MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-4

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011736	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011736	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011736	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011736	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011736	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011736	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011736	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011736	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011736	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011736	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011736	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011736	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011736	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011736	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011736	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011736	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011736	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011736	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011736	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011736	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011736	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011736	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011736	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011736	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011736	GAA	3	9	1161	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011736	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011736	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011736	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011736	AGG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011736	AGG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011736	G	6	6	7819	7824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011736	TAAAG	2	10	11937	11946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011736	TA	3	6	15197	15202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011736	TAAAAA	2	12	15212	15223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011736	ATA	2	6	16550	16555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011736	CTA	2	6	17110	17115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011736	AT	3	6	17127	17132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011736	ATA	2	6	17141	17146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011736	TAA	2	6	17170	17175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011736	TAA	3	9	17192	17200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011736	A	7	7	17199	17205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011736	TCAA	2	8	17845	17852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011736	ATT	2	6	17867	17872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011736	AGC	2	6	17881	17886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011736	TCC	2	6	18864	18869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011736	TTTA	2	8	18870	18877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011736	TAA	2	6	18879	18884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011736	TA	3	6	18890	18895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011736	T	6	6	18917	18922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011736	A	6	6	18937	18942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011736	TAT	3	9	18997	19005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011736	T	6	6	19005	19010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011736	TAAA	2	8	19020	19027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011736	TGTAG	2	10	19067	19076	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011736	ATCA	2	8	19094	19101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011736	TAA	2	6	19145	19150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011736	T	7	7	19164	19170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011736	ATTAT	2	10	19204	19213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011736	ATT	2	6	19219	19224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011736	TAAA	2	8	19231	19238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011736	AAAT	2	8	21678	21685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011736	AGG	2	6	21695	21700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011736	AAC	2	6	22416	22421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011736	TAAT	2	8	22425	22432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011736	ATAG	2	8	22478	22485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011736	ATAG	2	8	22499	22506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011736	ATAG	2	8	22532	22539	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011736	A	6	6	22566	22571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011736	AT	3	6	22584	22589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011736	A	6	6	22620	22625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011736	AT	3	6	22638	22643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011736	A	6	6	22674	22679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011736	AT	3	6	22692	22697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011736	A	6	6	22726	22731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011736	GCAA	2	8	22742	22749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011736	TAA	2	6	22770	22775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011736	TCTAT	2	10	22800	22809	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011736	TAA	2	6	22813	22818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011736	T	6	6	22822	22827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011736	TAA	2	6	22857	22862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011736	TA	3	6	22868	22873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011736	T	6	6	22898	22903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011736	TTTTA	2	10	22927	22936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011736	AAT	2	6	22947	22952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011736	TAAGC	2	10	23008	23017	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011736	TTA	2	6	23026	23031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011736	TAA	2	6	23051	23056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011736	TATT	2	8	23063	23070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011736	ATA	2	6	23071	23076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011736	ATATGT	2	12	23117	23128	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011736	A	7	7	23135	23141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011736	T	7	7	23220	23226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011736	T	6	6	23233	23238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011736	A	6	6	23241	23246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011736	TA	3	6	23269	23274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011736	TTAT	2	8	23276	23283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011736	TAAA	2	8	23287	23294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011736	GGA	2	6	23295	23300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011736	A	6	6	24642	24647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011736	A	7	7	24650	24656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011736	AGG	2	6	24669	24674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011736	ATTA	2	8	24675	24682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011736	AAGTAA	2	12	25925	25936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011736	TAA	2	6	25945	25950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011736	T	6	6	26060	26065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011736	AAGA	2	8	26079	26086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011736	AT	3	6	26103	26108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011736	AATTT	2	10	26123	26132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011736	GTG	2	6	26161	26166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011736	GA	3	6	26178	26183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011736	TA	3	6	26250	26255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011736	TATT	2	8	26276	26283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011736	TTTA	2	8	28313	28320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011736	TA	3	6	28319	28324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011736	CT	3	6	28325	28330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011736	TAA	2	6	28916	28921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011736	AATA	2	8	28927	28934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011736	ATA	2	6	28964	28969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011736	GTT	2	6	29016	29021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011736	CAAA	2	8	29624	29631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011736	ACA	2	6	29639	29644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011736	AAAT	2	8	29662	29669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011736	TTC	2	6	29707	29712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011736	AATT	2	8	29713	29720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011736	GAA	2	6	29732	29737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011736	A	7	7	29757	29763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011736	AAT	2	6	29786	29791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011736	AGA	2	6	29796	29801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011736	TAA	2	6	29902	29907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011736	TAT	2	6	29911	29916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011736	CTT	2	6	29978	29983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011736	AT	3	6	30019	30024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011736	TGAT	2	8	30027	30034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011736	TGG	2	6	30055	30060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011736	TAT	2	6	30190	30195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011736	ATC	2	6	30213	30218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011736	ATA	2	6	30249	30254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011736	TA	3	6	30336	30341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011736	CAT	2	6	30351	30356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011736	AGCA	2	8	30388	30395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011736	AAAT	2	8	30414	30421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011736	TGA	2	6	30427	30432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011736	TGA	2	6	30520	30525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011736	TAT	2	6	30530	30535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011736	TAT	2	6	30577	30582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011736	ATA	2	6	30645	30650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011736	TGG	2	6	30661	30666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011736	AAG	2	6	30691	30696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011736	TAA	2	6	30742	30747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011736	AAC	2	6	30760	30765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_011736	A	6	6	30788	30793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011736	AGT	2	6	30812	30817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011736	TCT	2	6	30818	30823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_011736	ATG	3	9	30867	30875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011736	GCA	2	6	30893	30898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_011736	TGT	2	6	30906	30911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011736	AG	3	6	30923	30928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.