MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 8471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011593	GAG	2	6	1165621	1165626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_011593	ATGG	2	8	1165649	1165656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_011593	GGT	2	6	1165667	1165672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_011593	ACC	2	6	1165678	1165683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_011593	A	6	6	1165720	1165725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_011593	T	6	6	1165764	1165769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_011593	TCT	2	6	1166789	1166794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_011593	CAG	2	6	1166927	1166932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_011593	CGGTG	2	10	1166998	1167007	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3510	NC_011593	AGG	2	6	1167133	1167138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_011593	GCC	2	6	1167174	1167179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_011593	GGC	2	6	1167224	1167229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_011593	CTT	2	6	1167296	1167301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_011593	GGTTTT	2	12	1168200	1168211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_011593	ATT	2	6	1168214	1168219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_011593	GTT	2	6	1169598	1169603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_011593	CTT	2	6	1169617	1169622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_011593	AGA	2	6	1169634	1169639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_011593	CAA	2	6	1169759	1169764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_011593	AGA	2	6	1169800	1169805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_011593	CAT	2	6	1169808	1169813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_011593	ATT	2	6	1170005	1170010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_011593	TTA	2	6	1170012	1170017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_011593	GGA	2	6	1170027	1170032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_011593	GAA	2	6	1170063	1170068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_011593	CTGG	2	8	1170132	1170139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3527	NC_011593	CTG	2	6	1170168	1170173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_011593	CTG	2	6	1170715	1170720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_011593	TTTG	2	8	1170778	1170785	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_011593	TTTA	2	8	1170792	1170799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_011593	CAG	2	6	1170840	1170845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_011593	AAGG	2	8	1170850	1170857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_011593	GCT	2	6	1170860	1170865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_011593	A	6	6	1170869	1170874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_011593	CA	3	6	1170957	1170962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_011593	GGA	2	6	1171022	1171027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_011593	GTA	2	6	1171040	1171045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_011593	AGGCC	2	10	1171059	1171068	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3539	NC_011593	CGA	2	6	1171109	1171114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_011593	CCT	2	6	1171128	1171133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_011593	CAT	2	6	1171170	1171175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_011593	TCT	2	6	1171266	1171271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_011593	TGG	3	9	1171296	1171304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_011593	ATG	2	6	1171333	1171338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_011593	CCG	2	6	1171362	1171367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_011593	CTGG	2	8	1171369	1171376	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_011593	TTCG	2	8	1171429	1171436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_011593	GGC	2	6	1172495	1172500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_011593	GGAT	2	8	1172555	1172562	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_011593	GGC	2	6	1172575	1172580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_011593	TGC	2	6	1172635	1172640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_011593	CAC	2	6	1172659	1172664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_011593	CAT	2	6	1172675	1172680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_011593	GTG	2	6	1172743	1172748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_011593	ATT	2	6	1172761	1172766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_011593	A	6	6	1172846	1172851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_011593	CTA	2	6	1172859	1172864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_011593	ATG	2	6	1173394	1173399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_011593	GGAT	2	8	1173454	1173461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_011593	CTT	2	6	1173484	1173489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_011593	ACA	2	6	1173544	1173549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_011593	TCT	2	6	1173613	1173618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_011593	C	6	6	1173792	1173797	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3564	NC_011593	ATC	2	6	1173817	1173822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_011593	AGG	2	6	1174109	1174114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_011593	ATGA	3	12	1174129	1174140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_011593	TCC	2	6	1175530	1175535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_011593	TCG	2	6	1175582	1175587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_011593	CTG	2	6	1175607	1175612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_011593	GTC	2	6	1175797	1175802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_011593	CGA	2	6	1175832	1175837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_011593	TG	3	6	1175853	1175858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_011593	CCCGGC	2	12	1175884	1175895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_011593	CGC	2	6	1175919	1175924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_011593	CGT	3	9	1175928	1175936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_011593	TGG	2	6	1176357	1176362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_011593	T	6	6	1176368	1176373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_011593	AT	3	6	1176384	1176389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_011593	GAAG	2	8	1176412	1176419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_011593	CATA	2	8	1176922	1176929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_011593	T	7	7	1176954	1176960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_011593	TGAT	2	8	1176976	1176983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_011593	CGA	2	6	1177324	1177329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_011593	CTC	2	6	1177430	1177435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_011593	GTC	2	6	1177490	1177495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_011593	GTC	2	6	1177514	1177519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_011593	GAA	2	6	1177528	1177533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_011593	GT	3	6	1177579	1177584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_011593	GTT	2	6	1177898	1177903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_011593	GCCGG	2	10	1179228	1179237	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3591	NC_011593	ATCT	2	8	1179266	1179273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3592	NC_011593	GCG	2	6	1179286	1179291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_011593	GGCAA	2	10	1179392	1179401	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3594	NC_011593	GGC	2	6	1179415	1179420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_011593	GAT	2	6	1179450	1179455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_011593	TTC	2	6	1179489	1179494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_011593	AGG	2	6	1179495	1179500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_011593	GATG	2	8	1179508	1179515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_011593	GAT	2	6	1179654	1179659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_011593	CTT	2	6	1182384	1182389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_011593	ACT	2	6	1182443	1182448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_011593	ATA	2	6	1182462	1182467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_011593	ATA	2	6	1182471	1182476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_011593	CCA	2	6	1182492	1182497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_011593	TTTGA	2	10	1182526	1182535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_011593	GA	3	6	1182733	1182738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_011593	GGT	2	6	1182739	1182744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_011593	TGA	2	6	1183235	1183240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_011593	GGAT	2	8	1183306	1183313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_011593	AAG	2	6	1183444	1183449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_011593	TG	3	6	1183483	1183488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_011593	TCC	2	6	1183526	1183531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_011593	TG	3	6	1183573	1183578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_011593	ACC	2	6	1184788	1184793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_011593	AC	3	6	1184796	1184801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_011593	AGA	2	6	1187781	1187786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_011593	GGCA	2	8	1187787	1187794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_011593	CGT	2	6	1189832	1189837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_011593	TGG	2	6	1189870	1189875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_011593	GCG	2	6	1191017	1191022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_011593	CA	3	6	1191023	1191028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_011593	CGC	2	6	1191043	1191048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_011593	A	6	6	1192022	1192027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_011593	CT	3	6	1192035	1192040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_011593	ACCG	2	8	1192073	1192080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_011593	CGG	2	6	1192083	1192088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_011593	GCC	2	6	1192115	1192120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_011593	GGCG	2	8	1192121	1192128	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_011593	CAA	2	6	1192231	1192236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_011593	TGG	2	6	1192672	1192677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_011593	GCC	2	6	1193988	1193993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3753	NC_011593	AAC	2	6	1233455	1233460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3895	NC_011593	CCT	2	6	1306298	1306303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3972	NC_011593	TGG	2	6	1334737	1334742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3992	NC_011593	AT	3	6	1351469	1351474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3993	NC_011593	CCG	2	6	1351571	1351576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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