MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 8471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011593	GA	3	6	148747	148752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011593	AATG	2	8	148758	148765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011593	TGA	2	6	148809	148814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011593	TGC	2	6	149917	149922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011593	ATA	2	6	150035	150040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011593	GC	3	6	151685	151690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_011593	AGT	2	6	151695	151700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011593	CCGC	2	8	151735	151742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
509	NC_011593	TGA	2	6	151833	151838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011593	AAAG	2	8	151843	151850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011593	AGC	2	6	151851	151856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_011593	GCC	2	6	153518	153523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_011593	GGC	2	6	153524	153529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_011593	TCC	2	6	153532	153537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_011593	CGG	2	6	153541	153546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011593	AGG	2	6	153662	153667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011593	ATT	2	6	153714	153719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011593	T	7	7	153829	153835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011593	AAC	3	9	153904	153912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_011593	CGCC	2	8	153934	153941	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
521	NC_011593	TCC	2	6	155346	155351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_011593	CAG	2	6	155500	155505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_011593	AAAT	2	8	155542	155549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011593	CCT	2	6	156626	156631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_011593	TGA	2	6	156634	156639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011593	GGAG	2	8	156666	156673	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011593	CAAG	2	8	156701	156708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_011593	CCG	2	6	156712	156717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_011593	GCG	2	6	156735	156740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_011593	TAG	2	6	158672	158677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011593	TTGC	2	8	158744	158751	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
532	NC_011593	TAA	2	6	158790	158795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011593	GAT	2	6	158813	158818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011593	GCG	2	6	158821	158826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_011593	TTGG	2	8	158832	158839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011593	A	6	6	158847	158852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011593	GGT	2	6	159320	159325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011593	ACT	2	6	159492	159497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011593	GCC	2	6	160594	160599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_011593	GCG	2	6	160617	160622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_011593	GTG	2	6	160664	160669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011593	TC	3	6	160672	160677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_011593	TC	3	6	160691	160696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_011593	GA	3	6	160797	160802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011593	ACC	2	6	160806	160811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_011593	CCT	2	6	162651	162656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_011593	GGTTG	2	10	162673	162682	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011593	CTG	2	6	162700	162705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011593	TG	3	6	162704	162709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011593	TGA	3	9	162728	162736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011593	CAA	2	6	162763	162768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_011593	GGT	2	6	162789	162794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011593	GTC	3	9	163902	163910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_011593	CTTG	2	8	166215	166222	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_011593	ACG	2	6	166391	166396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_011593	TTCG	2	8	166477	166484	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_011593	CGA	2	6	166501	166506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011593	CGC	2	6	166508	166513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_011593	GCG	2	6	166588	166593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_011593	ATG	2	6	166594	166599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011593	CGA	2	6	166612	166617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011593	TTC	2	6	166635	166640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011593	CGG	2	6	166641	166646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_011593	GAC	3	9	166743	166751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_011593	GGA	2	6	166776	166781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011593	GAA	2	6	166815	166820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011593	GAA	2	6	166822	166827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011593	GTC	2	6	168937	168942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_011593	GCC	2	6	168945	168950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_011593	CGCC	2	8	168961	168968	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
571	NC_011593	CGG	2	6	168980	168985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011593	CGG	2	6	168998	169003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_011593	TGAG	2	8	169053	169060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011593	T	6	6	169072	169077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011593	GTG	2	6	169116	169121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011593	ACCG	2	8	169198	169205	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
577	NC_011593	GAA	2	6	169216	169221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011593	GAAC	2	8	169227	169234	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_011593	CG	3	6	169259	169264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_011593	CGG	2	6	169291	169296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011593	GCCG	2	8	169298	169305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_011593	CA	3	6	169331	169336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_011593	GAA	2	6	171955	171960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011593	AGG	2	6	172995	173000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011593	TGTT	2	8	173636	173643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011593	ACG	2	6	173806	173811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011593	CTC	2	6	173818	173823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_011593	TCGGC	2	10	173827	173836	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
589	NC_011593	GA	4	8	173853	173860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011593	GCA	2	6	177882	177887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_011593	GCA	2	6	178782	178787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011593	AGA	2	6	179592	179597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011593	GCT	2	6	179609	179614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011593	CA	3	6	179706	179711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_011593	TCG	2	6	180496	180501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011593	GAC	2	6	180595	180600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011593	TGT	2	6	184002	184007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011593	TGG	2	6	184052	184057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011593	CA	3	6	184185	184190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_011593	CCT	2	6	184227	184232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_011593	GCT	2	6	184928	184933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_011593	GGC	2	6	184939	184944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_011593	CGA	2	6	186604	186609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011593	AGA	2	6	186620	186625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011593	CCT	2	6	187330	187335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_011593	AAAG	2	8	187368	187375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011593	TAA	2	6	187380	187385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011593	AGGT	2	8	187504	187511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011593	TAG	2	6	187512	187517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011593	CGGC	2	8	192098	192105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_011593	TGC	2	6	192131	192136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_011593	CGC	2	6	192149	192154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_011593	CGA	2	6	192207	192212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_011593	AAG	2	6	192241	192246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011593	AAC	2	6	192265	192270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011593	ACTT	2	8	192295	192302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_011593	G	6	6	192401	192406	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011593	CG	3	6	192912	192917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_011593	AAAAGG	2	12	192940	192951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011593	GA	3	6	192981	192986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011593	GAA	3	9	192988	192996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011593	GGAT	2	8	193083	193090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011593	A	6	6	193102	193107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011593	AAC	2	6	193136	193141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011593	TTGCGT	2	12	193209	193220	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
626	NC_011593	CAAA	2	8	193232	193239	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_011593	AGA	2	6	193248	193253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011593	AAT	2	6	194050	194055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011593	GTAA	2	8	194057	194064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011593	TA	3	6	194678	194683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011593	CGA	2	6	194684	194689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011593	CTC	2	6	194695	194700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_011593	AC	3	6	195898	195903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_011593	AAC	2	6	195926	195931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_011593	TGG	2	6	195950	195955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011593	CGG	2	6	195958	195963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_011593	CGCGC	2	10	195983	195992	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
638	NC_011593	GCG	2	6	198289	198294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_011593	CG	3	6	198302	198307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_011593	GTT	2	6	198360	198365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_011593	CGC	2	6	198900	198905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_011593	AGG	2	6	198944	198949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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647	NC_011593	CG	3	6	203468	203473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
648	NC_011593	GCAC	2	8	203479	203486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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651	NC_011593	GCG	2	6	203736	203741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_011593	GCGCA	2	10	203761	203770	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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663	NC_011593	CCG	2	6	210191	210196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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666	NC_011593	GCC	2	6	210903	210908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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682	NC_011593	CCT	2	6	213953	213958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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693	NC_011593	TCC	2	6	217959	217964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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754	NC_011593	GGAA	2	8	232171	232178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
755	NC_011593	GGA	2	6	232238	232243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
756	NC_011593	TCC	2	6	232316	232321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
757	NC_011593	GC	3	6	232332	232337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
758	NC_011593	GAA	2	6	232431	232436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
759	NC_011593	CA	3	6	232513	232518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
760	NC_011593	CG	3	6	232521	232526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
761	NC_011593	ACC	2	6	232537	232542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
762	NC_011593	GC	4	8	232588	232595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
763	NC_011593	AAT	2	6	234289	234294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
764	NC_011593	A	6	6	234343	234348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
765	NC_011593	TGT	2	6	234356	234361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
766	NC_011593	T	7	7	234369	234375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
767	NC_011593	GTT	2	6	234390	234395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
768	NC_011593	CGC	2	6	236433	236438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
769	NC_011593	ATA	2	6	236454	236459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
770	NC_011593	AAT	2	6	236460	236465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
771	NC_011593	CAC	2	6	236471	236476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
772	NC_011593	CGC	2	6	237231	237236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
773	NC_011593	CTC	2	6	237296	237301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
774	NC_011593	CAGG	2	8	238615	238622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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