MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp26

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011724	TAA	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011724	ACA	2	6	55	60	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011724	ATA	2	6	123	128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011724	ATT	2	6	223	228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011724	TTA	2	6	770	775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011724	ATA	2	6	2297	2302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011724	TTA	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011724	ATA	2	6	2360	2365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011724	TCC	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011724	TAT	2	6	3857	3862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011724	TAA	2	6	3925	3930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011724	ATA	2	6	3953	3958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011724	TAA	2	6	3981	3986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011724	ATT	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011724	ATA	2	6	4039	4044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011724	ATT	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011724	TAA	2	6	5874	5879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011724	ATA	3	9	5922	5930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011724	AGA	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011724	ATT	2	6	6021	6026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011724	GTC	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011724	ATA	2	6	6076	6081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011724	TAA	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011724	ATT	2	6	6279	6284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011724	AAT	2	6	6314	6319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011724	TTA	2	6	6416	6421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011724	TAA	2	6	6437	6442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011724	GAA	2	6	6448	6453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011724	TAA	2	6	6482	6487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011724	TAA	2	6	6595	6600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011724	ATT	2	6	6621	6626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011724	CAA	2	6	7751	7756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011724	ATA	2	6	8774	8779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011724	TTG	2	6	10766	10771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011724	AAT	2	6	10781	10786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011724	AAT	2	6	10840	10845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011724	ATA	3	9	11458	11466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011724	ATT	2	6	11528	11533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011724	TAA	2	6	11746	11751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011724	ATT	2	6	11798	11803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011724	TAA	2	6	11815	11820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011724	ATT	2	6	11871	11876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011724	AAT	2	6	11913	11918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011724	TAA	2	6	11930	11935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011724	ATT	2	6	13704	13709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011724	ATT	3	9	13715	13723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011724	AGA	2	6	13828	13833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011724	TTA	2	6	16702	16707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011724	TTG	2	6	16862	16867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011724	TAA	2	6	16871	16876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011724	AGG	2	6	16890	16895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011724	TAG	2	6	17838	17843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011724	GTT	2	6	17874	17879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011724	CTC	2	6	19348	19353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011724	TAA	3	9	19407	19415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011724	AAT	3	9	20838	20846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011724	ATA	2	6	21339	21344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011724	TGA	2	6	24532	24537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011724	AAT	2	6	24599	24604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011724	TAT	2	6	24783	24788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011724	TAA	2	6	24823	24828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011724	CAT	2	6	24849	24854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011724	CAG	2	6	24927	24932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011724	AGA	2	6	24997	25002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011724	GCT	2	6	25139	25144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011724	AGT	2	6	25153	25158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011724	GGA	2	6	25337	25342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011724	TTG	2	6	25356	25361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011724	ATA	2	6	25386	25391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011724	GAA	2	6	25527	25532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011724	CAC	2	6	25607	25612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011724	AAC	2	6	25704	25709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011724	TGT	2	6	25774	25779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011724	GCG	2	6	25802	25807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011724	CTA	2	6	25862	25867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011724	GCA	2	6	25931	25936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011724	TTA	2	6	25945	25950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011724	TCT	2	6	26112	26117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011724	ATG	2	6	26210	26215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011724	GGA	2	6	26270	26275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011724	ATA	2	6	26280	26285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011724	GGA	2	6	26423	26428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011724	ATA	2	6	26436	26441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.