MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-9

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011722	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011722	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011722	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011722	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011722	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011722	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011722	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011722	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011722	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011722	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011722	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011722	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011722	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011722	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011722	TGG	2	6	1028	1033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011722	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011722	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011722	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011722	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011722	GGA	2	6	3964	3969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011722	TAG	2	6	6764	6769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011722	ATT	2	6	6775	6780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011722	TGC	2	6	6830	6835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011722	TAA	2	6	6863	6868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011722	GAA	2	6	6912	6917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011722	GAA	2	6	6981	6986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011722	TGT	2	6	7070	7075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011722	TTA	2	6	7078	7083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011722	GAT	2	6	7104	7109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011722	TAA	2	6	7136	7141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011722	TTG	2	6	7360	7365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011722	CTT	2	6	7416	7421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011722	AAG	2	6	7456	7461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011722	ATT	2	6	7527	7532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011722	TTA	2	6	7537	7542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011722	ATT	2	6	7668	7673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011722	TAC	2	6	7781	7786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011722	TTA	2	6	8281	8286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011722	TTA	2	6	8517	8522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011722	TTG	2	6	8534	8539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011722	AAT	2	6	8541	8546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011722	AAT	2	6	8626	8631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011722	TTG	2	6	8642	8647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011722	TCA	2	6	8701	8706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011722	AAG	2	6	12017	12022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011722	AAG	2	6	12098	12103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011722	AAT	2	6	12334	12339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011722	AAC	2	6	12357	12362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011722	AGG	2	6	12429	12434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011722	TGA	2	6	14017	14022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011722	TAC	2	6	14072	14077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011722	TAA	2	6	14116	14121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011722	TAC	2	6	14132	14137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011722	AAG	2	6	14197	14202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011722	ATT	2	6	14290	14295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011722	TAA	2	6	14319	14324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011722	AAC	2	6	14353	14358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011722	AGG	2	6	14361	14366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011722	TGA	2	6	14376	14381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011722	TGA	2	6	14400	14405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011722	AGA	2	6	14406	14411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011722	TGA	2	6	14475	14480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011722	GAA	2	6	14599	14604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011722	CTA	2	6	14675	14680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011722	ATC	2	6	14730	14735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011722	ATG	2	6	14753	14758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011722	TCT	2	6	14773	14778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011722	AAC	2	6	14807	14812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011722	GAA	2	6	14843	14848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011722	TAA	2	6	14922	14927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011722	TAG	2	6	15100	15105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011722	ATA	2	6	16564	16569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011722	CTA	2	6	17145	17150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011722	ATA	2	6	17176	17181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011722	TAA	2	6	17205	17210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011722	TAA	3	9	17227	17235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011722	TGC	2	6	17724	17729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011722	TAT	2	6	17849	17854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011722	ATC	2	6	17958	17963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011722	ATT	2	6	17967	17972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011722	AAT	2	6	18006	18011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011722	TAT	2	6	18020	18025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011722	TGT	2	6	18030	18035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011722	CTT	2	6	18071	18076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011722	TAA	3	9	18088	18096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011722	AAT	2	6	18144	18149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011722	ATT	2	6	18150	18155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011722	ATT	2	6	18255	18260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011722	TGC	2	6	18270	18275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011722	CAA	2	6	18350	18355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011722	TAA	2	6	18476	18481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011722	TCT	2	6	18571	18576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011722	TTC	2	6	18643	18648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011722	ATT	3	9	18705	18713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011722	TCC	2	6	18737	18742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_011722	TAA	2	6	18755	18760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011722	CTT	2	6	18794	18799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011722	TAC	2	6	18920	18925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011722	GTA	2	6	18933	18938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011722	TAA	2	6	19011	19016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011722	TAA	2	6	22574	22579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011722	AAT	2	6	22664	22669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011722	TAA	2	6	22769	22774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011722	ATA	2	6	22789	22794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011722	AAT	2	6	22818	22823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011722	ATT	2	6	22992	22997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011722	AGG	2	6	23010	23015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011722	AGG	2	6	24386	24391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011722	TAA	2	6	25662	25667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011722	AGA	2	6	25767	25772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011722	ATT	2	6	25995	26000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011722	TGT	2	6	26004	26009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011722	TAG	2	6	27698	27703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011722	GTT	2	6	28374	28379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011722	ATA	2	6	28467	28472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011722	TAA	2	6	28488	28493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011722	ACA	2	6	29142	29147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011722	TTC	2	6	29210	29215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011722	GAA	2	6	29235	29240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011722	AAT	2	6	29289	29294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011722	TAA	2	6	29405	29410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011722	ATT	2	6	29415	29420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011722	CTT	2	6	29481	29486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011722	TGG	2	6	29558	29563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011722	AGG	2	6	29656	29661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011722	TAT	2	6	29693	29698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011722	ATC	2	6	29716	29721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011722	ATA	2	6	29752	29757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011722	CAT	2	6	29854	29859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011722	TGA	2	6	29930	29935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011722	TGA	2	6	30023	30028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011722	TAT	2	6	30033	30038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011722	TAT	2	6	30080	30085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011722	ATA	2	6	30148	30153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011722	TGG	2	6	30164	30169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011722	ATA	2	6	30199	30204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011722	TAA	2	6	30245	30250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011722	AAC	2	6	30263	30268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011722	AGT	2	6	30315	30320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011722	TCT	2	6	30321	30326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011722	ATG	3	9	30370	30378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011722	GCA	2	6	30396	30401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011722	TGT	2	6	30409	30414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.