339455	339466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011834	AATTAA	2	12	354779	354790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011834	AAATTT	2	12	359500	359511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011834	ATTTTA	2	12	371917	371928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011834	ATTTTA	2	12	415066	415077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011834	ATAAAA	2	12	441240	441251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011834	ATAAAA	2	12	463124	463135	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011834	ATTTCT	2	12	470009	470020	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011834	TATAAA	2	12	470803	470814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011834	CTATTA	2	12	489793	489804	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011834	TAATTT	2	12	491132	491143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011834	TTAAAA	2	12	519077	519088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011834	ATCATA	2	12	519538	519549	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011834	TAATAT	2	12	533536	533547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011834	ATTTTT	2	12	540416	540427	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011834	TTGATT	2	12	543384	543395	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011834	TTTAAA	2	12	568322	568333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011834	ATTTAA	2	12	569965	569976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011834	ATAAAA	2	12	573270	573281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011834	TTTTAT	2	12	573805	573816	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011834	TATTTT	2	12	575900	575911	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011834	ATTTTA	2	12	579887	579898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011834	AAAGAA	2	12	580587	580598	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011834	TTTATC	2	12	581732	581743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011834	AAAATA	2	12	581823	581834	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011834	ATATAA	2	12	582973	582984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011834	TAAAAA	2	12	584706	584717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011834	TAAAAT	2	12	584814	584825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011834	TCATAA	2	12	592589	592600	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011834	AGCAAC	2	12	623270	623281	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011834	TAAAAA	2	12	625158	625169	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011834	CTTTTT	2	12	626443	626454	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011834	AATATT	2	12	631266	631277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011834	AAAAAT	2	12	634720	634731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.