MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-1

Total Repeats: 406

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011780	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011780	AGG	2	6	73	78	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011780	AAG	2	6	81	86	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011780	TGC	3	9	110	118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011780	TAA	2	6	155	160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011780	GAA	2	6	167	172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011780	GAT	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011780	TGC	3	9	185	193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011780	GAA	2	6	236	241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011780	TGG	2	6	242	247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011780	GCT	2	6	282	287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011780	GTT	2	6	290	295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011780	TGC	2	6	380	385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011780	GCT	2	6	390	395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011780	TTG	2	6	439	444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011780	GCT	2	6	447	452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011780	TGC	3	9	476	484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011780	AAT	2	6	495	500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011780	GTT	2	6	515	520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011780	GCT	2	6	555	560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011780	GGC	2	6	566	571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011780	GCT	3	9	624	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011780	TGC	3	9	680	688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011780	GAT	2	6	714	719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011780	AGG	2	6	733	738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011780	GAA	2	6	743	748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011780	GAT	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011780	TGC	3	9	761	769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011780	TGG	2	6	821	826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011780	AAG	2	6	856	861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011780	GTT	2	6	869	874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011780	CTG	2	6	925	930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011780	TGC	2	6	959	964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011780	GCT	2	6	969	974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011780	TTG	2	6	1018	1023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011780	GCT	2	6	1026	1031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011780	TGC	3	9	1055	1063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011780	AAT	2	6	1074	1079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011780	GTT	2	6	1094	1099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011780	GCT	2	6	1119	1124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011780	GCT	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011780	GGC	2	6	1148	1153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011780	GCT	3	9	1206	1214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011780	AGG	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011780	TGC	3	9	1262	1270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011780	GAT	2	6	1290	1295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011780	AGG	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011780	GAA	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011780	GAT	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011780	TGC	3	9	1337	1345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011780	ATG	2	6	1396	1401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011780	AAG	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011780	GTT	2	6	1442	1447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011780	GCT	4	12	1521	1532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011780	GCT	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011780	TTG	2	6	1591	1596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011780	GCT	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011780	TGC	2	6	1631	1636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011780	AAT	2	6	1647	1652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011780	GTT	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011780	TGC	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011780	GCT	2	6	1710	1715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011780	GGC	2	6	1721	1726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011780	GCT	2	6	1779	1784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011780	AAG	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011780	TGC	3	9	1835	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011780	AGG	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011780	GAA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011780	GAT	2	6	1893	1898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011780	TGC	3	9	1904	1912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011780	GAA	2	6	1955	1960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011780	TAA	2	6	1961	1966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011780	GCT	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011780	TGC	2	6	2099	2104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011780	GCT	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011780	TTG	2	6	2158	2163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011780	GCT	2	6	2166	2171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011780	TGC	3	9	2196	2204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011780	AAT	2	6	2215	2220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011780	GTT	2	6	2235	2240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011780	TGG	2	6	2262	2267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011780	GCT	2	6	2278	2283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011780	GGC	2	6	2289	2294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011780	GCT	3	9	2347	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011780	GCT	2	6	2359	2364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011780	GCT	2	6	2371	2376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011780	AGG	2	6	2384	2389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011780	AAG	2	6	2392	2397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011780	TGC	3	9	2421	2429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011780	GAT	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011780	TGC	3	9	2493	2501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011780	ATG	2	6	2552	2557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011780	GCT	2	6	2590	2595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011780	ATA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011780	GCT	2	6	2698	2703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011780	TTG	2	6	2747	2752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011780	GCT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011780	TGC	3	9	2784	2792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011780	TAC	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011780	AAT	2	6	2806	2811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011780	GTT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011780	GCT	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011780	GGC	2	6	2880	2885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011780	GCT	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011780	AGG	2	6	2957	2962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011780	TGC	3	9	2994	3002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011780	AGG	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011780	GAA	2	6	3051	3056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011780	GAT	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011780	TGC	3	9	3069	3077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011780	GAA	2	6	3120	3125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011780	TAA	2	6	3126	3131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011780	AAG	2	6	3161	3166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011780	GTT	2	6	3174	3179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011780	GAT	2	6	3259	3264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011780	GCT	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011780	TTG	2	6	3323	3328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011780	GCT	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011780	GCT	4	12	3358	3369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011780	AAT	2	6	3379	3384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011780	GTT	2	6	3399	3404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011780	TGC	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011780	TGG	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011780	GCT	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011780	GGC	2	6	3450	3455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011780	GCT	2	6	3508	3513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011780	TGC	3	9	3568	3576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011780	GAG	2	6	3593	3598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011780	GAA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011780	GAT	2	6	3632	3637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011780	TGC	3	9	3643	3651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011780	GAA	2	6	3694	3699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011780	ATG	2	6	3702	3707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011780	GCT	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011780	GTT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011780	ATA	2	6	3831	3836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011780	TGC	2	6	3838	3843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011780	TTG	2	6	3897	3902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011780	GCT	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011780	CTA	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011780	AAT	2	6	3953	3958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011780	GTT	2	6	3973	3978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011780	TGC	3	9	3991	3999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.