MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_272

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011777	TGAAA	2	10	313	322	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011777	TTTAT	2	10	523	532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011777	TATTT	2	10	549	558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011777	ATGAT	2	10	3282	3291	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011777	AAGAA	2	10	3937	3946	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011777	TAAAA	2	10	14205	14214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011777	TTTTC	2	10	15694	15703	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011777	CGTTC	2	10	17945	17954	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011777	AATTA	2	10	25989	25998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011777	CACAA	2	10	43850	43859	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011777	CATTC	2	10	44690	44699	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011777	TAGGA	2	10	44772	44781	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011777	CACAA	2	10	45602	45611	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011777	AAAAT	2	10	48814	48823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011777	TTATT	2	10	52295	52304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011777	ATTTA	2	10	52353	52362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011777	TGATT	2	10	56372	56381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011777	TAATA	2	10	61727	61736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011777	AATTC	2	10	78720	78729	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011777	TATAA	2	10	84116	84125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011777	TTTAT	2	10	84139	84148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011777	AAAAG	2	10	84614	84623	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011777	TAATT	2	10	85741	85750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011777	AAACA	2	10	85799	85808	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011777	CTTAC	2	10	85875	85884	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011777	AAATG	2	10	86427	86436	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011777	AGTTA	2	10	88180	88189	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011777	AAACA	2	10	88224	88233	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011777	GGAGC	2	10	91766	91775	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011777	TTTTA	2	10	92843	92852	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011777	TAAAT	2	10	97807	97816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011777	TTGTG	2	10	97997	98006	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011777	TTTTA	2	10	98842	98851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011777	ATTTT	2	10	103683	103692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011777	TATAA	2	10	103733	103742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011777	AATAA	2	10	103760	103769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011777	GATAA	2	10	107697	107706	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011777	CAAAT	2	10	127806	127815	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011777	TCAAA	2	10	133813	133822	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011777	AAGAT	2	10	134607	134616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011777	ATCTT	2	10	134628	134637	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011777	TATAC	2	10	135988	135997	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011777	TTAAT	2	10	144758	144767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011777	AAGAT	2	10	145855	145864	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011777	GCAAA	2	10	149288	149297	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011777	TACTT	2	10	150552	150561	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011777	AATGT	2	10	150619	150628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011777	AAAAT	2	10	152704	152713	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011777	AATTA	2	10	154214	154223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011777	AATAA	2	10	154241	154250	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011777	TGAAA	2	10	154758	154767	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011777	AAAAT	2	10	154772	154781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011777	AATGT	2	10	155282	155291	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011777	AAATA	2	10	173895	173904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011777	TTTAT	2	10	181495	181504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011777	TATAT	2	10	186282	186291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011777	TAATT	2	10	187251	187260	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011777	ATCGA	2	10	190692	190701	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011777	AAATG	2	10	191875	191884	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011777	CTTTT	2	10	200295	200304	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011777	ACTAC	2	10	200789	200798	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_011777	GTACA	2	10	204219	204228	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011777	CTAAA	2	10	206295	206304	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011777	TAAAA	2	10	213300	213309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011777	CAAGA	2	10	213310	213319	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011777	TTTAT	2	10	213376	213385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011777	CAAAC	2	10	213672	213681	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_011777	TTTAG	2	10	216028	216037	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011777	GAAAA	2	10	216457	216466	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011777	CTTCT	2	10	218143	218152	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_011777	TTTAA	2	10	220598	220607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011777	AAACC	2	10	223565	223574	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_011777	GGTTT	2	10	223601	223610	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011777	AAAGT	2	10	225860	225869	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011777	TAAAA	2	10	226690	226699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011777	CTTTA	2	10	228974	228983	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011777	GAAGG	2	10	229190	229199	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011777	AATAA	2	10	231041	231050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011777	TTCAT	2	10	231691	231700	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011777	CTAAA	2	10	236603	236612	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011777	TTAAT	2	10	240435	240444	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011777	TTTTG	2	10	242107	242116	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011777	ATCCC	2	10	242484	242493	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_011777	TTTAG	2	10	258769	258778	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011777	AAATG	2	10	266187	266196	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011777	ATTTT	2	10	266544	266553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011777	CTTTT	2	10	267431	267440	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011777	TATCA	2	10	268728	268737	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.