MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Tuc7 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011834	AAAGA	2	10	81	90	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011834	ATATA	2	10	14086	14095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011834	TACAA	2	10	14753	14762	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011834	ATTAA	2	10	18310	18319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011834	TTTAT	2	10	20368	20377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011834	TATTT	2	10	20681	20690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011834	TACTT	2	10	20917	20926	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011834	TATAT	2	10	20933	20942	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011834	ATTTT	2	10	23582	23591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011834	TTTTA	2	10	30720	30729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011834	TTGTA	2	10	30883	30892	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011834	TGATA	2	10	30956	30965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011834	TATAA	2	10	33504	33513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011834	ATTTT	2	10	44803	44812	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011834	TAAAA	2	10	48398	48407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011834	ATTAT	2	10	48906	48915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011834	TGTAA	2	10	52245	52254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011834	TTTAT	2	10	58924	58933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011834	AGAAT	2	10	66251	66260	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011834	ATTTT	2	10	68376	68385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011834	ATTAA	2	10	72242	72251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011834	GCATG	2	10	76392	76401	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011834	GATAT	2	10	81750	81759	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011834	ATAAA	2	10	82502	82511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011834	TTAAA	2	10	87609	87618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011834	AATAT	2	10	87720	87729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011834	TAATA	2	10	87752	87761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011834	AATAT	2	10	91544	91553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011834	CCATG	2	10	93157	93166	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011834	AATAT	2	10	101440	101449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011834	AATTA	2	10	101815	101824	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011834	TAAAT	2	10	103239	103248	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011834	TATTT	2	10	103930	103939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011834	TTTTA	2	10	111511	111520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011834	TAATT	2	10	117006	117015	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011834	ATATA	2	10	117152	117161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011834	TTGTA	2	10	127677	127686	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011834	TATAA	2	10	127811	127820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011834	TTATT	2	10	133254	133263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011834	ATTTT	2	10	154200	154209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011834	AAAAT	2	10	179706	179715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011834	AATTT	2	10	180483	180492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011834	ATTAT	2	10	181883	181892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011834	TTATT	2	10	201260	201269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011834	ACTTT	2	10	202968	202977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011834	ATATA	2	10	205203	205212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011834	TAATT	2	10	211932	211941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011834	ATTTT	2	10	212261	212270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011834	TAATA	2	10	212316	212325	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011834	TTATT	2	10	215264	215273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011834	TAATC	2	10	223807	223816	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011834	TCTTT	2	10	229267	229276	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011834	GTATT	2	10	235427	235436	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011834	TGATT	2	10	236186	236195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011834	CGTTC	2	10	243710	243719	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_011834	TAAAA	2	10	247028	247037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011834	ATGTT	2	10	250705	250714	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011834	GGAAA	2	10	251458	251467	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011834	AGATT	2	10	252155	252164	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011834	TTAAT	2	10	256367	256376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011834	TAAAA	2	10	258034	258043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011834	TAAAA	2	10	267518	267527	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011834	AATTT	2	10	269424	269433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011834	ATTTT	2	10	277719	277728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011834	ACATG	2	10	278024	278033	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011834	ATAAA	2	10	278986	278995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011834	AAAAT	2	10	280424	280433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011834	TAAAT	2	10	281518	281527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011834	ATTAG	2	10	284661	284670	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011834	ATGTA	2	10	297107	297116	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011834	AATTT	2	10	298565	298574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011834	TAAAA	2	10	299349	299358	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011834	ATTAA	2	10	304334	304343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011834	TAAAT	2	10	304705	304714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011834	TTTAT	2	10	307620	307629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011834	ATAAA	2	10	313202	313211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011834	ATAAA	2	10	315416	315425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011834	ATATT	2	10	319353	319362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011834	TAAAA	2	10	320133	320142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011834	TTAAA	2	10	326282	326291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011834	ATATT	2	10	326305	326314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011834	ATAAA	2	10	326637	326646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011834	TAATT	2	10	329595	329604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011834	TTTAA	2	10	331045	331054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011834	TAATT	2	10	331432	331441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011834	CAATT	2	10	345006	345015	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011834	ATTAT	2	10	354245	354254	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011834	TTTAT	2	10	354925	354934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011834	TATAA	2	10	359532	359541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011834	AATTA	2	10	364581	364590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011834	TAAAA	3	15	365991	366005	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011834	AAATT	2	10	369120	369129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011834	TATTT	2	10	373342	373351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011834	TAAAA	2	10	378691	378700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011834	TAAAA	2	10	386853	386862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011834	TAAAA	2	10	396600	396609	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011834	TATAT	2	10	397797	397806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011834	ATATA	2	10	397807	397816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011834	TAAAT	2	10	412484	412493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011834	TAAAA	2	10	412657	412666	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011834	AAATT	2	10	412755	412764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011834	TTTAT	2	10	415050	415059	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011834	TTTAT	2	10	416419	416428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011834	TCTAT	2	10	421916	421925	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011834	AAAAT	2	10	423515	423524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011834	AAATG	2	10	425738	425747	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011834	CTATT	2	10	425877	425886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011834	AATTA	2	10	431637	431646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011834	AAATA	2	10	433067	433076	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011834	TAATA	2	10	441252	441261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011834	TAAAA	3	15	444456	444470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011834	ATATA	2	10	447802	447811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011834	TTATT	2	10	450102	450111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011834	GTGCT	2	10	450582	450591	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011834	TTATA	2	10	452454	452463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011834	ATTAC	2	10	467423	467432	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011834	TAATA	2	10	470843	470852	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011834	TAAAT	2	10	476352	476361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011834	AAATT	2	10	476475	476484	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011834	CAAAT	2	10	476527	476536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011834	AAATT	2	10	482205	482214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011834	TTAAT	2	10	505220	505229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011834	TCTAT	2	10	509776	509785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011834	ACTAT	2	10	509786	509795	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011834	TAATA	2	10	525727	525736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011834	TTAAT	2	10	527815	527824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011834	TAATA	2	10	527935	527944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011834	TAAAA	2	10	533780	533789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011834	TAATA	2	10	537024	537033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011834	ATTTT	2	10	539509	539518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011834	CACTA	2	10	540622	540631	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_011834	TTCAG	2	10	541768	541777	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011834	TCGGT	2	10	542923	542932	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011834	CTTTT	2	10	543749	543758	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011834	ATTTA	2	10	547689	547698	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011834	TAATA	2	10	561652	561661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011834	TAAAA	2	10	566162	566171	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011834	TAAAT	2	10	566214	566223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011834	ATAAA	2	10	568542	568551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011834	AAAAT	2	10	568567	568576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011834	CAAAA	2	10	580461	580470	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_011834	ATTGC	2	10	580792	580801	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011834	TAATT	2	10	580847	580856	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011834	AAATA	2	10	581718	581727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011834	TTGAT	2	10	582067	582076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011834	TAAAA	2	10	582782	582791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011834	TTTAA	2	10	588935	588944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011834	TTATA	2	10	589008	589017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011834	GAAAA	2	10	591237	591246	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011834	CATGC	2	10	591882	591891	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
151	NC_011834	AATAA	2	10	592649	592658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011834	TTTAA	2	10	593341	593350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011834	AAATT	2	10	594547	594556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011834	TTAAA	2	10	594558	594567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011834	TAAAA	2	10	602641	602650	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011834	ATTTC	2	10	611550	611559	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_011834	TTTTA	2	10	612980	612989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011834	ACCTT	2	10	615350	615359	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
159	NC_011834	TTTAA	2	10	622470	622479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011834	TAATT	2	10	624647	624656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011834	AAAAT	2	10	627341	627350	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011834	ATTGT	2	10	631288	631297	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011834	ATTAT	2	10	634866	634875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011834	ATTAT	2	10	635050	635059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011834	ATATT	2	10	636863	636872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011834	ATTTT	2	10	641011	641020	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_011834	CAATT	2	10	641710	641719	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.