MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp36

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011778	AATA	2	8	89	96	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011778	ATTA	2	8	123	130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011778	GTTT	2	8	197	204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011778	TAAT	2	8	404	411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011778	AATT	2	8	602	609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011778	AGAT	2	8	770	777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011778	TGAT	2	8	803	810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011778	CTTT	2	8	839	846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011778	AAAT	2	8	1122	1129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011778	CTTT	2	8	1891	1898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011778	TTTC	2	8	2213	2220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011778	ATTA	2	8	2884	2891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011778	TTAA	2	8	2951	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011778	TAAT	2	8	3050	3057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011778	TTTC	2	8	3623	3630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011778	AATA	2	8	3718	3725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011778	AAAT	2	8	3900	3907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011778	CAAA	2	8	3970	3977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011778	TATT	2	8	4247	4254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011778	GATT	2	8	4568	4575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011778	ATTC	2	8	4818	4825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011778	TATT	2	8	4860	4867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011778	CAAA	2	8	5029	5036	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011778	TAAG	2	8	6776	6783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011778	TATT	2	8	6883	6890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011778	TAAA	2	8	6917	6924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011778	TAAT	2	8	7692	7699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011778	ATTT	2	8	8904	8911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011778	TTTA	2	8	9242	9249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011778	ATTT	2	8	9286	9293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011778	TAAA	2	8	9312	9319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011778	ATAA	2	8	9404	9411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011778	TAAA	2	8	9910	9917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011778	GCTA	2	8	10092	10099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011778	TATT	2	8	10120	10127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011778	ATAA	2	8	12148	12155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011778	AATA	2	8	12233	12240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011778	TTGT	2	8	12271	12278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011778	ATTA	2	8	12303	12310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011778	AAAT	2	8	12382	12389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011778	ATTA	2	8	12507	12514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011778	TAAA	2	8	12566	12573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011778	TAAT	2	8	13470	13477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011778	AATA	2	8	15974	15981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011778	TTAA	2	8	16913	16920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011778	TAAT	2	8	17078	17085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011778	TATT	2	8	17251	17258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011778	ATTT	2	8	17348	17355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011778	TAAT	2	8	17662	17669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011778	CTTA	2	8	18236	18243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011778	TACA	2	8	19240	19247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011778	TTTA	2	8	19308	19315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011778	ACTC	2	8	19352	19359	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011778	TCCT	2	8	19693	19700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011778	TTTA	2	8	20127	20134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011778	AAAG	2	8	20220	20227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011778	AGTA	2	8	21653	21660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011778	TGCA	2	8	21687	21694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011778	ATTT	2	8	21965	21972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011778	AATA	2	8	22877	22884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011778	TATT	2	8	23025	23032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011778	TAAG	2	8	23763	23770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011778	ACTT	2	8	23803	23810	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011778	AAGT	2	8	23819	23826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011778	AAAG	2	8	24315	24322	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011778	TTAT	2	8	24646	24653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011778	GAAT	2	8	24662	24669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011778	AATA	2	8	24866	24873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011778	AGAA	2	8	24959	24966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011778	AGAA	2	8	27180	27187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011778	TTAT	2	8	27365	27372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011778	AAGT	2	8	27373	27380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011778	TTTA	2	8	28437	28444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011778	AAGC	2	8	28821	28828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011778	ATCT	2	8	29236	29243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011778	TAAG	2	8	31181	31188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011778	TGTA	2	8	31526	31533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011778	AATA	2	8	31584	31591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011778	ATTA	2	8	31596	31603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011778	TTGC	2	8	32112	32119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011778	ATTT	2	8	32475	32482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011778	AGAT	2	8	34198	34205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011778	TAAA	2	8	34238	34245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011778	ATAA	2	8	34270	34277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011778	ATTT	2	8	34278	34285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011778	TATT	2	8	34565	34572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011778	AATT	2	8	34893	34900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011778	TATT	2	8	34965	34972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011778	AAAG	2	8	35269	35276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011778	TTTC	2	8	35490	35497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011778	ATCT	2	8	35791	35798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011778	AGGT	2	8	35874	35881	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011778	GTTT	2	8	36508	36515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.