MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 8471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011593	GC	3	6	463875	463880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_011593	GTG	2	6	466036	466041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011593	TGC	2	6	466049	466054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_011593	TTG	2	6	466065	466070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011593	GT	3	6	466091	466096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_011593	CGT	2	6	466113	466118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_011593	GT	3	6	466162	466167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_011593	ACG	2	6	466207	466212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_011593	ATG	2	6	466220	466225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_011593	AAG	2	6	466255	466260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_011593	GGT	2	6	466562	466567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011593	CGC	2	6	467766	467771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_011593	CAC	2	6	468991	468996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_011593	GCA	2	6	470371	470376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_011593	GCT	2	6	470379	470384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_011593	ACGG	2	8	470395	470402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_011593	CTGT	2	8	470504	470511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_011593	CTGT	2	8	470518	470525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_011593	CGC	2	6	470546	470551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_011593	T	9	9	470695	470703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_011593	G	10	10	470704	470713	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011593	ATATGT	2	12	470732	470743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011593	TGT	2	6	470767	470772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011593	GAA	2	6	470839	470844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011593	CGA	2	6	470912	470917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_011593	AAACC	2	10	470929	470938	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1527	NC_011593	GGA	2	6	471068	471073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011593	TGCG	2	8	471099	471106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_011593	GAA	2	6	471133	471138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011593	ATC	2	6	471200	471205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_011593	ATG	2	6	471221	471226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_011593	TGA	2	6	471236	471241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_011593	GTG	2	6	472125	472130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_011593	GGAT	2	8	472166	472173	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011593	TGA	2	6	472206	472211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011593	CTT	2	6	473053	473058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_011593	GTC	2	6	473830	473835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_011593	AAG	2	6	473954	473959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_011593	CTT	2	6	473981	473986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_011593	ACGA	2	8	474031	474038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_011593	GTGGC	2	10	474065	474074	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1542	NC_011593	TCA	2	6	474131	474136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_011593	GGC	2	6	474167	474172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_011593	TCG	2	6	474216	474221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_011593	GCA	2	6	475551	475556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_011593	CA	3	6	475555	475560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_011593	AAG	2	6	475604	475609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_011593	GAC	2	6	476969	476974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_011593	G	6	6	478271	478276	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011593	CGTCT	2	10	478294	478303	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1551	NC_011593	CCG	2	6	478314	478319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_011593	TC	3	6	479348	479353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_011593	CA	3	6	479361	479366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_011593	GCC	2	6	479416	479421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_011593	GT	3	6	479433	479438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011593	AGG	2	6	479518	479523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_011593	CG	3	6	479610	479615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_011593	GAC	2	6	479724	479729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_011593	TGGCT	2	10	479771	479780	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_011593	CGG	2	6	479848	479853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_011593	GCGCC	2	10	479896	479905	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1562	NC_011593	CTGA	2	8	479947	479954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_011593	TGTTC	2	10	479959	479968	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1564	NC_011593	TGA	2	6	480043	480048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011593	GGAAT	2	10	480051	480060	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011593	GC	3	6	481801	481806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_011593	TGT	2	6	481814	481819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011593	GGTC	2	8	481825	481832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_011593	GAG	2	6	481888	481893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_011593	CTGA	2	8	481906	481913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_011593	TC	4	8	481920	481927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_011593	ATT	2	6	483499	483504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_011593	CAC	2	6	485418	485423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_011593	CGG	3	9	485442	485450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_011593	ACT	2	6	485452	485457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_011593	AAT	2	6	485460	485465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_011593	CCT	2	6	485486	485491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_011593	TCG	2	6	485526	485531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_011593	CAG	2	6	485545	485550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_011593	CCG	2	6	485573	485578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_011593	CTG	2	6	485653	485658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_011593	GCA	2	6	485688	485693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_011593	GCCC	2	8	485741	485748	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1584	NC_011593	AAT	2	6	485815	485820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011593	GCC	2	6	485855	485860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_011593	CGG	2	6	485915	485920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_011593	ACGC	2	8	485970	485977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_011593	GCA	2	6	486023	486028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_011593	TGA	2	6	486435	486440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_011593	GTTTCG	2	12	486481	486492	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1591	NC_011593	ATG	2	6	486516	486521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011593	GCA	2	6	486549	486554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_011593	GAG	2	6	486563	486568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011593	GCC	2	6	488356	488361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_011593	CGACA	2	10	488364	488373	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1596	NC_011593	TGT	2	6	488395	488400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011593	GCCG	2	8	488453	488460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_011593	CTT	2	6	489617	489622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_011593	GAT	2	6	489625	489630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_011593	TGA	2	6	489673	489678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_011593	CT	3	6	489704	489709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_011593	GGC	2	6	489720	489725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_011593	CAC	2	6	489731	489736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_011593	TAAG	2	8	489817	489824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011593	TCCA	2	8	489876	489883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_011593	CATTA	2	10	489961	489970	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1607	NC_011593	GTT	3	9	490013	490021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011593	CAA	2	6	490030	490035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_011593	GTCCTT	2	12	490049	490060	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_011593	GAC	2	6	490152	490157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_011593	CCG	2	6	490166	490171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_011593	AGAA	2	8	490182	490189	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011593	ACCGGA	2	12	491441	491452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_011593	CAAC	2	8	491473	491480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_011593	AC	3	6	491498	491503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_011593	CCGG	2	8	492909	492916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_011593	GCC	2	6	492921	492926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_011593	AAT	2	6	492962	492967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011593	CGA	2	6	493058	493063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_011593	GTCA	2	8	493104	493111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_011593	A	6	6	493111	493116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_011593	CT	3	6	493138	493143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_011593	CG	3	6	493165	493170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_011593	TGCGT	2	10	495017	495026	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1625	NC_011593	GC	3	6	495084	495089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_011593	TGTC	2	8	495110	495117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_011593	TCA	2	6	495246	495251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_011593	CAT	2	6	495256	495261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_011593	CGG	2	6	495265	495270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_011593	GCC	3	9	495315	495323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_011593	CGC	2	6	495335	495340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_011593	AGC	2	6	495346	495351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_011593	TGC	2	6	495365	495370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_011593	GTC	2	6	495396	495401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1657	NC_011593	GCC	2	6	496426	496431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1760	NC_011593	CA	3	6	522784	522789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1761	NC_011593	AT	3	6	522819	522824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1762	NC_011593	AT	3	6	522832	522837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_011593	AG	3	6	597165	597170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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