MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp36

Total Repeats: 310

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011778	CTA	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011778	ATT	2	6	100	105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011778	AAT	2	6	133	138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011778	TAT	2	6	139	144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011778	TAA	2	6	148	153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011778	ATT	2	6	213	218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011778	GGA	2	6	223	228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011778	AAT	2	6	286	291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011778	AAG	2	6	296	301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011778	AAG	2	6	317	322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011778	CTA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011778	GAA	2	6	532	537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011778	TGA	2	6	546	551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011778	AGA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011778	TAA	2	6	644	649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011778	ATG	2	6	662	667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011778	CAT	2	6	695	700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011778	TTG	2	6	751	756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011778	AAT	2	6	760	765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011778	ATT	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011778	ATA	2	6	905	910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011778	AAG	2	6	954	959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011778	GAA	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011778	TTA	2	6	1034	1039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011778	TCA	2	6	1196	1201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011778	TTC	2	6	1232	1237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011778	AAT	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011778	TCT	2	6	1279	1284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011778	TCT	2	6	1333	1338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011778	ATT	2	6	1371	1376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011778	CTT	3	9	1436	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011778	TCT	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011778	ATA	2	6	1672	1677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011778	AAT	2	6	1678	1683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011778	ATC	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011778	ATT	2	6	1974	1979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011778	TTA	2	6	2074	2079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011778	TAT	2	6	2112	2117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011778	GCC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011778	ATT	2	6	2553	2558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011778	GAT	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011778	AGT	2	6	2623	2628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011778	TCA	2	6	2704	2709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011778	GGA	2	6	2728	2733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011778	CTT	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011778	TAA	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011778	ATT	2	6	2966	2971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011778	ATT	2	6	2977	2982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011778	TCT	2	6	3035	3040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011778	TCT	2	6	3080	3085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011778	TAA	2	6	3392	3397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011778	TTC	2	6	3560	3565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011778	TCT	2	6	3597	3602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011778	CTT	2	6	3709	3714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011778	TAG	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011778	TAT	2	6	3785	3790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011778	AAT	2	6	3864	3869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011778	TAA	2	6	3944	3949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011778	ATT	3	9	3952	3960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011778	AGA	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011778	TAA	2	6	4053	4058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011778	TAA	2	6	4079	4084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011778	TCT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011778	AGA	2	6	4107	4112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011778	TAA	3	9	4223	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011778	AAT	2	6	4349	4354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011778	AAT	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011778	AAT	2	6	4466	4471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011778	TAA	2	6	4686	4691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011778	ATA	2	6	4784	4789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011778	TAA	2	6	4792	4797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011778	TCA	2	6	4874	4879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011778	AGG	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011778	ATT	2	6	5087	5092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011778	AAT	2	6	5119	5124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011778	TTA	2	6	5256	5261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011778	CCT	2	6	6049	6054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011778	CTT	2	6	6202	6207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011778	ATT	2	6	6830	6835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011778	CTG	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011778	TGT	2	6	7063	7068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011778	TAG	2	6	7082	7087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011778	TAT	2	6	7135	7140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011778	TCT	2	6	7244	7249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011778	TAA	2	6	7368	7373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011778	TGA	2	6	7405	7410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011778	GAT	2	6	7550	7555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011778	CTC	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011778	TCA	2	6	7658	7663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011778	GAA	2	6	7738	7743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011778	ATG	2	6	7992	7997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011778	CAA	2	6	8038	8043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011778	CCT	2	6	8865	8870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011778	AAT	2	6	8877	8882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011778	TAG	2	6	8950	8955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011778	CAT	2	6	9050	9055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011778	AAG	2	6	9067	9072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011778	ATT	2	6	9108	9113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011778	ATT	2	6	9168	9173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011778	TAT	2	6	9187	9192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011778	TAT	2	6	9200	9205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011778	ATT	2	6	9265	9270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011778	TAA	3	9	9424	9432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011778	AGA	2	6	9544	9549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011778	AAG	2	6	9650	9655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011778	TAA	2	6	9661	9666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011778	AAT	2	6	9712	9717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011778	TTA	2	6	9753	9758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011778	AAC	2	6	9815	9820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011778	ATT	2	6	9842	9847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011778	ATT	2	6	9904	9909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011778	ATT	2	6	9984	9989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011778	CGA	2	6	10173	10178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011778	TAT	2	6	10264	10269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011778	ATT	2	6	11953	11958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011778	TTA	2	6	12030	12035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011778	ATT	2	6	12046	12051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011778	AGT	2	6	12112	12117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011778	TAA	2	6	12163	12168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011778	TCT	2	6	12226	12231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011778	ATT	2	6	12525	12530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011778	TAA	2	6	12541	12546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011778	TAC	2	6	13245	13250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011778	CTT	2	6	13287	13292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011778	TAC	2	6	13370	13375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011778	ATA	2	6	15817	15822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011778	TCT	2	6	15831	15836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011778	TAT	2	6	15920	15925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011778	AAT	2	6	15996	16001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011778	AAT	2	6	16105	16110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011778	AAT	2	6	16137	16142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011778	TAT	2	6	16169	16174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011778	TTA	2	6	16191	16196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011778	GTT	2	6	16950	16955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011778	ATA	2	6	17132	17137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011778	GAT	2	6	17291	17296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011778	ACT	2	6	17313	17318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011778	ATT	2	6	17373	17378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011778	TAA	2	6	17653	17658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011778	ATT	2	6	17722	17727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011778	AGA	2	6	17809	17814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011778	AAG	2	6	17829	17834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011778	ATG	2	6	17859	17864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011778	TTC	2	6	18011	18016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011778	GAT	2	6	18021	18026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011778	GAA	2	6	18072	18077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_011778	TAG	2	6	32694	32699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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308	NC_011778	ATT	2	6	36719	36724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_011778	TAT	2	6	36727	36732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_011778	CAA	2	6	36758	36763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.