MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-3

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011781	ATAA	2	8	1734	1741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011781	GAAT	2	8	1950	1957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011781	TAAT	2	8	2104	2111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011781	TTTA	2	8	2112	2119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011781	CAAA	2	8	2135	2142	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011781	TTAA	2	8	2156	2163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011781	ATTA	2	8	2172	2179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011781	ATTT	2	8	3681	3688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011781	AGTG	2	8	3820	3827	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011781	TTCA	2	8	3982	3989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011781	TAAT	2	8	4147	4154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011781	ATTT	2	8	4342	4349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011781	CCAT	2	8	4524	4531	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011781	TAAA	2	8	4753	4760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011781	TAAA	2	8	4942	4949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011781	CCTT	2	8	5512	5519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011781	TAAT	2	8	5527	5534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011781	TAAT	2	8	5541	5548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011781	CTAG	2	8	5833	5840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011781	TAAA	2	8	5992	5999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011781	TTAT	2	8	6102	6109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011781	CTTA	2	8	7116	7123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011781	TATT	2	8	7242	7249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011781	TATT	2	8	7771	7778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011781	ATCA	2	8	7985	7992	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011781	ATTC	2	8	8040	8047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011781	TATT	2	8	8224	8231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011781	AAAT	2	8	8473	8480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011781	AGAT	2	8	8527	8534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011781	TAAA	2	8	8594	8601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011781	ATTT	2	8	8665	8672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011781	TAGT	2	8	9854	9861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011781	CTAA	2	8	12134	12141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011781	ATTT	2	8	12323	12330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011781	TAAA	2	8	12667	12674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011781	TGTT	2	8	12675	12682	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011781	CCAA	2	8	12746	12753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011781	TGAA	2	8	12762	12769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011781	TCAC	2	8	12789	12796	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011781	TTTC	2	8	12931	12938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011781	TTTC	2	8	13079	13086	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011781	TTTG	2	8	13813	13820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011781	AAAT	2	8	13919	13926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011781	TTAA	2	8	14193	14200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011781	ATTT	2	8	15061	15068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011781	CATA	2	8	15232	15239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011781	TAAT	2	8	16561	16568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011781	AGAA	2	8	16759	16766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011781	TAAA	2	8	16884	16891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011781	TAGA	2	8	17528	17535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011781	GTGA	2	8	18049	18056	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011781	AATC	2	8	18904	18911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011781	TTCT	2	8	18979	18986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011781	TTTA	2	8	19254	19261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011781	TTTA	2	8	19382	19389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011781	TTTA	2	8	19781	19788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011781	TTAA	2	8	19947	19954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011781	TTAA	2	8	20562	20569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011781	TAAT	2	8	20601	20608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011781	AAAT	2	8	20669	20676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011781	TCTT	2	8	24997	25004	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011781	CTTT	2	8	26585	26592	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.