MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-3+10

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011720	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011720	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011720	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011720	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011720	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011720	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011720	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011720	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011720	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011720	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011720	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011720	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011720	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011720	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011720	ATG	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011720	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011720	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011720	TAA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011720	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011720	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011720	CAA	2	6	2089	2094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011720	ATT	2	6	2114	2119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011720	TGA	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011720	TAA	2	6	5813	5818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011720	GCA	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011720	TGA	2	6	5877	5882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011720	TTA	2	6	6692	6697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011720	TAA	2	6	6709	6714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011720	TAA	2	6	6739	6744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011720	ATA	2	6	6749	6754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011720	CTA	2	6	7932	7937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011720	ATA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011720	TAA	3	9	8014	8022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011720	ATC	2	6	8638	8643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011720	CAT	3	9	8739	8747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011720	TAT	2	6	8781	8786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011720	GTT	2	6	8887	8892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011720	TAA	2	6	9285	9290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011720	ATT	2	6	9424	9429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011720	ATT	2	6	9442	9447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011720	TAA	2	6	9489	9494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011720	TAT	2	6	9576	9581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011720	CTA	2	6	9582	9587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011720	TAA	2	6	9757	9762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011720	TAA	2	6	9820	9825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011720	ATT	2	6	9829	9834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011720	TAA	2	6	12251	12256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011720	TGA	2	6	13479	13484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011720	TAT	2	6	13489	13494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011720	ATT	2	6	13624	13629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011720	ATT	2	6	13645	13650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011720	TAA	2	6	13652	13657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011720	TTA	2	6	13681	13686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011720	AAT	2	6	13688	13693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011720	AGG	2	6	13924	13929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011720	AAT	3	9	13954	13962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011720	CAA	2	6	14008	14013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011720	AAT	2	6	14031	14036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011720	TCT	2	6	14047	14052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011720	AGT	2	6	14107	14112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011720	TTG	2	6	14204	14209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011720	ATA	2	6	14354	14359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011720	ATT	2	6	14408	14413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011720	CAA	2	6	14450	14455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011720	TAA	3	9	14472	14480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011720	AGT	2	6	14530	14535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011720	TGC	2	6	14665	14670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011720	TAA	2	6	14731	14736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011720	TTG	2	6	14838	14843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011720	TAG	2	6	14850	14855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011720	ACT	2	6	15187	15192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011720	CAA	2	6	15195	15200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011720	AGG	2	6	15301	15306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011720	AGT	2	6	16666	16671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011720	TTA	2	6	16827	16832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011720	ATT	2	6	16909	16914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011720	GTT	2	6	17787	17792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011720	TAG	2	6	17918	17923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011720	TAA	2	6	17956	17961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011720	TAT	2	6	17977	17982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011720	TTA	2	6	19959	19964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011720	ATT	2	6	19974	19979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011720	TAA	2	6	19980	19985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011720	AAG	2	6	19986	19991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011720	AGA	2	6	23294	23299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011720	AGG	2	6	23306	23311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011720	ATT	2	6	30230	30235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011720	TAA	2	6	35483	35488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011720	AAG	2	6	35591	35596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011720	AAT	3	9	36343	36351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011720	CTC	2	6	37311	37316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011720	TTC	2	6	37321	37326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011720	TAA	2	6	37495	37500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011720	TTG	2	6	37600	37605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011720	TAA	2	6	37610	37615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011720	AAT	2	6	41370	41375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011720	GTG	2	6	41401	41406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011720	ATT	2	6	41435	41440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011720	TTA	2	6	41522	41527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011720	GAA	2	6	41618	41623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011720	GGA	2	6	43001	43006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011720	AGT	2	6	44365	44370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011720	ACA	2	6	45276	45281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011720	TTA	2	6	45305	45310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011720	AGG	2	6	45345	45350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011720	TTA	2	6	45898	45903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011720	CTA	2	6	45976	45981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011720	TAT	2	6	46033	46038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011720	TCT	2	6	46086	46091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011720	AAT	2	6	46102	46107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011720	TAA	2	6	46124	46129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011720	CAA	2	6	46164	46169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.