MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_45

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011656	GAG	2	6	177	182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011656	CTT	2	6	1402	1407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011656	ATG	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011656	GTG	2	6	1574	1579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011656	ACC	2	6	1607	1612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011656	ATT	2	6	1814	1819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011656	ATT	2	6	2518	2523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011656	AAT	2	6	2892	2897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011656	AAT	2	6	2966	2971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011656	AGG	2	6	5837	5842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011656	GGA	2	6	6041	6046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011656	TCC	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011656	AGG	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011656	GAA	2	6	6358	6363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011656	GGA	2	6	14876	14881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011656	TGA	2	6	18376	18381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011656	TAC	2	6	18435	18440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011656	GAT	2	6	18585	18590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011656	GGA	2	6	19731	19736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011656	GAG	2	6	20340	20345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011656	ATG	2	6	20789	20794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011656	ATT	2	6	20812	20817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011656	CAT	2	6	20845	20850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011656	AGT	2	6	21076	21081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011656	GAT	2	6	21115	21120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011656	TAT	2	6	21231	21236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011656	TAT	2	6	21245	21250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011656	TCT	2	6	21265	21270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011656	AGA	2	6	21706	21711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011656	AGA	2	6	21760	21765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011656	TAT	2	6	21872	21877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011656	TTC	2	6	21996	22001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011656	AGG	2	6	22495	22500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011656	AAG	2	6	23492	23497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011656	CTT	2	6	23510	23515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011656	TCC	2	6	23651	23656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011656	AAT	2	6	24252	24257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011656	TCC	2	6	24312	24317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011656	TGT	2	6	24390	24395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011656	GAA	2	6	24437	24442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011656	AAT	2	6	25451	25456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011656	GAT	2	6	25519	25524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011656	CAT	2	6	25543	25548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011656	ATC	2	6	25557	25562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011656	CCT	2	6	27252	27257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011656	AAT	2	6	27262	27267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011656	ATT	2	6	27287	27292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011656	AAT	2	6	27296	27301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011656	ACA	2	6	27512	27517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011656	AGG	2	6	27525	27530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011656	AGG	2	6	28117	28122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011656	AGG	2	6	28391	28396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011656	AGT	2	6	28906	28911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011656	AGG	2	6	28963	28968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011656	GAA	2	6	29422	29427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011656	AAG	2	6	31250	31255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011656	TTG	2	6	31390	31395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011656	GTA	2	6	32012	32017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011656	AAT	2	6	32647	32652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011656	CCT	2	6	32695	32700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011656	AGT	2	6	32715	32720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011656	AGG	2	6	33125	33130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011656	GTT	2	6	36069	36074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011656	CAT	2	6	36745	36750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011656	ACA	2	6	36751	36756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011656	GAA	2	6	36857	36862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011656	AAT	2	6	36864	36869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011656	TGG	2	6	36876	36881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011656	ATG	2	6	36899	36904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011656	TCC	2	6	37480	37485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011656	TAA	2	6	37560	37565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011656	AAC	2	6	37630	37635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011656	TAT	2	6	38367	38372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011656	AAC	2	6	38406	38411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011656	CCT	2	6	39977	39982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011656	ATT	2	6	39987	39992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011656	TTA	2	6	41462	41467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011656	TCA	2	6	41884	41889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011656	ATG	2	6	43073	43078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011656	GCC	3	9	43120	43128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_011656	ATG	2	6	43289	43294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011656	ATC	2	6	43301	43306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011656	ATA	2	6	43399	43404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011656	AGA	2	6	43518	43523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011656	GAA	2	6	43567	43572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011656	TTC	2	6	43705	43710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011656	ATA	2	6	43800	43805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011656	ATA	2	6	43811	43816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011656	ATT	2	6	43896	43901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011656	CCT	2	6	44932	44937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011656	GTC	2	6	45100	45105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011656	GTT	2	6	45153	45158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.