MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp26

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011724	TAA	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011724	ACA	2	6	55	60	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011724	T	6	6	101	106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011724	ATA	2	6	123	128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011724	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011724	CTTT	2	8	183	190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011724	A	6	6	209	214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011724	ATT	2	6	223	228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011724	A	6	6	264	269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011724	TA	3	6	759	764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011724	TTA	2	6	770	775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011724	AT	3	6	802	807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011724	A	7	7	825	831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011724	A	6	6	2228	2233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011724	A	7	7	2245	2251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011724	TA	3	6	2258	2263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011724	TTAAA	2	10	2264	2273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011724	TA	3	6	2275	2280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011724	ATA	2	6	2297	2302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011724	TTA	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011724	ATA	2	6	2360	2365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011724	TAAA	2	8	2378	2385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011724	A	7	7	2400	2406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011724	CT	3	6	2424	2429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011724	A	7	7	2466	2472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011724	TCC	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011724	TAAT	2	8	3836	3843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011724	TAT	2	6	3857	3862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011724	TC	3	6	3874	3879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011724	TAAT	2	8	3902	3909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011724	TAA	2	6	3925	3930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011724	TAAT	2	8	3938	3945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011724	ATA	2	6	3953	3958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011724	AT	3	6	3972	3977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011724	TAA	2	6	3981	3986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011724	ATT	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011724	AT	3	6	4002	4007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011724	TATAA	2	10	4010	4019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011724	AT	3	6	4030	4035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011724	ATA	2	6	4039	4044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011724	ATT	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011724	TAAA	2	8	4060	4067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011724	TAA	2	6	5874	5879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011724	ATA	3	9	5922	5930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011724	CT	3	6	5946	5951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011724	AT	3	6	5982	5987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011724	AGA	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011724	ATT	2	6	6021	6026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011724	GTC	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011724	ATA	2	6	6076	6081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011724	T	7	7	6128	6134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011724	AATTTA	2	12	6193	6204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011724	A	8	8	6210	6217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011724	TAA	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011724	T	6	6	6246	6251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011724	ATT	2	6	6279	6284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011724	TAAAA	2	10	6297	6306	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011724	A	7	7	6303	6309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011724	AAT	2	6	6314	6319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011724	TTA	2	6	6416	6421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011724	TAA	2	6	6437	6442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011724	GAA	2	6	6448	6453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011724	A	7	7	6475	6481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011724	TAA	2	6	6482	6487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011724	AAAAT	2	10	6493	6502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011724	T	8	8	6508	6515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011724	AT	3	6	6546	6551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011724	TAA	2	6	6595	6600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011724	ATT	2	6	6621	6626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011724	AAATT	2	10	6633	6642	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011724	TA	3	6	6651	6656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011724	CAA	2	6	7751	7756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011724	ACTTT	2	10	7758	7767	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011724	T	6	6	7765	7770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011724	ATA	2	6	8774	8779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011724	A	6	6	10685	10690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011724	A	7	7	10710	10716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011724	TA	3	6	10725	10730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011724	TA	3	6	10737	10742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011724	TTG	2	6	10766	10771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011724	AAT	2	6	10781	10786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011724	AAT	2	6	10840	10845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011724	ATTT	2	8	10880	10887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011724	AAAT	2	8	10896	10903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011724	A	6	6	10915	10920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011724	A	7	7	11435	11441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011724	ATA	3	9	11458	11466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011724	T	6	6	11469	11474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011724	T	6	6	11509	11514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011724	ATT	2	6	11528	11533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011724	AT	3	6	11582	11587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011724	TTTAG	2	10	11682	11691	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011724	T	6	6	11705	11710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011724	ATTT	2	8	11725	11732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011724	T	7	7	11730	11736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011724	A	6	6	11740	11745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011724	TAA	2	6	11746	11751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011724	TAAA	2	8	11755	11762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011724	ATAA	2	8	11779	11786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011724	ATT	2	6	11798	11803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011724	T	6	6	11802	11807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011724	TAA	2	6	11815	11820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011724	AGCA	2	8	11830	11837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011724	ATT	2	6	11871	11876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011724	ATTTT	2	10	11901	11910	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011724	AAT	2	6	11913	11918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011724	TAA	2	6	11930	11935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011724	AT	3	6	11958	11963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011724	AAATTT	2	12	11979	11990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011724	ATT	2	6	13704	13709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011724	ATT	3	9	13715	13723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011724	A	7	7	13757	13763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011724	TATT	2	8	13786	13793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011724	AGA	2	6	13828	13833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011724	GTTA	2	8	13860	13867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011724	T	6	6	13884	13889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011724	TTA	2	6	16702	16707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011724	TTG	2	6	16862	16867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011724	TAA	2	6	16871	16876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011724	ATAA	2	8	16880	16887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011724	AGG	2	6	16890	16895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011724	A	6	6	17573	17578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011724	AAGA	2	8	17609	17616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011724	T	6	6	17821	17826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011724	TAG	2	6	17838	17843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011724	GTT	2	6	17874	17879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011724	T	6	6	17913	17918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011724	T	8	8	17959	17966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011724	CTC	2	6	19348	19353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011724	ATTTT	2	10	19356	19365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011724	TATT	2	8	19388	19395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011724	TAA	3	9	19407	19415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011724	AT	3	6	19417	19422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011724	AAT	3	9	20838	20846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011724	ATA	2	6	21339	21344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011724	TTATA	2	10	21876	21885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011724	TAAAG	2	10	23202	23211	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011724	TAAA	2	8	23212	23219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011724	TGA	2	6	24532	24537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011724	ATTT	2	8	24576	24583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011724	ATTTA	2	10	24588	24597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011724	AAT	2	6	24599	24604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011724	T	6	6	24681	24686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011724	A	6	6	24757	24762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011724	TAT	2	6	24783	24788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011724	ATTA	2	8	24793	24800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011724	TAAT	3	12	24804	24815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011724	TAA	2	6	24823	24828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011724	CAT	2	6	24849	24854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011724	ATCTAT	2	12	24859	24870	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_011724	A	6	6	24885	24890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011724	CAG	2	6	24927	24932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011724	AGA	2	6	24997	25002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011724	GCT	2	6	25139	25144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_011724	AGT	2	6	25153	25158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011724	TA	3	6	25199	25204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011724	CTGCAA	2	12	25269	25280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_011724	TC	3	6	25314	25319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_011724	GGA	2	6	25337	25342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011724	TTG	2	6	25356	25361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011724	TCTT	2	8	25365	25372	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_011724	ATA	2	6	25386	25391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011724	T	6	6	25415	25420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011724	ATTT	2	8	25486	25493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011724	GAA	2	6	25527	25532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011724	CAC	2	6	25607	25612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_011724	AAAT	2	8	25659	25666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_011724	AT	3	6	25692	25697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_011724	AAC	2	6	25704	25709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_011724	T	6	6	25757	25762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_011724	TGT	2	6	25774	25779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011724	GCG	2	6	25802	25807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_011724	A	8	8	25841	25848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_011724	CTA	2	6	25862	25867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_011724	GCA	2	6	25931	25936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_011724	TTA	2	6	25945	25950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_011724	TA	3	6	25954	25959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_011724	AC	3	6	25991	25996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_011724	TCT	2	6	26112	26117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_011724	GAAGA	2	10	26181	26190	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
181	NC_011724	A	6	6	26202	26207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011724	ATG	2	6	26210	26215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_011724	A	6	6	26223	26228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011724	GGA	2	6	26270	26275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
185	NC_011724	ATA	2	6	26280	26285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_011724	TACA	2	8	26287	26294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
187	NC_011724	A	7	7	26392	26398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_011724	GGA	2	6	26423	26428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
189	NC_011724	ATA	2	6	26436	26441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_011724	ATATA	2	10	26481	26490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.