MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus AH187 chromosome

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011658	CTATTA	2	12	1856	1867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011658	TTTCGT	2	12	10907	10918	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011658	TTTCGT	2	12	30684	30695	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011658	CTTTTT	2	12	74482	74493	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011658	TTATAT	2	12	82177	82188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011658	AGTCAA	2	12	93147	93158	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011658	TTTAAT	2	12	100882	100893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011658	ACATAA	2	12	165569	165580	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011658	AATACA	2	12	169366	169377	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011658	GTATGT	2	12	183037	183048	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011658	TATGTT	2	12	188879	188890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011658	AAAATA	2	12	215614	215625	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011658	AAGGGG	2	12	215698	215709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011658	TTTCAT	2	12	235133	235144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011658	TTTTGA	2	12	238937	238948	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011658	AGAAGT	2	12	303816	303827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011658	TATATT	2	12	342897	342908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011658	TATAAA	2	12	349676	349687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011658	AAAAAT	2	12	365662	365673	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011658	AATAGA	2	12	365908	365919	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011658	ATTTGA	2	12	367434	367445	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011658	ATTTAG	2	12	386251	386262	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011658	TCGTGC	2	12	418018	418029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011658	AGTTAA	2	12	443706	443717	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011658	TATGTT	2	12	449904	449915	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011658	TTTATA	2	12	471925	471936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011658	AAAAAT	2	12	479884	479895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011658	ATTTTT	2	12	505041	505052	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011658	CCAATT	2	12	510904	510915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011658	TTTTCT	2	12	528238	528249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011658	TAAAAA	2	12	579917	579928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011658	ACATAT	2	12	587589	587600	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011658	TAAAGA	2	12	599081	599092	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011658	ATCATT	2	12	624823	624834	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011658	TACGAT	2	12	693721	693732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011658	AAGAGT	2	12	725200	725211	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011658	ACTTAA	2	12	781678	781689	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011658	TTCTGC	2	12	791897	791908	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011658	TTTTTA	2	12	793474	793485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011658	TGTTCA	2	12	800216	800227	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011658	CCATTG	2	12	801330	801341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011658	AGTTTA	2	12	802869	802880	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011658	TTAAAA	2	12	803243	803254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011658	ATCAAT	2	12	862471	862482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011658	AATTAT	2	12	865533	865544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011658	GTATAT	2	12	875085	875096	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011658	ATAAAA	2	12	878488	878499	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011658	ACATTT	2	12	881719	881730	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011658	ATAAGT	2	12	881793	881804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011658	TTGATT	2	12	895162	895173	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011658	ATGTAA	2	12	898393	898404	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011658	CTTAAA	2	12	907253	907264	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011658	TTAAAG	2	12	915136	915147	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011658	TTTTAT	2	12	942166	942177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011658	AGAAAA	2	12	947238	947249	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011658	AAATGT	2	12	959828	959839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011658	ACGAGA	2	12	959877	959888	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011658	GTTTTT	2	12	965431	965442	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011658	GTATAT	2	12	976225	976236	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011658	AAGTAG	2	12	994711	994722	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011658	AGAAAT	2	12	1058160	1058171	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011658	TGAGAA	2	12	1079138	1079149	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011658	AAACAA	2	12	1084665	1084676	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011658	TATAGT	2	12	1096646	1096657	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011658	TACTTT	2	12	1096749	1096760	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_011658	AAAATG	2	12	1116671	1116682	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011658	TCTTTT	2	12	1119328	1119339	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011658	TCAAAC	2	12	1125503	1125514	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011658	AAATTT	2	12	1136004	1136015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011658	TAATTT	2	12	1141922	1141933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011658	CCTTTT	2	12	1160518	1160529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011658	TAATAT	2	12	1169766	1169777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011658	TCCATT	2	12	1171060	1171071	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011658	ATATGA	2	12	1187010	1187021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011658	AATAAA	2	12	1192754	1192765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011658	TTTATT	2	12	1211401	1211412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011658	AATATG	2	12	1212541	1212552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011658	TATTTT	2	12	1212915	1212926	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011658	CTTTTT	2	12	1245067	1245078	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011658	AAATAT	2	12	1264363	1264374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011658	AAGTAT	2	12	1293556	1293567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011658	ATTTGA	2	12	1338298	1338309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011658	GGAGAG	2	12	1341427	1341438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011658	AAATAA	2	12	1343803	1343814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011658	AAATTT	2	12	1349669	1349680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011658	GGATAA	2	12	1397699	1397710	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011658	AATGAA	2	12	1408640	1408651	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011658	AAAAGT	2	12	1409622	1409633	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011658	TTTACT	2	12	1418060	1418071	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011658	ATCAAT	2	12	1429772	1429783	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011658	ATTATA	2	12	1442781	1442792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011658	GAAAGG	2	12	1453333	1453344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011658	ATACAA	2	12	1467645	1467656	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_011658	TATAGA	2	12	1478393	1478404	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011658	GTTTTT	2	12	1489200	1489211	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011658	TTATCA	2	12	1505072	1505083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_011658	TTTTAT	2	12	1548122	1548133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011658	GAAATA	2	12	1589868	1589879	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011658	TTTTTA	2	12	1614051	1614062	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011658	ATTTTT	2	12	1649728	1649739	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011658	TTTCTA	2	12	1694074	1694085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011658	CTTTTG	2	12	1695228	1695239	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_011658	TTAAAT	2	12	1707618	1707629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011658	TATAAC	2	12	1707679	1707690	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_011658	GAAAAA	2	12	1718926	1718937	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011658	TTTATT	2	12	1736921	1736932	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011658	TGTTTT	2	12	1804774	1804785	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011658	TTTTTA	2	12	1823444	1823455	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011658	ATAATT	2	12	1863210	1863221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011658	TGAAAT	2	12	1887798	1887809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011658	ATATAA	2	12	1917315	1917326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011658	TATTGT	2	12	1917892	1917903	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011658	GAAAGA	2	12	1940053	1940064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011658	TGAAGT	2	12	1944064	1944075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011658	AAAAAT	2	12	1944858	1944869	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011658	TATGAA	2	12	1954398	1954409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011658	TCATAT	2	12	1958085	1958096	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_011658	AAAAAT	2	12	1986279	1986290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011658	TATAAT	2	12	1991392	1991403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011658	ATTCTT	2	12	2025235	2025246	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011658	CATATA	2	12	2035730	2035741	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_011658	ATTATA	2	12	2049604	2049615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011658	ATGAGT	2	12	2055629	2055640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011658	TAAATA	2	12	2108102	2108113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011658	AAATAT	2	12	2126597	2126608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011658	GTGGAA	2	12	2155636	2155647	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011658	TGATTG	2	12	2155796	2155807	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011658	TGGAAA	2	12	2182140	2182151	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011658	TATAAT	2	12	2220668	2220679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.