MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_10

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011771	TCG	2	6	33	38	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011771	TTGT	2	8	127	134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011771	TGTC	2	8	163	170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011771	A	6	6	180	185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011771	A	6	6	198	203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011771	T	7	7	219	225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011771	TAC	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011771	TA	4	8	293	300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011771	GAA	2	6	308	313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011771	A	6	6	321	326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011771	TAA	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011771	T	6	6	898	903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011771	A	7	7	963	969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011771	TC	3	6	982	987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011771	TTG	2	6	1012	1017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011771	AGC	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011771	TCTA	2	8	1100	1107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011771	TCA	2	6	1130	1135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011771	CTG	2	6	1136	1141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011771	AT	3	6	1160	1165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011771	TA	4	8	1698	1705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011771	TTG	2	6	1716	1721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011771	AT	4	8	1730	1737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011771	T	6	6	1785	1790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011771	AATTA	2	10	1824	1833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011771	TAT	2	6	2164	2169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011771	TA	3	6	2177	2182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011771	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011771	AAT	2	6	2232	2237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011771	TAA	2	6	2312	2317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011771	CAC	2	6	2318	2323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011771	A	6	6	2335	2340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011771	TTAT	2	8	2350	2357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011771	TA	3	6	2361	2366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011771	TAT	2	6	2383	2388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011771	TCC	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011771	TA	3	6	2961	2966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011771	CTT	2	6	2975	2980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011771	CTT	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011771	AGA	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011771	T	6	6	3030	3035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011771	T	7	7	3054	3060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011771	TAA	2	6	3089	3094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011771	ATA	2	6	3669	3674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011771	AAAG	2	8	3796	3803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011771	ACAAT	2	10	3850	3859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011771	A	7	7	3880	3886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011771	CAA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011771	TCA	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011771	T	6	6	3935	3940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011771	T	6	6	3959	3964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011771	CAA	2	6	4009	4014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011771	ACAA	2	8	4038	4045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011771	TTA	2	6	4062	4067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011771	TGC	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011771	TAA	2	6	4150	4155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011771	AAT	2	6	4197	4202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011771	TA	4	8	4247	4254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011771	TAT	2	6	4271	4276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011771	CAA	2	6	5117	5122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011771	GTT	2	6	5129	5134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011771	A	6	6	5165	5170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011771	ATGA	2	8	5183	5190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011771	AGG	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011771	TTA	2	6	5894	5899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011771	A	6	6	5940	5945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011771	AAT	2	6	5984	5989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011771	GTT	2	6	6043	6048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011771	T	7	7	6058	6064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011771	T	7	7	6154	6160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011771	T	6	6	6237	6242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011771	TCG	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011771	TACT	2	8	6368	6375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011771	TTGCT	2	10	6394	6403	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011771	TGTC	2	8	6407	6414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011771	A	6	6	6442	6447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011771	ATA	2	6	6461	6466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011771	A	6	6	6466	6471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011771	GAAC	2	8	6500	6507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011771	T	6	6	6512	6517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011771	GTT	2	6	6543	6548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011771	TAC	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011771	TA	4	8	6590	6597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011771	AAAG	2	8	6617	6624	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011771	AGGGT	2	10	6648	6657	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011771	CA	3	6	6671	6676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011771	TGT	2	6	6679	6684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011771	A	6	6	6700	6705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011771	ATA	2	6	6712	6717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011771	A	11	11	6717	6727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011771	TCC	2	6	7424	7429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011771	CAA	2	6	7444	7449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011771	T	6	6	7459	7464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011771	T	7	7	7570	7576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011771	AAC	2	6	7594	7599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011771	CCA	2	6	9105	9110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011771	CGA	2	6	9149	9154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011771	A	6	6	9260	9265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011771	CTG	2	6	9288	9293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011771	CCTC	2	8	9351	9358	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_011771	A	7	7	9461	9467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011771	TCT	2	6	9516	9521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011771	AAT	2	6	9525	9530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011771	ATT	2	6	9541	9546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011771	TAC	2	6	9550	9555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011771	TTA	2	6	9558	9563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011771	T	7	7	9588	9594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011771	ACCAT	2	10	9633	9642	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011771	CAA	2	6	9753	9758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011771	ATA	2	6	9915	9920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011771	ATTT	2	8	9949	9956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011771	CAG	2	6	9957	9962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011771	T	7	7	10017	10023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011771	ATA	2	6	10037	10042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011771	A	6	6	10071	10076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011771	T	7	7	10100	10106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011771	A	6	6	10112	10117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011771	TAA	2	6	10130	10135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011771	TA	4	8	10162	10169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011771	AT	3	6	10170	10175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011771	T	7	7	10175	10181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011771	AGG	2	6	10194	10199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011771	AAC	2	6	10216	10221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011771	T	8	8	10234	10241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011771	AAT	2	6	10243	10248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011771	TCC	2	6	10287	10292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011771	ACTT	2	8	10293	10300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.