MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 8471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011593	GAATG	2	10	324056	324065	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011593	CGC	2	6	326212	326217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_011593	GCG	2	6	326240	326245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_011593	GAA	2	6	326284	326289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011593	TA	3	6	326336	326341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011593	GTG	2	6	326357	326362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011593	GCC	2	6	326379	326384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_011593	A	6	6	326440	326445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011593	AGG	2	6	326466	326471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011593	TGC	3	9	326483	326491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_011593	GC	3	6	326490	326495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_011593	ACGA	2	8	329315	329322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_011593	CCGT	2	8	329359	329366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_011593	TGCTG	2	10	330894	330903	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_011593	ATG	2	6	330953	330958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011593	GCG	2	6	331667	331672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_011593	GAT	2	6	331680	331685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011593	GCT	2	6	331700	331705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_011593	GTC	2	6	332569	332574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_011593	GCG	2	6	332576	332581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_011593	ATT	2	6	332606	332611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011593	CGG	2	6	332661	332666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_011593	AATCG	2	10	333395	333404	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1024	NC_011593	CGA	2	6	333466	333471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_011593	CGC	2	6	334128	334133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_011593	CGA	2	6	334222	334227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_011593	CAC	2	6	334774	334779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_011593	TCC	2	6	334866	334871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_011593	GGA	2	6	334880	334885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011593	CT	3	6	337085	337090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_011593	CTTCGT	2	12	337134	337145	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_011593	GTT	2	6	337149	337154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011593	CG	3	6	337179	337184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_011593	TGT	2	6	337186	337191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011593	CTG	2	6	337193	337198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_011593	CGG	2	6	337294	337299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_011593	CA	3	6	337401	337406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_011593	ATC	3	9	340430	340438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_011593	CGG	2	6	340499	340504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_011593	GCCGC	2	10	340534	340543	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1041	NC_011593	GCC	2	6	340646	340651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_011593	ACG	2	6	340659	340664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_011593	CGA	2	6	340669	340674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_011593	A	6	6	340722	340727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011593	CTG	2	6	340840	340845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_011593	TG	3	6	340884	340889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011593	CTT	2	6	340892	340897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_011593	A	6	6	340898	340903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011593	TCT	2	6	340926	340931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011593	GCA	2	6	340949	340954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011593	GGGA	2	8	341025	341032	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011593	TCA	2	6	341039	341044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_011593	TCA	2	6	341069	341074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_011593	TGC	2	6	341136	341141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_011593	AT	3	6	341185	341190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011593	TCCC	2	8	341223	341230	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1057	NC_011593	TCC	2	6	341233	341238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_011593	GGT	2	6	341245	341250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011593	AG	3	6	341277	341282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011593	GCA	2	6	341288	341293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_011593	CGG	2	6	341348	341353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_011593	TCC	2	6	341779	341784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_011593	TTTTA	2	10	341818	341827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011593	GT	3	6	341905	341910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011593	CAG	2	6	341963	341968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_011593	ACA	2	6	342009	342014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011593	CCT	2	6	342060	342065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_011593	A	6	6	342091	342096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011593	GCC	2	6	342097	342102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_011593	GGC	2	6	342109	342114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_011593	CCA	2	6	343203	343208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_011593	TTG	2	6	343212	343217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011593	GGC	2	6	343221	343226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_011593	TAG	2	6	343239	343244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011593	TGTT	2	8	343359	343366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011593	ATT	2	6	343410	343415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011593	CAT	2	6	344751	344756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_011593	GT	3	6	344765	344770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011593	TAG	2	6	344799	344804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011593	TTCT	2	8	344896	344903	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_011593	AGCC	2	8	344950	344957	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_011593	CAA	2	6	345027	345032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_011593	TCG	2	6	345067	345072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_011593	GCA	2	6	345107	345112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_011593	TCC	2	6	345117	345122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_011593	AGA	2	6	345138	345143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_011593	GCA	2	6	345171	345176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_011593	GAAG	2	8	345180	345187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011593	TTC	2	6	345210	345215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_011593	TGC	2	6	345246	345251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011593	CGC	2	6	345289	345294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_011593	GCA	3	9	345298	345306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_011593	ATTG	2	8	345350	345357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011593	TCC	2	6	345381	345386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_011593	TAG	2	6	345465	345470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011593	AATCC	2	10	345476	345485	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1097	NC_011593	ATG	2	6	345486	345491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011593	CTG	2	6	345521	345526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_011593	TTG	2	6	345587	345592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011593	TATC	2	8	345700	345707	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_011593	A	6	6	345711	345716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011593	ACA	2	6	345751	345756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_011593	A	6	6	345806	345811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011593	ATTTC	2	10	345859	345868	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1105	NC_011593	TTA	2	6	345888	345893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011593	TTG	2	6	345914	345919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011593	TAA	2	6	345960	345965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011593	AGAAA	2	10	345982	345991	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011593	GAT	2	6	346535	346540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011593	TG	3	6	346954	346959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011593	GCGG	2	8	347049	347056	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_011593	CGG	2	6	347064	347069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_011593	G	6	6	347115	347120	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011593	A	6	6	347124	347129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011593	ACT	2	6	347145	347150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_011593	A	6	6	347205	347210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011593	ATTG	2	8	347274	347281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011593	TCTTTT	2	12	347282	347293	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1119	NC_011593	GTT	2	6	347333	347338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011593	T	7	7	347337	347343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011593	GGA	2	6	347348	347353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011593	GA	4	8	347946	347953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011593	GTC	2	6	347976	347981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011593	GCT	2	6	348000	348005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_011593	GCT	2	6	348013	348018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011593	TGCCGG	2	12	348044	348055	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_011593	AGTG	2	8	348089	348096	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011593	TGC	3	9	348151	348159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_011593	GGC	2	6	348180	348185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_011593	TTG	2	6	348187	348192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011593	CGT	3	9	348240	348248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011593	CCT	2	6	348265	348270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_011593	AAG	2	6	348286	348291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011593	GATT	2	8	348710	348717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011593	TTG	2	6	350114	350119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1406	NC_011593	ATT	2	6	429822	429827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_011593	GTT	2	6	429831	429836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1499	NC_011593	TTCA	2	8	463574	463581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1500	NC_011593	TTCG	2	8	463809	463816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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